Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P54860

Protein Details
Accession P54860    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-84EYLNDCFRRNQQQKRITKNKPNAESLHHydrophilic
937-961NEELRQKILCFKKQKKEEAKHKASEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0031398  P:positive regulation of protein ubiquitination  
GO:0070936  P:protein K48-linked ubiquitination  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG sce:YDL190C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MTAIEDILQITTDPSDTRGYSLLKSEEVPQGSTLGVDFIDTLLLYQLTENEKLDKPFEYLNDCFRRNQQQKRITKNKPNAESLHSTFQEIDRLVIGYGVVALQIENFCMNGAFINYITGIVSNVNSYTDFLSQIIQRAILEGTALDLLNAVFPTLLEYCNKHVSHFDLNESVIYNNVLTIFELFVTFKPIAEIFTKIDGFFADYSCKPQDFERKTILGPILSLSPIEAAVAIRNYGDNLLRSKQQTAMIHESLQAEHKVVIDRLFFIVDKLVRGSLNSRTDMISYFAHIANKNHLRRADHPPFKELSSNGFMSNITLLLVRFSQPFLDISYKKIDKIDANYFNNPSLFIDLSGETRLNSDFKEADAFYDKNRKTADSKPNFISDCFFLTLTYLHYGLGGTLSFEEKMGSEIKALKEEIEKVKKIAANHDVFARFITAQLSKMEKALKTTESLRFALQGFFAHRSLQLEVFDFICGASTFLIRVVDPEHEFPFKQIKLPLIPDQIGVENVDNADFLRAHAPVPFKYYPEFVVEGPVNYSLYISKYQTSPIFRNPRLGSFVEFTTMVLRCPELVSNPHLKGKLVQLLSVGAMPLTDNSPGFMMDIFEHDELVNKNLLYALLDFYVIVEKTGSSSQFYDKFNSRYSISIILEELYYKIPSYKNQLIWQSQNNADFFVRFVARMLNDLTFLLDEGLSNLAEVHNIQNELDNRARGAPPTREEEDKELQTRLASASRQAKSSCGLADKSMKLFEIYSKDIPAAFVTPEIVYRLASMLNYNLESLVGPKCGELKVKDPQSYSFNPKDLLKALTTVYINLSEQSEFISAVAKDERSFNRNLFVRAVDILGRKTGLASPEFIEKLLNFANKAEEQRKADEEEDLEYGDVPDEFLDPLMYTIMKDPVILPASKMNIDRSTIKAHLLSDSTDPFNRMPLKLEDVTPNEELRQKILCFKKQKKEEAKHKASE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.15
4 0.17
5 0.2
6 0.22
7 0.23
8 0.28
9 0.28
10 0.26
11 0.27
12 0.3
13 0.32
14 0.32
15 0.31
16 0.26
17 0.25
18 0.23
19 0.22
20 0.17
21 0.11
22 0.09
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.11
34 0.14
35 0.17
36 0.18
37 0.22
38 0.25
39 0.28
40 0.29
41 0.27
42 0.26
43 0.28
44 0.3
45 0.32
46 0.31
47 0.39
48 0.45
49 0.45
50 0.46
51 0.49
52 0.56
53 0.59
54 0.67
55 0.68
56 0.7
57 0.77
58 0.85
59 0.89
60 0.89
61 0.9
62 0.89
63 0.89
64 0.86
65 0.83
66 0.76
67 0.72
68 0.69
69 0.63
70 0.62
71 0.52
72 0.47
73 0.41
74 0.38
75 0.36
76 0.29
77 0.25
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.06
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.14
119 0.15
120 0.18
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.16
125 0.15
126 0.12
127 0.11
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.14
145 0.18
146 0.26
147 0.27
148 0.25
149 0.26
150 0.3
151 0.36
152 0.36
153 0.35
154 0.29
155 0.29
156 0.29
157 0.28
158 0.23
159 0.15
160 0.14
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.15
181 0.19
182 0.2
183 0.18
184 0.18
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.18
192 0.21
193 0.21
194 0.2
195 0.25
196 0.35
197 0.36
198 0.41
199 0.42
200 0.42
201 0.41
202 0.45
203 0.41
204 0.31
205 0.25
206 0.21
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.14
226 0.16
227 0.21
228 0.22
229 0.24
230 0.26
231 0.3
232 0.32
233 0.35
234 0.4
235 0.37
236 0.36
237 0.37
238 0.34
239 0.28
240 0.28
241 0.21
242 0.15
243 0.14
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.16
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.15
252 0.13
253 0.11
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.13
261 0.15
262 0.19
263 0.22
264 0.23
265 0.23
266 0.22
267 0.23
268 0.23
269 0.23
270 0.16
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.18
275 0.19
276 0.2
277 0.26
278 0.35
279 0.35
280 0.38
281 0.39
282 0.41
283 0.44
284 0.53
285 0.55
286 0.54
287 0.54
288 0.53
289 0.52
290 0.48
291 0.46
292 0.36
293 0.31
294 0.27
295 0.26
296 0.22
297 0.21
298 0.19
299 0.17
300 0.16
301 0.11
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.11
314 0.17
315 0.17
316 0.19
317 0.26
318 0.27
319 0.27
320 0.27
321 0.27
322 0.24
323 0.3
324 0.36
325 0.37
326 0.4
327 0.43
328 0.43
329 0.41
330 0.38
331 0.32
332 0.23
333 0.17
334 0.13
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.16
353 0.17
354 0.17
355 0.27
356 0.26
357 0.28
358 0.28
359 0.29
360 0.29
361 0.38
362 0.46
363 0.43
364 0.48
365 0.46
366 0.5
367 0.48
368 0.44
369 0.37
370 0.27
371 0.23
372 0.19
373 0.17
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.09
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.07
394 0.08
395 0.07
396 0.08
397 0.11
398 0.12
399 0.14
400 0.14
401 0.13
402 0.14
403 0.18
404 0.24
405 0.26
406 0.26
407 0.25
408 0.29
409 0.3
410 0.29
411 0.31
412 0.31
413 0.27
414 0.27
415 0.3
416 0.27
417 0.25
418 0.24
419 0.2
420 0.12
421 0.1
422 0.12
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.13
427 0.12
428 0.14
429 0.17
430 0.15
431 0.17
432 0.18
433 0.17
434 0.17
435 0.21
436 0.23
437 0.24
438 0.24
439 0.22
440 0.21
441 0.21
442 0.19
443 0.16
444 0.13
445 0.11
446 0.12
447 0.13
448 0.12
449 0.11
450 0.12
451 0.13
452 0.13
453 0.12
454 0.1
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.08
472 0.09
473 0.11
474 0.12
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.19
479 0.17
480 0.18
481 0.18
482 0.19
483 0.2
484 0.23
485 0.26
486 0.22
487 0.22
488 0.2
489 0.19
490 0.18
491 0.16
492 0.13
493 0.09
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.1
506 0.12
507 0.11
508 0.18
509 0.18
510 0.17
511 0.18
512 0.19
513 0.18
514 0.19
515 0.19
516 0.13
517 0.16
518 0.15
519 0.14
520 0.14
521 0.13
522 0.1
523 0.09
524 0.09
525 0.06
526 0.08
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.14
532 0.18
533 0.21
534 0.22
535 0.29
536 0.37
537 0.37
538 0.44
539 0.43
540 0.41
541 0.41
542 0.39
543 0.32
544 0.25
545 0.24
546 0.18
547 0.17
548 0.15
549 0.14
550 0.13
551 0.11
552 0.09
553 0.09
554 0.08
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.1
559 0.14
560 0.2
561 0.22
562 0.25
563 0.24
564 0.24
565 0.24
566 0.26
567 0.28
568 0.22
569 0.21
570 0.18
571 0.18
572 0.18
573 0.16
574 0.12
575 0.05
576 0.05
577 0.04
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.07
590 0.09
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.12
595 0.11
596 0.13
597 0.13
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.1
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.07
606 0.07
607 0.06
608 0.06
609 0.09
610 0.07
611 0.07
612 0.06
613 0.06
614 0.07
615 0.09
616 0.1
617 0.09
618 0.11
619 0.15
620 0.2
621 0.22
622 0.24
623 0.27
624 0.29
625 0.3
626 0.32
627 0.29
628 0.25
629 0.26
630 0.27
631 0.23
632 0.21
633 0.19
634 0.16
635 0.15
636 0.14
637 0.13
638 0.09
639 0.08
640 0.08
641 0.1
642 0.11
643 0.14
644 0.22
645 0.27
646 0.3
647 0.35
648 0.41
649 0.42
650 0.46
651 0.48
652 0.45
653 0.42
654 0.41
655 0.36
656 0.32
657 0.28
658 0.23
659 0.19
660 0.17
661 0.14
662 0.11
663 0.11
664 0.12
665 0.12
666 0.14
667 0.15
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.12
672 0.09
673 0.09
674 0.08
675 0.06
676 0.05
677 0.06
678 0.07
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.06
684 0.06
685 0.07
686 0.08
687 0.09
688 0.09
689 0.14
690 0.15
691 0.2
692 0.22
693 0.2
694 0.19
695 0.22
696 0.22
697 0.2
698 0.25
699 0.25
700 0.26
701 0.32
702 0.34
703 0.35
704 0.37
705 0.4
706 0.41
707 0.4
708 0.39
709 0.33
710 0.31
711 0.28
712 0.26
713 0.22
714 0.19
715 0.15
716 0.2
717 0.28
718 0.29
719 0.32
720 0.31
721 0.31
722 0.29
723 0.31
724 0.27
725 0.21
726 0.21
727 0.21
728 0.27
729 0.28
730 0.28
731 0.27
732 0.25
733 0.22
734 0.21
735 0.22
736 0.22
737 0.24
738 0.24
739 0.23
740 0.24
741 0.23
742 0.23
743 0.2
744 0.15
745 0.11
746 0.1
747 0.1
748 0.1
749 0.11
750 0.11
751 0.11
752 0.09
753 0.09
754 0.1
755 0.09
756 0.09
757 0.09
758 0.1
759 0.11
760 0.12
761 0.11
762 0.11
763 0.1
764 0.1
765 0.11
766 0.11
767 0.1
768 0.1
769 0.1
770 0.13
771 0.14
772 0.19
773 0.2
774 0.23
775 0.32
776 0.39
777 0.42
778 0.41
779 0.43
780 0.46
781 0.49
782 0.52
783 0.47
784 0.43
785 0.41
786 0.41
787 0.41
788 0.37
789 0.34
790 0.26
791 0.23
792 0.22
793 0.23
794 0.22
795 0.2
796 0.18
797 0.17
798 0.16
799 0.16
800 0.16
801 0.12
802 0.12
803 0.13
804 0.12
805 0.1
806 0.1
807 0.13
808 0.11
809 0.14
810 0.17
811 0.16
812 0.16
813 0.22
814 0.27
815 0.27
816 0.3
817 0.29
818 0.35
819 0.37
820 0.39
821 0.35
822 0.32
823 0.3
824 0.27
825 0.27
826 0.23
827 0.22
828 0.21
829 0.19
830 0.19
831 0.16
832 0.17
833 0.18
834 0.18
835 0.16
836 0.17
837 0.17
838 0.23
839 0.23
840 0.22
841 0.21
842 0.18
843 0.2
844 0.23
845 0.24
846 0.19
847 0.19
848 0.24
849 0.26
850 0.33
851 0.34
852 0.36
853 0.38
854 0.42
855 0.44
856 0.43
857 0.4
858 0.37
859 0.34
860 0.3
861 0.27
862 0.22
863 0.19
864 0.16
865 0.15
866 0.12
867 0.1
868 0.08
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.07
874 0.07
875 0.08
876 0.09
877 0.08
878 0.08
879 0.11
880 0.13
881 0.13
882 0.13
883 0.13
884 0.18
885 0.22
886 0.21
887 0.2
888 0.23
889 0.26
890 0.29
891 0.3
892 0.29
893 0.29
894 0.32
895 0.34
896 0.33
897 0.36
898 0.34
899 0.35
900 0.32
901 0.31
902 0.31
903 0.29
904 0.27
905 0.25
906 0.27
907 0.28
908 0.28
909 0.3
910 0.26
911 0.32
912 0.34
913 0.3
914 0.31
915 0.31
916 0.37
917 0.36
918 0.4
919 0.4
920 0.4
921 0.44
922 0.41
923 0.39
924 0.35
925 0.37
926 0.35
927 0.31
928 0.32
929 0.29
930 0.36
931 0.44
932 0.5
933 0.56
934 0.65
935 0.72
936 0.76
937 0.86
938 0.87
939 0.89
940 0.91
941 0.91