Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40072

Protein Details
Accession P40072    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
255-274LKDVRLIILRKKQVKKKVKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-274RKKQVKKKVKS
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047134  RNF4-like  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000776  C:kinetochore  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0033768  C:SUMO-targeted ubiquitin ligase complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG sce:YER116C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00097  zf-C3HC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd23142  RING-HC_CHR27-like  
Amino Acid Sequences MARRPDNQNPEGENLRIKRVRLESVRQNDEEEENEVSRTQNIVTDNRHDSPEAVVEIIGERALENTSEEDGDDDLSLFRALEEDPGSDHNTSNNDSGNHDRETMHTEEPEASSGNNITLTNNVEELHTMDVLSQTANTPSASPMLDAAPPTTKPGTNSKEQTVDLTADAIDLDAEEQQVLQISDDDFQEETKEAPKEYGAAKDYRCPICFEPPETALMTLCGHVFCCPCLFQMVNSSRTCRQFGHCALCRSKVYLKDVRLIILRKKQVKKKVKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.44
4 0.41
5 0.43
6 0.44
7 0.51
8 0.5
9 0.56
10 0.57
11 0.63
12 0.69
13 0.62
14 0.6
15 0.53
16 0.48
17 0.41
18 0.34
19 0.28
20 0.22
21 0.21
22 0.2
23 0.18
24 0.16
25 0.15
26 0.13
27 0.13
28 0.16
29 0.2
30 0.23
31 0.29
32 0.34
33 0.34
34 0.36
35 0.33
36 0.3
37 0.27
38 0.26
39 0.21
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.15
78 0.17
79 0.17
80 0.17
81 0.16
82 0.18
83 0.23
84 0.24
85 0.23
86 0.22
87 0.21
88 0.2
89 0.24
90 0.24
91 0.2
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.17
96 0.16
97 0.12
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.13
141 0.22
142 0.24
143 0.29
144 0.32
145 0.32
146 0.34
147 0.34
148 0.33
149 0.26
150 0.23
151 0.17
152 0.14
153 0.11
154 0.08
155 0.08
156 0.06
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.16
185 0.2
186 0.18
187 0.21
188 0.22
189 0.27
190 0.34
191 0.36
192 0.35
193 0.35
194 0.35
195 0.41
196 0.43
197 0.4
198 0.37
199 0.34
200 0.36
201 0.32
202 0.29
203 0.2
204 0.18
205 0.16
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.24
220 0.29
221 0.33
222 0.34
223 0.38
224 0.4
225 0.43
226 0.45
227 0.38
228 0.38
229 0.41
230 0.46
231 0.52
232 0.53
233 0.56
234 0.57
235 0.6
236 0.57
237 0.53
238 0.53
239 0.49
240 0.5
241 0.5
242 0.5
243 0.51
244 0.51
245 0.49
246 0.49
247 0.48
248 0.49
249 0.51
250 0.57
251 0.59
252 0.68
253 0.73
254 0.78