Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q06349

Protein Details
Accession Q06349    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-70TSDSSSSRKPSQQRDNYRKRRPKLICIPYTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_mito 2, mito 1.5, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013961  RAI1  
IPR039039  RAI1-like_fam  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0034353  F:mRNA 5'-diphosphatase activity  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0110155  P:NAD-cap decapping  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0090305  P:nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis  
KEGG sce:YDR370C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08652  RAI1  
Amino Acid Sequences MSTEQDAVLGLAKDLEGINLLTVPNLERGHQSKLCKEKTTSDSSSSRKPSQQRDNYRKRRPKLICIPYTSFLHTGMHNFLTKPPRDIFHESKEVALFTNGRAYTILRKDLIPNLKESIAELYESSLLEAKKRKVPYLGHDLFANIDEFVPMTISELDSVSPCFSYIENWILDNPGKDFKIGKKFTVVTTRHHIVDLTMHLFNRRNRQTSLIVTYMGAGLLSFCRNVKKDSQMSKEGIYSNDPNMKKICYSGFEFENWVTENSKVADLTGSKCPIFSLVESKLSEEIGLLIRCEMDAFNPVSETNTELKCFAPLSMHNSNHRRKLLKTWVQTGLLPNSDIMIGLRDSHSGQLLDIQWYSRDLLCKKFNHPGLPTNKKELNYNAQIAVEWCHYCIEAICKLVEANISDYSSTKPESFEIGIDTNNAIVITKLKTTPRNVELFGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.22
15 0.25
16 0.33
17 0.38
18 0.42
19 0.45
20 0.54
21 0.59
22 0.59
23 0.59
24 0.6
25 0.61
26 0.65
27 0.6
28 0.57
29 0.59
30 0.57
31 0.63
32 0.61
33 0.6
34 0.59
35 0.64
36 0.67
37 0.7
38 0.76
39 0.78
40 0.82
41 0.88
42 0.91
43 0.94
44 0.94
45 0.89
46 0.89
47 0.85
48 0.85
49 0.84
50 0.84
51 0.8
52 0.78
53 0.77
54 0.7
55 0.66
56 0.58
57 0.48
58 0.38
59 0.32
60 0.26
61 0.23
62 0.22
63 0.22
64 0.2
65 0.2
66 0.25
67 0.32
68 0.32
69 0.34
70 0.33
71 0.34
72 0.39
73 0.47
74 0.47
75 0.46
76 0.51
77 0.47
78 0.47
79 0.44
80 0.38
81 0.3
82 0.26
83 0.2
84 0.13
85 0.2
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.23
91 0.27
92 0.3
93 0.24
94 0.25
95 0.28
96 0.35
97 0.41
98 0.34
99 0.33
100 0.32
101 0.31
102 0.3
103 0.28
104 0.24
105 0.16
106 0.15
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.15
115 0.21
116 0.23
117 0.29
118 0.31
119 0.33
120 0.36
121 0.4
122 0.43
123 0.48
124 0.46
125 0.4
126 0.38
127 0.36
128 0.3
129 0.27
130 0.2
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.1
153 0.13
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.14
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.16
165 0.2
166 0.3
167 0.31
168 0.3
169 0.31
170 0.33
171 0.35
172 0.42
173 0.37
174 0.31
175 0.37
176 0.38
177 0.34
178 0.33
179 0.3
180 0.2
181 0.21
182 0.19
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.15
187 0.2
188 0.23
189 0.3
190 0.33
191 0.33
192 0.33
193 0.38
194 0.39
195 0.37
196 0.38
197 0.29
198 0.25
199 0.21
200 0.21
201 0.16
202 0.12
203 0.09
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.08
211 0.09
212 0.12
213 0.15
214 0.22
215 0.29
216 0.36
217 0.41
218 0.43
219 0.43
220 0.42
221 0.41
222 0.35
223 0.29
224 0.25
225 0.21
226 0.19
227 0.25
228 0.24
229 0.23
230 0.23
231 0.23
232 0.2
233 0.2
234 0.19
235 0.14
236 0.17
237 0.19
238 0.19
239 0.18
240 0.2
241 0.18
242 0.18
243 0.16
244 0.14
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.13
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.2
266 0.2
267 0.21
268 0.2
269 0.19
270 0.18
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.07
281 0.05
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.16
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.2
301 0.27
302 0.31
303 0.38
304 0.46
305 0.52
306 0.56
307 0.6
308 0.56
309 0.5
310 0.57
311 0.6
312 0.6
313 0.6
314 0.59
315 0.58
316 0.56
317 0.56
318 0.5
319 0.43
320 0.34
321 0.29
322 0.22
323 0.18
324 0.16
325 0.14
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.15
338 0.15
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.14
343 0.16
344 0.18
345 0.15
346 0.2
347 0.21
348 0.28
349 0.35
350 0.39
351 0.43
352 0.5
353 0.53
354 0.54
355 0.55
356 0.56
357 0.59
358 0.65
359 0.64
360 0.63
361 0.62
362 0.56
363 0.57
364 0.55
365 0.53
366 0.5
367 0.49
368 0.42
369 0.38
370 0.37
371 0.33
372 0.29
373 0.24
374 0.18
375 0.15
376 0.15
377 0.14
378 0.14
379 0.15
380 0.17
381 0.17
382 0.18
383 0.17
384 0.17
385 0.17
386 0.18
387 0.19
388 0.15
389 0.16
390 0.17
391 0.18
392 0.18
393 0.19
394 0.2
395 0.2
396 0.21
397 0.19
398 0.18
399 0.18
400 0.23
401 0.23
402 0.21
403 0.22
404 0.21
405 0.21
406 0.21
407 0.2
408 0.15
409 0.14
410 0.13
411 0.09
412 0.08
413 0.11
414 0.12
415 0.15
416 0.2
417 0.26
418 0.33
419 0.4
420 0.48
421 0.52
422 0.55