Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q03973

Protein Details
Accession Q03973    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-246PHDDDGSSEKKKKKKKKDKKKDKSNSSIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-241EKKKKKKKKDKKKDK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 2, mito 1, pero 1, E.R. 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0033553  C:rDNA heterochromatin  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0008301  F:DNA binding, bending  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0000400  F:four-way junction DNA binding  
GO:0044804  P:autophagy of nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0030261  P:chromosome condensation  
GO:0051276  P:chromosome organization  
GO:0006265  P:DNA topological change  
GO:2001034  P:positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0070550  P:rDNA chromatin condensation  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
GO:0006356  P:regulation of transcription by RNA polymerase I  
GO:0001174  P:transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter  
KEGG sce:YDR174W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22015  HMG-box_HMO1-like  
Amino Acid Sequences MTTDPSVKLKSAKDSLVSSLFELSKAANQTASSIVDFYNAIGDDEEEKIEAFTTLTESLQTLTSGVNHLHGISSELVNPIDDDKDAIIAAPVKAVRRKIERDPNAPKKPLTVFFAYSAYVRQELREDRQKAGLPPLSSTEITQEISKKWKELSDNEKEKWKQAYNVELENYQREKSKYLEAKKNGTLPPASLENGPTHAPVPIPFSLQHAAEPPVEKRPHDDDGSSEKKKKKKKKDKKKDKSNSSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.39
4 0.36
5 0.29
6 0.29
7 0.26
8 0.22
9 0.2
10 0.17
11 0.17
12 0.18
13 0.18
14 0.15
15 0.15
16 0.17
17 0.18
18 0.19
19 0.15
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.12
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.06
39 0.05
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.08
78 0.09
79 0.11
80 0.14
81 0.17
82 0.21
83 0.26
84 0.31
85 0.38
86 0.47
87 0.51
88 0.57
89 0.65
90 0.71
91 0.72
92 0.69
93 0.61
94 0.54
95 0.5
96 0.44
97 0.38
98 0.3
99 0.24
100 0.23
101 0.24
102 0.21
103 0.18
104 0.16
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.09
109 0.12
110 0.13
111 0.19
112 0.27
113 0.28
114 0.28
115 0.31
116 0.33
117 0.3
118 0.34
119 0.32
120 0.23
121 0.22
122 0.23
123 0.22
124 0.2
125 0.19
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.21
137 0.24
138 0.29
139 0.36
140 0.41
141 0.47
142 0.47
143 0.55
144 0.52
145 0.52
146 0.51
147 0.45
148 0.4
149 0.37
150 0.43
151 0.38
152 0.4
153 0.37
154 0.33
155 0.31
156 0.32
157 0.3
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.23
162 0.24
163 0.32
164 0.35
165 0.43
166 0.51
167 0.52
168 0.57
169 0.59
170 0.63
171 0.55
172 0.5
173 0.42
174 0.33
175 0.32
176 0.28
177 0.26
178 0.19
179 0.2
180 0.17
181 0.19
182 0.19
183 0.16
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.16
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.2
193 0.21
194 0.21
195 0.21
196 0.19
197 0.21
198 0.21
199 0.24
200 0.22
201 0.28
202 0.3
203 0.3
204 0.33
205 0.37
206 0.4
207 0.39
208 0.38
209 0.35
210 0.41
211 0.5
212 0.51
213 0.53
214 0.54
215 0.6
216 0.7
217 0.76
218 0.78
219 0.8
220 0.85
221 0.89
222 0.93
223 0.96
224 0.97
225 0.98
226 0.98