Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38827

Protein Details
Accession P38827    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-64QQYSSQYNQRRRYNHNDGTRRRYNDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024657  COMPASS_Set1_N-SET  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR003616  Post-SET_dom  
IPR044570  Set1-like  
IPR017111  Set1_fungi  
IPR024636  SET_assoc  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
GO:0042800  F:histone H3K4 methyltransferase activity  
GO:0140999  F:histone H3K4 trimethyltransferase activity  
GO:0016279  F:protein-lysine N-methyltransferase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0030437  P:ascospore formation  
GO:0044648  P:histone H3-K4 dimethylation  
GO:0051568  P:histone H3-K4 methylation  
GO:0097692  P:histone H3-K4 monomethylation  
GO:0080182  P:histone H3-K4 trimethylation  
GO:0042138  P:meiotic DNA double-strand break formation  
GO:0010629  P:negative regulation of gene expression  
GO:0090241  P:negative regulation of histone H4 acetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:1905088  P:positive regulation of synaptonemal complex assembly  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006479  P:protein methylation  
GO:0000183  P:rDNA heterochromatin formation  
GO:1902275  P:regulation of chromatin organization  
GO:1903341  P:regulation of meiotic DNA double-strand break formation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0030466  P:silent mating-type cassette heterochromatin formation  
GO:0055092  P:sterol homeostasis  
GO:0031509  P:subtelomeric heterochromatin formation  
GO:0007130  P:synaptonemal complex assembly  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG sce:YHR119W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11764  N-SET  
PF00856  SET  
PF11767  SET_assoc  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50868  POST_SET  
PS51572  SAM_MT43_1  
PS50280  SET  
CDD cd12302  RRM_scSet1p_like  
cd20072  SET_SET1  
Amino Acid Sequences MSNYYRRAHASSGSYRQPQEQPQYSRSGHYQYSNGHSHQQYSSQYNQRRRYNHNDGTRRRYNDDRPHSSNNASTRQYYATNNSQSGPYVNKKSDISSRRGMSQSRYSNSNVHNTLASSSGSLPTESALLLQQRPPSVLRYNTDNLKSKFHYFDPIKGEFFNKDKMLSWKATDKEFSETGYYVVKELQDGQFKFKIKHRHPEIKASDPRNENGIMTSGKVATHRKCRNSLILLPRISYDRYSLGPPPSCEIVVYPAQDSTTTNIQDISIKNYFKKYGEISHFEAFNDPNSALPLHVYLIKYASSDGKINDAAKAAFSAVRKHESSGCFIMGFKFEVILNKHSILNNIISKFVEINVKKLQKLQENLKKAKEKEAENEKAKELQGKDITLPKEPKVDTLSHSSGSEKRIPYDLLGVVNNRPVLHVSKIFVAKHRFCVEDFKYKLRGYRCAKFIDHPTGIYIIFNDIAHAQTCSNAESGNLTIMSRSRRIPILIKFHLILPRFQNRTRFNKSSSSSNSTNVPIKYESKEEFIEATAKQILKDLEKTLHVDIKKRLIGPTVFDALDHANFPELLAKRELKEKEKRQQIASKIAEDELKRKEEAKRDFDLFGLYGGYAKSNKRNLKRHNSLALDHTSLKRKKLSNGIKPMAHLLNEETDSKETTPLNDEGITRVSKEHDEEDENMTSSSSEEEEEEAPDKKFKSESEPTTPESDHLHGIKPLVPDQNGSSDVLDASSMYKPTATEIPEPVYPPEEYDLKYSQTLSSMDLQNAIKDEEDMLILKQLLSTYTPTVTPETSAALEYKIWQSRRKVLEEEKASDWQIELNGTLFDSELQPGSSFKAEGFRKIADKLKINYLPHRRRVHQPLNTVNIHNERNEYTPELCQREESSNKEPSDSVPQEVSSSRDNRASNRRFQQDIEAQKAAIGTESELLSLNQLNKRKKPVMFARSAIHNWGLYALDSIAAKEMIIEYVGERIRQPVAEMREKRYLKNGIGSSYLFRVDENTVIDATKKGGIARFINHCCDPNCTAKIIKVGGRRRIVIYALRDIAASEELTYDYKFEREKDDEERLPCLCGAPNCKGFLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.55
3 0.58
4 0.59
5 0.6
6 0.61
7 0.63
8 0.62
9 0.6
10 0.66
11 0.61
12 0.59
13 0.55
14 0.51
15 0.46
16 0.43
17 0.45
18 0.42
19 0.47
20 0.49
21 0.46
22 0.48
23 0.45
24 0.45
25 0.42
26 0.43
27 0.41
28 0.41
29 0.48
30 0.5
31 0.58
32 0.63
33 0.71
34 0.73
35 0.75
36 0.78
37 0.79
38 0.8
39 0.8
40 0.81
41 0.82
42 0.83
43 0.85
44 0.85
45 0.81
46 0.76
47 0.76
48 0.76
49 0.76
50 0.77
51 0.77
52 0.75
53 0.77
54 0.76
55 0.7
56 0.66
57 0.62
58 0.59
59 0.53
60 0.47
61 0.43
62 0.41
63 0.41
64 0.39
65 0.39
66 0.41
67 0.43
68 0.43
69 0.41
70 0.39
71 0.37
72 0.35
73 0.35
74 0.34
75 0.36
76 0.37
77 0.4
78 0.4
79 0.43
80 0.5
81 0.49
82 0.48
83 0.49
84 0.49
85 0.51
86 0.55
87 0.54
88 0.51
89 0.54
90 0.56
91 0.51
92 0.52
93 0.49
94 0.52
95 0.52
96 0.55
97 0.46
98 0.39
99 0.37
100 0.34
101 0.32
102 0.27
103 0.23
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.15
108 0.15
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.14
116 0.16
117 0.19
118 0.22
119 0.23
120 0.25
121 0.26
122 0.28
123 0.31
124 0.34
125 0.34
126 0.37
127 0.42
128 0.47
129 0.52
130 0.56
131 0.52
132 0.53
133 0.54
134 0.52
135 0.51
136 0.45
137 0.49
138 0.42
139 0.47
140 0.47
141 0.47
142 0.43
143 0.41
144 0.41
145 0.36
146 0.36
147 0.35
148 0.3
149 0.28
150 0.3
151 0.35
152 0.38
153 0.36
154 0.37
155 0.38
156 0.39
157 0.41
158 0.41
159 0.36
160 0.36
161 0.34
162 0.32
163 0.27
164 0.25
165 0.22
166 0.23
167 0.21
168 0.16
169 0.17
170 0.15
171 0.13
172 0.17
173 0.21
174 0.25
175 0.26
176 0.31
177 0.35
178 0.37
179 0.4
180 0.43
181 0.49
182 0.47
183 0.57
184 0.61
185 0.67
186 0.69
187 0.75
188 0.75
189 0.75
190 0.77
191 0.7
192 0.69
193 0.61
194 0.58
195 0.51
196 0.46
197 0.35
198 0.28
199 0.27
200 0.19
201 0.17
202 0.17
203 0.14
204 0.14
205 0.18
206 0.24
207 0.27
208 0.37
209 0.45
210 0.49
211 0.54
212 0.58
213 0.62
214 0.61
215 0.62
216 0.61
217 0.6
218 0.55
219 0.5
220 0.47
221 0.42
222 0.37
223 0.3
224 0.23
225 0.17
226 0.18
227 0.2
228 0.24
229 0.28
230 0.3
231 0.31
232 0.32
233 0.31
234 0.29
235 0.26
236 0.23
237 0.2
238 0.2
239 0.19
240 0.17
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.17
249 0.16
250 0.17
251 0.21
252 0.21
253 0.23
254 0.23
255 0.24
256 0.26
257 0.29
258 0.32
259 0.28
260 0.32
261 0.28
262 0.32
263 0.36
264 0.39
265 0.41
266 0.41
267 0.4
268 0.36
269 0.36
270 0.28
271 0.23
272 0.2
273 0.15
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.08
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.14
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.16
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.14
299 0.14
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.16
304 0.18
305 0.22
306 0.23
307 0.24
308 0.29
309 0.28
310 0.32
311 0.29
312 0.26
313 0.22
314 0.22
315 0.21
316 0.17
317 0.16
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.14
322 0.16
323 0.18
324 0.19
325 0.19
326 0.22
327 0.22
328 0.22
329 0.2
330 0.22
331 0.23
332 0.22
333 0.22
334 0.19
335 0.19
336 0.18
337 0.18
338 0.21
339 0.17
340 0.21
341 0.28
342 0.31
343 0.31
344 0.35
345 0.39
346 0.38
347 0.43
348 0.49
349 0.5
350 0.56
351 0.6
352 0.64
353 0.65
354 0.6
355 0.63
356 0.59
357 0.53
358 0.53
359 0.58
360 0.59
361 0.57
362 0.58
363 0.5
364 0.47
365 0.45
366 0.42
367 0.32
368 0.31
369 0.28
370 0.26
371 0.27
372 0.3
373 0.31
374 0.31
375 0.33
376 0.27
377 0.31
378 0.3
379 0.31
380 0.28
381 0.28
382 0.25
383 0.3
384 0.3
385 0.25
386 0.25
387 0.25
388 0.25
389 0.27
390 0.3
391 0.23
392 0.23
393 0.24
394 0.24
395 0.22
396 0.22
397 0.2
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.15
402 0.16
403 0.16
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.13
408 0.15
409 0.16
410 0.15
411 0.18
412 0.22
413 0.22
414 0.26
415 0.31
416 0.3
417 0.34
418 0.35
419 0.32
420 0.29
421 0.37
422 0.35
423 0.38
424 0.38
425 0.37
426 0.4
427 0.4
428 0.44
429 0.38
430 0.44
431 0.4
432 0.45
433 0.44
434 0.43
435 0.44
436 0.43
437 0.45
438 0.43
439 0.38
440 0.31
441 0.28
442 0.25
443 0.24
444 0.2
445 0.14
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.09
468 0.11
469 0.12
470 0.13
471 0.14
472 0.15
473 0.17
474 0.22
475 0.26
476 0.32
477 0.32
478 0.32
479 0.3
480 0.32
481 0.34
482 0.29
483 0.26
484 0.23
485 0.29
486 0.31
487 0.33
488 0.39
489 0.41
490 0.49
491 0.55
492 0.53
493 0.49
494 0.53
495 0.52
496 0.52
497 0.51
498 0.49
499 0.42
500 0.4
501 0.39
502 0.34
503 0.36
504 0.28
505 0.25
506 0.2
507 0.21
508 0.22
509 0.23
510 0.22
511 0.2
512 0.2
513 0.19
514 0.17
515 0.15
516 0.16
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.14
526 0.14
527 0.13
528 0.14
529 0.16
530 0.15
531 0.19
532 0.18
533 0.21
534 0.21
535 0.25
536 0.26
537 0.25
538 0.25
539 0.24
540 0.23
541 0.21
542 0.22
543 0.19
544 0.16
545 0.15
546 0.15
547 0.13
548 0.13
549 0.11
550 0.08
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.14
558 0.15
559 0.16
560 0.23
561 0.26
562 0.28
563 0.37
564 0.44
565 0.5
566 0.58
567 0.6
568 0.59
569 0.62
570 0.59
571 0.59
572 0.52
573 0.45
574 0.37
575 0.35
576 0.33
577 0.27
578 0.28
579 0.21
580 0.21
581 0.2
582 0.23
583 0.27
584 0.32
585 0.38
586 0.39
587 0.4
588 0.4
589 0.4
590 0.37
591 0.33
592 0.25
593 0.18
594 0.12
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.07
599 0.08
600 0.1
601 0.16
602 0.23
603 0.31
604 0.39
605 0.48
606 0.57
607 0.65
608 0.71
609 0.72
610 0.72
611 0.67
612 0.6
613 0.55
614 0.48
615 0.39
616 0.34
617 0.3
618 0.31
619 0.31
620 0.32
621 0.34
622 0.34
623 0.36
624 0.45
625 0.52
626 0.52
627 0.6
628 0.62
629 0.57
630 0.55
631 0.54
632 0.44
633 0.35
634 0.26
635 0.17
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.13
640 0.12
641 0.13
642 0.13
643 0.15
644 0.12
645 0.12
646 0.15
647 0.15
648 0.15
649 0.15
650 0.15
651 0.14
652 0.16
653 0.15
654 0.12
655 0.12
656 0.13
657 0.13
658 0.14
659 0.15
660 0.15
661 0.17
662 0.19
663 0.22
664 0.21
665 0.2
666 0.19
667 0.16
668 0.14
669 0.11
670 0.1
671 0.07
672 0.06
673 0.06
674 0.08
675 0.08
676 0.09
677 0.11
678 0.12
679 0.12
680 0.15
681 0.15
682 0.14
683 0.16
684 0.15
685 0.22
686 0.28
687 0.33
688 0.39
689 0.42
690 0.43
691 0.45
692 0.44
693 0.37
694 0.32
695 0.28
696 0.23
697 0.21
698 0.2
699 0.17
700 0.18
701 0.2
702 0.18
703 0.21
704 0.21
705 0.2
706 0.2
707 0.2
708 0.22
709 0.2
710 0.19
711 0.16
712 0.12
713 0.12
714 0.11
715 0.09
716 0.06
717 0.07
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.08
722 0.08
723 0.1
724 0.14
725 0.15
726 0.16
727 0.18
728 0.21
729 0.22
730 0.23
731 0.22
732 0.2
733 0.17
734 0.16
735 0.16
736 0.16
737 0.16
738 0.19
739 0.19
740 0.19
741 0.2
742 0.2
743 0.18
744 0.18
745 0.17
746 0.15
747 0.19
748 0.19
749 0.18
750 0.21
751 0.21
752 0.19
753 0.2
754 0.18
755 0.13
756 0.11
757 0.12
758 0.08
759 0.08
760 0.08
761 0.07
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.08
769 0.1
770 0.1
771 0.11
772 0.12
773 0.13
774 0.15
775 0.14
776 0.14
777 0.13
778 0.13
779 0.13
780 0.13
781 0.12
782 0.11
783 0.11
784 0.12
785 0.17
786 0.21
787 0.23
788 0.29
789 0.33
790 0.41
791 0.46
792 0.48
793 0.49
794 0.5
795 0.57
796 0.57
797 0.56
798 0.51
799 0.48
800 0.44
801 0.38
802 0.31
803 0.22
804 0.17
805 0.13
806 0.1
807 0.08
808 0.08
809 0.08
810 0.08
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.07
816 0.08
817 0.08
818 0.09
819 0.11
820 0.11
821 0.1
822 0.1
823 0.18
824 0.19
825 0.23
826 0.25
827 0.26
828 0.27
829 0.32
830 0.38
831 0.36
832 0.41
833 0.4
834 0.46
835 0.49
836 0.5
837 0.55
838 0.6
839 0.63
840 0.65
841 0.7
842 0.65
843 0.68
844 0.76
845 0.76
846 0.73
847 0.72
848 0.71
849 0.7
850 0.69
851 0.61
852 0.55
853 0.51
854 0.46
855 0.38
856 0.33
857 0.28
858 0.28
859 0.29
860 0.28
861 0.24
862 0.28
863 0.33
864 0.34
865 0.32
866 0.32
867 0.32
868 0.36
869 0.39
870 0.4
871 0.4
872 0.44
873 0.44
874 0.43
875 0.41
876 0.36
877 0.41
878 0.37
879 0.33
880 0.27
881 0.27
882 0.27
883 0.28
884 0.28
885 0.24
886 0.25
887 0.25
888 0.29
889 0.31
890 0.36
891 0.46
892 0.5
893 0.53
894 0.59
895 0.62
896 0.59
897 0.58
898 0.6
899 0.58
900 0.59
901 0.56
902 0.48
903 0.42
904 0.4
905 0.38
906 0.29
907 0.22
908 0.15
909 0.09
910 0.1
911 0.1
912 0.1
913 0.1
914 0.1
915 0.11
916 0.13
917 0.18
918 0.21
919 0.29
920 0.37
921 0.42
922 0.51
923 0.57
924 0.57
925 0.62
926 0.66
927 0.68
928 0.67
929 0.65
930 0.61
931 0.6
932 0.58
933 0.52
934 0.43
935 0.34
936 0.27
937 0.25
938 0.21
939 0.14
940 0.14
941 0.1
942 0.1
943 0.1
944 0.1
945 0.1
946 0.09
947 0.09
948 0.08
949 0.08
950 0.07
951 0.07
952 0.07
953 0.06
954 0.12
955 0.14
956 0.14
957 0.14
958 0.16
959 0.18
960 0.18
961 0.2
962 0.21
963 0.28
964 0.37
965 0.41
966 0.45
967 0.53
968 0.55
969 0.55
970 0.56
971 0.55
972 0.49
973 0.53
974 0.5
975 0.43
976 0.44
977 0.43
978 0.37
979 0.33
980 0.31
981 0.23
982 0.2
983 0.2
984 0.19
985 0.2
986 0.19
987 0.18
988 0.17
989 0.18
990 0.19
991 0.16
992 0.16
993 0.16
994 0.15
995 0.16
996 0.19
997 0.24
998 0.26
999 0.32
1000 0.39
1001 0.4
1002 0.45
1003 0.45
1004 0.47
1005 0.42
1006 0.45
1007 0.43
1008 0.42
1009 0.4
1010 0.38
1011 0.37
1012 0.36
1013 0.4
1014 0.39
1015 0.41
1016 0.42
1017 0.49
1018 0.55
1019 0.58
1020 0.58
1021 0.54
1022 0.53
1023 0.51
1024 0.48
1025 0.45
1026 0.43
1027 0.4
1028 0.37
1029 0.34
1030 0.31
1031 0.29
1032 0.24
1033 0.18
1034 0.11
1035 0.1
1036 0.11
1037 0.13
1038 0.13
1039 0.13
1040 0.13
1041 0.16
1042 0.19
1043 0.2
1044 0.27
1045 0.3
1046 0.35
1047 0.41
1048 0.49
1049 0.51
1050 0.51
1051 0.53
1052 0.46
1053 0.43
1054 0.38
1055 0.33
1056 0.29
1057 0.29
1058 0.32
1059 0.37
1060 0.41