Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12009

Protein Details
Accession Q12009    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30DPGSKRYAYRINKEENRKELKHBasic
42-65GQKIDLPKKRYYRQRAHSNPFSDHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR025763  Trm8_euk  
IPR003358  tRNA_(Gua-N-7)_MeTrfase_Trmb  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0106143  C:tRNA (m7G46) methyltransferase complex  
GO:0043527  C:tRNA methyltransferase complex  
GO:0008176  F:tRNA (guanine-N7-)-methyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0036265  P:RNA (guanine-N7)-methylation  
GO:0106004  P:tRNA (guanine-N7)-methylation  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG sce:YDL201W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02390  Methyltransf_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51625  SAM_MT_TRMB  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MKAKPLSQDPGSKRYAYRINKEENRKELKHVKINESSLVQEGQKIDLPKKRYYRQRAHSNPFSDHQLEYPVSPQDMDWSKLYPYYKNAENGQMTKKVTIADIGCGFGGLMIDLSPAFPEDLILGMEIRVQVTNYVEDRIIALRNNTASKHGFQNINVLRGNAMKFLPNFFEKGQLSKMFFCFPDPHFKQRKHKARIITNTLLSEYAYVLKEGGVVYTITDVKDLHEWMVKHLEEHPLFERLSKEWEENDECVKIMRNATEEGKKVERKKGDKFVACFTRLPTPAIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.53
4 0.57
5 0.58
6 0.65
7 0.7
8 0.8
9 0.8
10 0.8
11 0.8
12 0.73
13 0.74
14 0.72
15 0.72
16 0.71
17 0.69
18 0.67
19 0.65
20 0.66
21 0.61
22 0.53
23 0.45
24 0.38
25 0.34
26 0.26
27 0.22
28 0.2
29 0.19
30 0.2
31 0.22
32 0.26
33 0.3
34 0.35
35 0.4
36 0.48
37 0.55
38 0.62
39 0.69
40 0.74
41 0.78
42 0.84
43 0.86
44 0.87
45 0.86
46 0.8
47 0.74
48 0.66
49 0.62
50 0.52
51 0.43
52 0.34
53 0.3
54 0.25
55 0.22
56 0.22
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.16
62 0.18
63 0.2
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.23
68 0.24
69 0.2
70 0.21
71 0.23
72 0.27
73 0.29
74 0.31
75 0.33
76 0.35
77 0.36
78 0.37
79 0.37
80 0.34
81 0.3
82 0.29
83 0.23
84 0.2
85 0.2
86 0.16
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.08
94 0.07
95 0.04
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.04
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.2
138 0.2
139 0.19
140 0.28
141 0.27
142 0.29
143 0.27
144 0.24
145 0.21
146 0.21
147 0.22
148 0.14
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.15
154 0.14
155 0.16
156 0.14
157 0.2
158 0.18
159 0.2
160 0.22
161 0.22
162 0.23
163 0.23
164 0.24
165 0.2
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.19
170 0.28
171 0.3
172 0.38
173 0.45
174 0.52
175 0.6
176 0.66
177 0.76
178 0.72
179 0.75
180 0.74
181 0.76
182 0.78
183 0.76
184 0.7
185 0.62
186 0.55
187 0.5
188 0.41
189 0.31
190 0.22
191 0.14
192 0.12
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.16
213 0.16
214 0.18
215 0.25
216 0.23
217 0.22
218 0.24
219 0.31
220 0.28
221 0.31
222 0.31
223 0.27
224 0.27
225 0.29
226 0.28
227 0.21
228 0.26
229 0.24
230 0.24
231 0.23
232 0.3
233 0.31
234 0.31
235 0.33
236 0.29
237 0.26
238 0.25
239 0.26
240 0.22
241 0.21
242 0.22
243 0.21
244 0.24
245 0.3
246 0.36
247 0.35
248 0.38
249 0.44
250 0.49
251 0.52
252 0.57
253 0.61
254 0.62
255 0.69
256 0.74
257 0.76
258 0.76
259 0.74
260 0.75
261 0.73
262 0.69
263 0.61
264 0.54
265 0.53
266 0.46