Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P32605

Protein Details
Accession P32605    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-182IKKVLKARKLKRKLRSDDICAKKFRLKRQIRRLKHKLRSRKVEEAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-177KKVLKARKLKRKLRSDDICAKKFRLKRQIRRLKHKLRSRK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0000395  P:mRNA 5'-splice site recognition  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG sce:YBR119W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MSALYFQNLPSRPANKENYTRLLLKHINPNNKYAINPSLPLPHNKLQISSQPLMLLDDQMGLLEVSISRSSKMTNQAFLTFVTQEEADRFLEKYTTTALKVQGRKVRMGKARTNSLLGLSIEMQKKKGNDETYNLDIKKVLKARKLKRKLRSDDICAKKFRLKRQIRRLKHKLRSRKVEEAEIDRIVKEFETRRLENMKSQQENLKQSQKPLKRAKVSNTMENPPNKVLLIQNLPSGTTEQLLSQILGNEALVEIRLVSVRNLAFVEYETVADATKIKNQLGSTYKLQNNDVTIGFAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.52
3 0.59
4 0.62
5 0.61
6 0.61
7 0.59
8 0.53
9 0.53
10 0.51
11 0.48
12 0.52
13 0.53
14 0.59
15 0.57
16 0.6
17 0.57
18 0.53
19 0.49
20 0.43
21 0.42
22 0.35
23 0.34
24 0.32
25 0.35
26 0.35
27 0.39
28 0.42
29 0.4
30 0.44
31 0.44
32 0.44
33 0.39
34 0.43
35 0.45
36 0.4
37 0.35
38 0.29
39 0.28
40 0.28
41 0.25
42 0.19
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.06
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.06
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.11
58 0.16
59 0.25
60 0.25
61 0.28
62 0.3
63 0.3
64 0.31
65 0.3
66 0.28
67 0.19
68 0.16
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.12
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.16
85 0.21
86 0.27
87 0.31
88 0.36
89 0.38
90 0.39
91 0.44
92 0.44
93 0.47
94 0.47
95 0.5
96 0.51
97 0.51
98 0.55
99 0.5
100 0.48
101 0.4
102 0.33
103 0.3
104 0.23
105 0.18
106 0.13
107 0.17
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.22
114 0.27
115 0.26
116 0.25
117 0.28
118 0.33
119 0.34
120 0.39
121 0.35
122 0.3
123 0.26
124 0.25
125 0.26
126 0.26
127 0.27
128 0.28
129 0.38
130 0.47
131 0.56
132 0.66
133 0.69
134 0.73
135 0.8
136 0.79
137 0.8
138 0.76
139 0.72
140 0.72
141 0.71
142 0.67
143 0.58
144 0.54
145 0.5
146 0.49
147 0.5
148 0.51
149 0.53
150 0.59
151 0.69
152 0.78
153 0.8
154 0.86
155 0.89
156 0.88
157 0.88
158 0.87
159 0.86
160 0.85
161 0.87
162 0.83
163 0.81
164 0.73
165 0.7
166 0.63
167 0.57
168 0.51
169 0.43
170 0.36
171 0.27
172 0.24
173 0.18
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.18
178 0.25
179 0.26
180 0.29
181 0.34
182 0.35
183 0.38
184 0.44
185 0.46
186 0.41
187 0.43
188 0.46
189 0.47
190 0.52
191 0.51
192 0.52
193 0.45
194 0.49
195 0.57
196 0.57
197 0.6
198 0.64
199 0.67
200 0.66
201 0.71
202 0.71
203 0.73
204 0.7
205 0.69
206 0.65
207 0.61
208 0.59
209 0.56
210 0.52
211 0.43
212 0.39
213 0.3
214 0.27
215 0.23
216 0.22
217 0.24
218 0.22
219 0.23
220 0.22
221 0.23
222 0.22
223 0.22
224 0.16
225 0.12
226 0.12
227 0.09
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.13
252 0.14
253 0.16
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.16
263 0.19
264 0.19
265 0.22
266 0.23
267 0.3
268 0.33
269 0.37
270 0.37
271 0.43
272 0.46
273 0.46
274 0.48
275 0.43
276 0.41
277 0.39
278 0.34