Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P39933

Protein Details
Accession P39933    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-337QDEEKISNRLRKRRKLTENNNVEFLHydrophilic
369-395YNNCSRTFKTKEKYEKHIDKHKVHELKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 16
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0001010  F:RNA polymerase II sequence-specific DNA-binding transcription factor recruiting activity  
GO:0001002  F:RNA polymerase III type 1 promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0042791  P:5S class rRNA transcription by RNA polymerase III  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG sce:YPR186C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PF13894  zf-C2H2_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MGGEVLNNEGMPLAELKQETIPISRSESSESLNSLTSTRSSSSNRPKTYFCDYDGCDKAFTRPSILTEHQLSVHQGLRAFQCDKCAKSFVKKSHLERHLYTHSDTKPFQCSYCGKGVTTRQQLKRHEVTHTKSFICPEEGCNLRFYKHPQLRAHILSVHLHKLTCPHCNKSFQRPYRLRNHISKHHDPEVENPYQCTFAGCCKEFRIWSQLQSHIKNDHPKLKCPICSKPCVGENGLQMHMIIHDDSLVTKNWKCHICPDMSFSRKHDLLTHYGSIHTEEDIPLELKYKISDIQQLVQDHGVQLGNSKHSNEQDEEKISNRLRKRRKLTENNNVEFLQNEVDLEKRLESGENGLNLLLNTVGRKYRCFYNNCSRTFKTKEKYEKHIDKHKVHELKLKILQEKEENKTLVDQNHKEPFIIQKETQSAGDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.16
5 0.18
6 0.19
7 0.21
8 0.22
9 0.2
10 0.26
11 0.27
12 0.27
13 0.3
14 0.3
15 0.29
16 0.29
17 0.29
18 0.25
19 0.24
20 0.23
21 0.19
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.21
27 0.25
28 0.34
29 0.45
30 0.53
31 0.58
32 0.59
33 0.61
34 0.61
35 0.65
36 0.59
37 0.52
38 0.49
39 0.45
40 0.51
41 0.52
42 0.48
43 0.4
44 0.37
45 0.38
46 0.37
47 0.35
48 0.31
49 0.27
50 0.28
51 0.34
52 0.35
53 0.36
54 0.32
55 0.33
56 0.3
57 0.3
58 0.29
59 0.25
60 0.26
61 0.22
62 0.2
63 0.21
64 0.23
65 0.26
66 0.27
67 0.24
68 0.3
69 0.33
70 0.34
71 0.35
72 0.38
73 0.36
74 0.44
75 0.52
76 0.51
77 0.56
78 0.61
79 0.65
80 0.7
81 0.74
82 0.7
83 0.64
84 0.64
85 0.61
86 0.56
87 0.5
88 0.48
89 0.44
90 0.44
91 0.43
92 0.39
93 0.39
94 0.37
95 0.35
96 0.34
97 0.33
98 0.32
99 0.38
100 0.36
101 0.3
102 0.34
103 0.41
104 0.44
105 0.51
106 0.55
107 0.55
108 0.62
109 0.67
110 0.69
111 0.7
112 0.63
113 0.61
114 0.6
115 0.58
116 0.59
117 0.58
118 0.51
119 0.45
120 0.45
121 0.38
122 0.34
123 0.29
124 0.23
125 0.25
126 0.27
127 0.26
128 0.27
129 0.25
130 0.22
131 0.24
132 0.28
133 0.32
134 0.35
135 0.42
136 0.43
137 0.48
138 0.53
139 0.52
140 0.48
141 0.39
142 0.35
143 0.31
144 0.3
145 0.27
146 0.22
147 0.2
148 0.18
149 0.23
150 0.24
151 0.29
152 0.3
153 0.33
154 0.36
155 0.45
156 0.5
157 0.54
158 0.62
159 0.6
160 0.66
161 0.68
162 0.7
163 0.72
164 0.76
165 0.71
166 0.68
167 0.69
168 0.68
169 0.69
170 0.7
171 0.65
172 0.63
173 0.6
174 0.52
175 0.52
176 0.49
177 0.45
178 0.37
179 0.32
180 0.26
181 0.24
182 0.23
183 0.18
184 0.12
185 0.12
186 0.17
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.21
191 0.21
192 0.22
193 0.24
194 0.2
195 0.24
196 0.27
197 0.32
198 0.35
199 0.37
200 0.37
201 0.34
202 0.36
203 0.39
204 0.39
205 0.41
206 0.38
207 0.4
208 0.45
209 0.46
210 0.49
211 0.46
212 0.52
213 0.48
214 0.51
215 0.48
216 0.45
217 0.43
218 0.4
219 0.37
220 0.31
221 0.29
222 0.27
223 0.26
224 0.22
225 0.19
226 0.16
227 0.14
228 0.11
229 0.08
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.11
238 0.14
239 0.2
240 0.22
241 0.23
242 0.27
243 0.3
244 0.31
245 0.3
246 0.33
247 0.36
248 0.37
249 0.38
250 0.35
251 0.37
252 0.34
253 0.34
254 0.33
255 0.28
256 0.3
257 0.32
258 0.31
259 0.26
260 0.25
261 0.25
262 0.22
263 0.19
264 0.14
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.19
279 0.18
280 0.22
281 0.27
282 0.27
283 0.27
284 0.26
285 0.24
286 0.18
287 0.18
288 0.14
289 0.09
290 0.12
291 0.13
292 0.15
293 0.16
294 0.18
295 0.2
296 0.22
297 0.26
298 0.25
299 0.28
300 0.29
301 0.31
302 0.31
303 0.3
304 0.34
305 0.34
306 0.39
307 0.42
308 0.48
309 0.55
310 0.63
311 0.71
312 0.75
313 0.82
314 0.86
315 0.89
316 0.9
317 0.9
318 0.83
319 0.77
320 0.67
321 0.56
322 0.45
323 0.35
324 0.26
325 0.15
326 0.13
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.16
337 0.18
338 0.18
339 0.18
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.15
344 0.11
345 0.07
346 0.08
347 0.1
348 0.15
349 0.16
350 0.19
351 0.22
352 0.3
353 0.37
354 0.42
355 0.48
356 0.54
357 0.62
358 0.65
359 0.7
360 0.64
361 0.64
362 0.67
363 0.68
364 0.66
365 0.68
366 0.73
367 0.72
368 0.77
369 0.8
370 0.82
371 0.82
372 0.83
373 0.83
374 0.79
375 0.8
376 0.81
377 0.78
378 0.72
379 0.72
380 0.66
381 0.65
382 0.65
383 0.63
384 0.6
385 0.55
386 0.56
387 0.57
388 0.61
389 0.58
390 0.58
391 0.52
392 0.46
393 0.5
394 0.49
395 0.47
396 0.49
397 0.48
398 0.49
399 0.56
400 0.56
401 0.5
402 0.47
403 0.49
404 0.46
405 0.49
406 0.42
407 0.4
408 0.44
409 0.46