FuNGI

P49956

Protein Details

Accession

P49956

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
268-296	KLLYGQPDKKDKKRKKKRSKLLTRPIICI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
276-287	KKDKKRKKKRSK

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR003959 ATPase_AAA_core IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0031390 C:Ctf18 RFC-like complex GO:0005739 C:mitochondrion GO:0043596 C:nuclear replication fork GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006270 P:DNA replication initiation GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination GO:0035753 P:maintenance of DNA trinucleotide repeats GO:0007064 P:mitotic sister chromatid cohesion
KEGG	sce:YMR078C -
Pfam	View protein in Pfam PF00004 AAA
CDD	cd00009 AAA cd18140 HLD_clamp_RFC

Amino Acid Sequences

MVDTAPYIGSLGRSSLFDTGDIEQAPGNNAIGINEEDIHAFVSSTGETVQLKKKPAKLATGNISLYTNPDTVWRSDDTYGININYLLDKIEASGDDRTNAQKTSPITGKIGSDTLWVEKWRPKKFLDLVGNEKTNRRMLGWLRQWTPAVFKEQLPKLPTEKEVSDMELDPLKRPPKKILLLHGPPGIGKTSVAHVIAKQSGFSVSEINASDERAGPMVKEKIYNLLFNHTFDTNPVCLVADEIDGSIESGFIRILVDIMQSDIKATNKLLYGQPDKKDKKRKKKRSKLLTRPIICICNNLYAPSLEKLKPFCEIIAVKRPSDTTLLERLNLICHKENMNIPIKAINDLIDLAQGDVRNCINNLQFLASNVDSRDSSASDKPACAKNTWASSNKDSPISWFKIVNQLFRKDPHRDIKEQFYELLNQVELNGNSDRILQGCFNIFPYVKYSDNGIRKPANISDWLFFHDLMYQSMYAHNGELLRYSALVPLVFFQTFGDIANKDDIRMKNSEYEQRELKRANSDIVSLIMRHISVQSPLMASFTDRKSLIFEILPYLDSMISSDFNKIRNLKLKQAIMEELVQLLKSFQLNLIQNRSEGFDVRGGLTIDPPIDEVVLLNPKHINEVQHKRANNLSSLLAKIEENRAKKRHIDQVTEDRLQSQEMHSKKVKTGLNSSSSTIDFFKNQYGLLKQTQELEETQKTIGSDETNQADDCNQTVKIWVKYNEGFSNAVRKNVTWNNLWE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.16
4	0.15
5	0.17
6	0.17
7	0.2
8	0.19
9	0.18
10	0.16
11	0.16
12	0.18
13	0.16
14	0.15
15	0.12
16	0.12
17	0.12
18	0.13
19	0.14
20	0.13
21	0.12
22	0.12
23	0.12
24	0.12
25	0.12
26	0.1
27	0.09
28	0.07
29	0.08
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.1
34	0.11
35	0.17
36	0.24
37	0.28
38	0.35
39	0.41
40	0.48
41	0.54
42	0.58
43	0.62
44	0.62
45	0.65
46	0.66
47	0.67
48	0.61
49	0.53
50	0.49
51	0.39
52	0.35
53	0.29
54	0.22
55	0.15
56	0.18
57	0.2
58	0.2
59	0.24
60	0.23
61	0.23
62	0.24
63	0.26
64	0.24
65	0.25
66	0.26
67	0.23
68	0.21
69	0.17
70	0.17
71	0.16
72	0.14
73	0.11
74	0.09
75	0.09
76	0.08
77	0.1
78	0.1
79	0.11
80	0.16
81	0.16
82	0.16
83	0.19
84	0.22
85	0.23
86	0.23
87	0.21
88	0.21
89	0.22
90	0.29
91	0.32
92	0.31
93	0.3
94	0.31
95	0.32
96	0.3
97	0.29
98	0.21
99	0.19
100	0.17
101	0.18
102	0.19
103	0.19
104	0.21
105	0.26
106	0.35
107	0.4
108	0.43
109	0.42
110	0.49
111	0.53
112	0.58
113	0.62
114	0.6
115	0.6
116	0.62
117	0.65
118	0.57
119	0.55
120	0.49
121	0.43
122	0.37
123	0.3
124	0.31
125	0.31
126	0.4
127	0.46
128	0.5
129	0.49
130	0.51
131	0.51
132	0.44
133	0.44
134	0.36
135	0.34
136	0.29
137	0.29
138	0.35
139	0.37
140	0.42
141	0.39
142	0.4
143	0.38
144	0.39
145	0.39
146	0.35
147	0.32
148	0.3
149	0.28
150	0.27
151	0.26
152	0.23
153	0.22
154	0.22
155	0.22
156	0.2
157	0.25
158	0.31
159	0.32
160	0.34
161	0.39
162	0.44
163	0.51
164	0.55
165	0.57
166	0.6
167	0.61
168	0.63
169	0.58
170	0.49
171	0.41
172	0.37
173	0.29
174	0.19
175	0.14
176	0.11
177	0.11
178	0.13
179	0.14
180	0.13
181	0.13
182	0.16
183	0.19
184	0.18
185	0.16
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.14
190	0.12
191	0.09
192	0.12
193	0.13
194	0.15
195	0.14
196	0.14
197	0.14
198	0.13
199	0.14
200	0.11
201	0.11
202	0.09
203	0.14
204	0.17
205	0.17
206	0.18
207	0.17
208	0.24
209	0.26
210	0.29
211	0.24
212	0.28
213	0.28
214	0.27
215	0.29
216	0.22
217	0.2
218	0.18
219	0.21
220	0.14
221	0.13
222	0.12
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.06
233	0.05
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.05
244	0.04
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.11
254	0.12
255	0.14
256	0.16
257	0.2
258	0.27
259	0.32
260	0.37
261	0.44
262	0.5
263	0.57
264	0.66
265	0.7
266	0.74
267	0.8
268	0.87
269	0.88
270	0.93
271	0.94
272	0.95
273	0.96
274	0.95
275	0.95
276	0.94
277	0.85
278	0.78
279	0.71
280	0.64
281	0.53
282	0.44
283	0.35
284	0.29
285	0.26
286	0.22
287	0.2
288	0.15
289	0.17
290	0.16
291	0.19
292	0.16
293	0.18
294	0.19
295	0.19
296	0.2
297	0.19
298	0.17
299	0.17
300	0.18
301	0.2
302	0.28
303	0.29
304	0.27
305	0.28
306	0.28
307	0.24
308	0.25
309	0.22
310	0.16
311	0.21
312	0.22
313	0.21
314	0.21
315	0.2
316	0.21
317	0.21
318	0.2
319	0.15
320	0.16
321	0.17
322	0.19
323	0.2
324	0.23
325	0.27
326	0.24
327	0.23
328	0.24
329	0.23
330	0.22
331	0.2
332	0.15
333	0.1
334	0.1
335	0.09
336	0.07
337	0.06
338	0.05
339	0.06
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.1
347	0.09
348	0.1
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.13
354	0.11
355	0.11
356	0.1
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.08
362	0.11
363	0.11
364	0.14
365	0.14
366	0.15
367	0.17
368	0.22
369	0.22
370	0.2
371	0.21
372	0.22
373	0.26
374	0.3
375	0.31
376	0.3
377	0.33
378	0.36
379	0.35
380	0.33
381	0.28
382	0.28
383	0.29
384	0.29
385	0.26
386	0.22
387	0.22
388	0.29
389	0.31
390	0.34
391	0.32
392	0.31
393	0.32
394	0.35
395	0.39
396	0.35
397	0.41
398	0.44
399	0.44
400	0.47
401	0.48
402	0.53
403	0.52
404	0.48
405	0.42
406	0.33
407	0.3
408	0.26
409	0.23
410	0.15
411	0.11
412	0.1
413	0.12
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.1
418	0.1
419	0.11
420	0.1
421	0.08
422	0.1
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.1
431	0.13
432	0.16
433	0.16
434	0.16
435	0.18
436	0.23
437	0.29
438	0.3
439	0.31
440	0.3
441	0.29
442	0.32
443	0.3
444	0.25
445	0.23
446	0.23
447	0.2
448	0.19
449	0.22
450	0.2
451	0.18
452	0.16
453	0.15
454	0.14
455	0.13
456	0.13
457	0.11
458	0.1
459	0.11
460	0.12
461	0.09
462	0.08
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.1
477	0.09
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.1
484	0.08
485	0.1
486	0.15
487	0.15
488	0.14
489	0.21
490	0.21
491	0.23
492	0.24
493	0.25
494	0.26
495	0.3
496	0.37
497	0.34
498	0.37
499	0.4
500	0.41
501	0.45
502	0.41
503	0.4
504	0.38
505	0.36
506	0.35
507	0.29
508	0.27
509	0.22
510	0.22
511	0.2
512	0.14
513	0.13
514	0.11
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.11
527	0.15
528	0.15
529	0.18
530	0.18
531	0.18
532	0.21
533	0.22
534	0.22
535	0.17
536	0.16
537	0.16
538	0.16
539	0.16
540	0.13
541	0.12
542	0.1
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.13
549	0.15
550	0.17
551	0.23
552	0.24
553	0.29
554	0.37
555	0.4
556	0.44
557	0.5
558	0.51
559	0.49
560	0.5
561	0.45
562	0.38
563	0.35
564	0.27
565	0.21
566	0.17
567	0.14
568	0.11
569	0.09
570	0.09
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.15
575	0.2
576	0.25
577	0.31
578	0.3
579	0.3
580	0.3
581	0.31
582	0.26
583	0.22
584	0.19
585	0.16
586	0.16
587	0.17
588	0.19
589	0.17
590	0.16
591	0.16
592	0.15
593	0.13
594	0.12
595	0.11
596	0.09
597	0.08
598	0.08
599	0.07
600	0.09
601	0.16
602	0.16
603	0.17
604	0.18
605	0.18
606	0.23
607	0.25
608	0.27
609	0.3
610	0.4
611	0.48
612	0.53
613	0.54
614	0.53
615	0.57
616	0.54
617	0.47
618	0.39
619	0.33
620	0.29
621	0.29
622	0.27
623	0.22
624	0.19
625	0.19
626	0.26
627	0.3
628	0.33
629	0.41
630	0.45
631	0.48
632	0.55
633	0.59
634	0.6
635	0.61
636	0.61
637	0.61
638	0.68
639	0.71
640	0.67
641	0.6
642	0.51
643	0.44
644	0.39
645	0.32
646	0.26
647	0.26
648	0.25
649	0.32
650	0.36
651	0.38
652	0.4
653	0.46
654	0.46
655	0.44
656	0.5
657	0.5
658	0.51
659	0.5
660	0.49
661	0.45
662	0.41
663	0.37
664	0.31
665	0.26
666	0.22
667	0.22
668	0.24
669	0.22
670	0.22
671	0.25
672	0.26
673	0.29
674	0.32
675	0.34
676	0.3
677	0.35
678	0.35
679	0.33
680	0.32
681	0.33
682	0.31
683	0.29
684	0.28
685	0.25
686	0.24
687	0.22
688	0.22
689	0.19
690	0.19
691	0.23
692	0.25
693	0.25
694	0.25
695	0.25
696	0.24
697	0.22
698	0.2
699	0.18
700	0.15
701	0.13
702	0.19
703	0.25
704	0.29
705	0.36
706	0.38
707	0.42
708	0.46
709	0.52
710	0.5
711	0.47
712	0.44
713	0.38
714	0.45
715	0.4
716	0.41
717	0.35
718	0.32
719	0.38
720	0.43
721	0.46

P49956

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer