Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P39943

Protein Details
Accession P39943    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-49EICSRGFHRLEHKKRHGRTHTGEKPHKCTVBasic
62-89LKRHLRTHTKGVQRRRIKSKGSRKTVVNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-85LRTHTKGVQRRRIKSKGSRK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001227  F:DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0000433  P:carbon catabolite repression of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose  
GO:0034644  P:cellular response to UV  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0000430  P:regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose  
GO:0045471  P:response to ethanol  
KEGG sce:YER028C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MNYLRDRFPPDNDQRPFRCEICSRGFHRLEHKKRHGRTHTGEKPHKCTVQGCPKSFSRSDELKRHLRTHTKGVQRRRIKSKGSRKTVVNTATAAPTTFNENTGVSLTGIGQSKVPPILISVAQNCDDVNIRNTGNNNGIVETQAPAILVPVINIPNDPHPIPSSLSTTSITSIASVYPSTSPFQYLKSGFPEDPASTPYVHSSGSSLALGELSSNSSIFSKSRRNLAAMSGPDSLSSSKNQSSASLLSQTSHPSKSFSRPPTDLSPLRRIMPSVNTGDMEISRTVSVSSSSSSLTSVTYDDTAAKDMGMGIFFDRPPVTQKACRSNHKYKVNAVSRGRQHERAQFHISGDDEDSNVHRQESRASNTSPNVSLPPIKSILRQIDNFNSAPSYFSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.67
3 0.66
4 0.57
5 0.55
6 0.49
7 0.5
8 0.49
9 0.53
10 0.53
11 0.58
12 0.59
13 0.56
14 0.63
15 0.67
16 0.68
17 0.71
18 0.78
19 0.78
20 0.82
21 0.88
22 0.87
23 0.86
24 0.84
25 0.85
26 0.83
27 0.84
28 0.86
29 0.83
30 0.81
31 0.78
32 0.73
33 0.65
34 0.59
35 0.59
36 0.61
37 0.63
38 0.59
39 0.56
40 0.57
41 0.6
42 0.58
43 0.52
44 0.49
45 0.49
46 0.54
47 0.58
48 0.61
49 0.64
50 0.67
51 0.67
52 0.68
53 0.68
54 0.64
55 0.65
56 0.66
57 0.68
58 0.7
59 0.75
60 0.78
61 0.78
62 0.82
63 0.82
64 0.82
65 0.81
66 0.83
67 0.84
68 0.84
69 0.84
70 0.81
71 0.75
72 0.73
73 0.71
74 0.65
75 0.55
76 0.47
77 0.39
78 0.34
79 0.3
80 0.25
81 0.17
82 0.14
83 0.18
84 0.16
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.16
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.15
119 0.17
120 0.18
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.11
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.15
152 0.17
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.12
158 0.09
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.2
175 0.23
176 0.2
177 0.21
178 0.22
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.15
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.11
207 0.18
208 0.2
209 0.26
210 0.27
211 0.28
212 0.29
213 0.31
214 0.32
215 0.26
216 0.27
217 0.22
218 0.21
219 0.19
220 0.19
221 0.17
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.16
234 0.15
235 0.16
236 0.19
237 0.2
238 0.2
239 0.19
240 0.19
241 0.22
242 0.28
243 0.36
244 0.37
245 0.41
246 0.41
247 0.45
248 0.47
249 0.52
250 0.5
251 0.47
252 0.49
253 0.44
254 0.45
255 0.4
256 0.36
257 0.31
258 0.3
259 0.28
260 0.24
261 0.23
262 0.21
263 0.21
264 0.21
265 0.18
266 0.17
267 0.12
268 0.11
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.09
299 0.09
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.16
304 0.22
305 0.26
306 0.3
307 0.38
308 0.46
309 0.53
310 0.63
311 0.67
312 0.72
313 0.76
314 0.79
315 0.76
316 0.73
317 0.77
318 0.75
319 0.75
320 0.7
321 0.69
322 0.68
323 0.73
324 0.71
325 0.67
326 0.65
327 0.64
328 0.64
329 0.62
330 0.61
331 0.53
332 0.48
333 0.44
334 0.39
335 0.33
336 0.3
337 0.24
338 0.18
339 0.18
340 0.19
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.18
345 0.18
346 0.26
347 0.32
348 0.36
349 0.38
350 0.4
351 0.45
352 0.47
353 0.51
354 0.44
355 0.39
356 0.34
357 0.33
358 0.36
359 0.31
360 0.32
361 0.32
362 0.32
363 0.33
364 0.38
365 0.44
366 0.44
367 0.46
368 0.47
369 0.51
370 0.54
371 0.51
372 0.45
373 0.38
374 0.31