Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P32524

Protein Details
Accession P32524    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-280QGKQKGGDSKGKKRKIRAVGETRLKKSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-280QKGGDSKGKKRKIRAVGETRLKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:1903241  P:U2-type prespliceosome assembly  
KEGG sce:YJL203W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MEPEDTQLKEDIKTTVNYIKQHGVEFENKLLEDERFSFIKKDDPLHEYYTKLMNEPTDTVSGEDNDRKSEREIARPPDFLFSQYDTGISRRDMEVIKLTARYYAKDKSIVEQMISKDGEARLNFMNSSHPLHKTFTDFVAQYKRVYSFTGQEIKKSKRTILDNCFERTQYWEFEKDKDREHDKLVELCKIQFAAIPWDKFTQVAKFSIPEDTEIFEGSLDLEQMRLRRVQTGIKLFDSIKPTNEEEKIVSDQGKQKGGDSKGKKRKIRAVGETRLKKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.33
4 0.34
5 0.37
6 0.4
7 0.39
8 0.39
9 0.38
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.34
14 0.3
15 0.29
16 0.28
17 0.27
18 0.23
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.2
23 0.21
24 0.22
25 0.22
26 0.28
27 0.28
28 0.3
29 0.32
30 0.35
31 0.38
32 0.42
33 0.42
34 0.36
35 0.36
36 0.36
37 0.32
38 0.28
39 0.26
40 0.21
41 0.22
42 0.22
43 0.22
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.21
51 0.19
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.24
56 0.32
57 0.32
58 0.36
59 0.43
60 0.46
61 0.5
62 0.5
63 0.48
64 0.44
65 0.41
66 0.33
67 0.29
68 0.24
69 0.21
70 0.19
71 0.19
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.18
82 0.18
83 0.19
84 0.18
85 0.18
86 0.2
87 0.2
88 0.2
89 0.2
90 0.22
91 0.23
92 0.26
93 0.26
94 0.24
95 0.29
96 0.28
97 0.25
98 0.25
99 0.23
100 0.23
101 0.23
102 0.19
103 0.16
104 0.16
105 0.19
106 0.15
107 0.17
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.12
112 0.14
113 0.13
114 0.16
115 0.16
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.21
120 0.22
121 0.21
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.17
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.14
135 0.18
136 0.26
137 0.24
138 0.28
139 0.34
140 0.36
141 0.41
142 0.4
143 0.38
144 0.36
145 0.42
146 0.46
147 0.46
148 0.5
149 0.48
150 0.5
151 0.48
152 0.42
153 0.36
154 0.32
155 0.27
156 0.23
157 0.22
158 0.25
159 0.25
160 0.29
161 0.36
162 0.34
163 0.37
164 0.4
165 0.43
166 0.39
167 0.41
168 0.41
169 0.36
170 0.4
171 0.37
172 0.34
173 0.3
174 0.28
175 0.25
176 0.21
177 0.18
178 0.14
179 0.13
180 0.18
181 0.22
182 0.22
183 0.23
184 0.24
185 0.25
186 0.24
187 0.25
188 0.21
189 0.18
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.22
195 0.2
196 0.18
197 0.17
198 0.16
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.1
203 0.1
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.09
211 0.11
212 0.13
213 0.14
214 0.18
215 0.2
216 0.26
217 0.32
218 0.39
219 0.4
220 0.39
221 0.41
222 0.38
223 0.4
224 0.41
225 0.34
226 0.3
227 0.3
228 0.32
229 0.36
230 0.36
231 0.34
232 0.29
233 0.32
234 0.32
235 0.31
236 0.29
237 0.28
238 0.34
239 0.37
240 0.41
241 0.37
242 0.37
243 0.43
244 0.47
245 0.51
246 0.53
247 0.59
248 0.64
249 0.74
250 0.77
251 0.78
252 0.82
253 0.82
254 0.83
255 0.83
256 0.83
257 0.83
258 0.87
259 0.87
260 0.84