Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P43124

Protein Details
Accession P43124    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-41TEPDSSGETRKQKKSRSDEKSSSSKDHydrophilic
357-380HTDSRSKEIERQRRRAAHQNHIIFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027786  Nse4/EID  
IPR014854  Nse4_C  
IPR029225  Nse4_Nse3-bd  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
GO:0032204  P:regulation of telomere maintenance  
KEGG sce:YDL105W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15412  Nse4-Nse3_bdg  
PF08743  Nse4_C  
Amino Acid Sequences MSSTVISRKRRNSTVTEPDSSGETRKQKKSRSDEKSSSSKDGDPQLEFKVLQGYRDLESEMHKGRAQVTRTGDIGVAMDNLNAVDSLFNKVIGIKNNGLFAHDARAMVSISELAQISVRNLKFDDSRSMVNLENIVNSLKRYMLKEHFKLNNIAENRNDLTLAADEQSAADQQEESDGDIDRTPDDNHTDKATSSFKATSMRHSYLQQFSHYNEFSQFNWFRIGALYNTISKNAPITDHLMGPLSIEKKPRVLTQRRRNNDQVGEKITAEKITQHSLNSTQQETTPEQVKKCFKKLSKKLGPEGSINLFKFIIDPNSFSRSIENLFYTSFLIKEGKLLMEHDEEGLPTIKIKQSISHTDSRSKEIERQRRRAAHQNHIIFQMDMPTWRKLIKKYNITSPFLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.73
3 0.68
4 0.61
5 0.55
6 0.52
7 0.46
8 0.4
9 0.37
10 0.39
11 0.44
12 0.53
13 0.6
14 0.65
15 0.74
16 0.8
17 0.83
18 0.83
19 0.84
20 0.83
21 0.82
22 0.83
23 0.79
24 0.74
25 0.67
26 0.6
27 0.55
28 0.55
29 0.52
30 0.44
31 0.42
32 0.39
33 0.38
34 0.35
35 0.3
36 0.31
37 0.27
38 0.25
39 0.25
40 0.25
41 0.23
42 0.24
43 0.24
44 0.17
45 0.2
46 0.25
47 0.25
48 0.26
49 0.26
50 0.26
51 0.31
52 0.36
53 0.35
54 0.36
55 0.37
56 0.37
57 0.37
58 0.36
59 0.31
60 0.24
61 0.22
62 0.16
63 0.12
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.12
78 0.16
79 0.2
80 0.24
81 0.23
82 0.25
83 0.28
84 0.28
85 0.27
86 0.25
87 0.21
88 0.2
89 0.18
90 0.17
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.12
95 0.12
96 0.08
97 0.06
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.18
109 0.2
110 0.22
111 0.27
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.25
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.12
128 0.14
129 0.2
130 0.27
131 0.35
132 0.37
133 0.45
134 0.47
135 0.47
136 0.49
137 0.44
138 0.43
139 0.37
140 0.37
141 0.29
142 0.28
143 0.27
144 0.23
145 0.21
146 0.14
147 0.13
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.18
179 0.19
180 0.15
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.21
185 0.21
186 0.24
187 0.28
188 0.3
189 0.29
190 0.31
191 0.34
192 0.33
193 0.33
194 0.29
195 0.25
196 0.24
197 0.28
198 0.25
199 0.22
200 0.19
201 0.2
202 0.18
203 0.24
204 0.23
205 0.19
206 0.21
207 0.2
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.1
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.14
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.09
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.12
232 0.13
233 0.16
234 0.16
235 0.19
236 0.21
237 0.26
238 0.33
239 0.41
240 0.5
241 0.58
242 0.68
243 0.71
244 0.76
245 0.76
246 0.73
247 0.7
248 0.66
249 0.6
250 0.54
251 0.5
252 0.43
253 0.39
254 0.33
255 0.26
256 0.19
257 0.18
258 0.16
259 0.18
260 0.19
261 0.17
262 0.19
263 0.22
264 0.27
265 0.27
266 0.26
267 0.23
268 0.23
269 0.27
270 0.27
271 0.26
272 0.28
273 0.29
274 0.29
275 0.36
276 0.44
277 0.46
278 0.51
279 0.57
280 0.57
281 0.64
282 0.73
283 0.77
284 0.77
285 0.79
286 0.79
287 0.78
288 0.73
289 0.64
290 0.59
291 0.53
292 0.49
293 0.42
294 0.36
295 0.28
296 0.25
297 0.23
298 0.21
299 0.21
300 0.16
301 0.19
302 0.21
303 0.26
304 0.27
305 0.26
306 0.26
307 0.23
308 0.24
309 0.24
310 0.21
311 0.18
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.16
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.17
326 0.18
327 0.19
328 0.18
329 0.17
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.13
334 0.11
335 0.14
336 0.15
337 0.18
338 0.19
339 0.23
340 0.28
341 0.38
342 0.43
343 0.47
344 0.49
345 0.54
346 0.56
347 0.55
348 0.53
349 0.47
350 0.5
351 0.53
352 0.6
353 0.62
354 0.69
355 0.74
356 0.78
357 0.81
358 0.83
359 0.81
360 0.81
361 0.8
362 0.78
363 0.71
364 0.66
365 0.61
366 0.51
367 0.43
368 0.37
369 0.28
370 0.26
371 0.26
372 0.25
373 0.25
374 0.29
375 0.34
376 0.37
377 0.46
378 0.51
379 0.58
380 0.62
381 0.71
382 0.75