FuNGI

P53617

Protein Details

Accession

P53617

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
243-263	YGSRRERERERERYNSRRNRS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
249-263	RERERERYNSRRNRS

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR008942 ENTH_VHS IPR034894 Nrd1/Seb1_RRM IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0035649 C:Nrd1 complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003729 F:mRNA binding GO:0019904 F:protein domain specific binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0001068 F:transcription regulatory region RNA binding GO:0071041 P:antisense RNA transcript catabolic process GO:0071034 P:CUT catabolic process GO:0031124 P:mRNA 3'-end processing GO:0071028 P:nuclear mRNA surveillance GO:0031126 P:sno(s)RNA 3'-end processing GO:0034472 P:snRNA 3'-end processing GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription GO:0030847 P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent GO:0042780 P:tRNA 3'-end processing
KEGG	sce:YNL251C -
Pfam	View protein in Pfam PF04818 CID PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID PS50102 RRM
CDD	cd16984 CID_Nrd1_like cd12331 RRM_NRD1_SEB1_like

Amino Acid Sequences

MQQDDDFQNFVATLESFKDLKSGISGSRIKKLTTYALDHIDIESKIISLIIDYSRLCPDSHKLGSLYIIDSIGRAYLDETRSNSNSSSNKPGTCAHAINTLGEVIQELLSDAIAKSNQDHKEKIRMLLDIWDRSGLFQKSYLNAIRSKCFAMDISNNTANTASQQLSLDPKQRSKQILSNLKKSPPLNLNISLPTDLTSTDPAKQQAALFQVIAALQKHFKTLPSHTSVGTVAPPQAHTITEYGSRRERERERERYNSRRNRSRSPPAPFSQPSTGRKDRYPSVAQDQYSIGAPNTTFGTNNHHLYPDELNVSNNPHYRPKPVSYDSTLPPDHIKVYSRTLFIGGVPLNMKEWDLANVLKPFAEVQSVILNNSRKHAFVKVYSRHEAENVLQNFNKDGALPLRTRWGVGFGPRDCCDYQHGYSIIPMHRLTDADKKWSVSAQWGGTSGQPLVTGIVFEEPDIIVGEGVSSKAISQKMPTDSGRNGPRSGKPNKSGSISSISPVPYGNAPLASPPPQQYVQPMMQQPYGYAPNQPLPSQGPAAAAPPVPQQQFDPTAQLNSLMNMLNQQQQQQQQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.15
3	0.15
4	0.15
5	0.17
6	0.15
7	0.16
8	0.17
9	0.18
10	0.16
11	0.25
12	0.32
13	0.34
14	0.42
15	0.43
16	0.41
17	0.41
18	0.43
19	0.42
20	0.41
21	0.44
22	0.4
23	0.43
24	0.43
25	0.41
26	0.38
27	0.33
28	0.27
29	0.22
30	0.17
31	0.13
32	0.11
33	0.11
34	0.1
35	0.06
36	0.09
37	0.09
38	0.12
39	0.13
40	0.15
41	0.18
42	0.2
43	0.19
44	0.2
45	0.24
46	0.3
47	0.31
48	0.32
49	0.3
50	0.3
51	0.32
52	0.3
53	0.26
54	0.19
55	0.17
56	0.14
57	0.13
58	0.12
59	0.1
60	0.08
61	0.07
62	0.07
63	0.12
64	0.16
65	0.19
66	0.22
67	0.27
68	0.29
69	0.31
70	0.3
71	0.32
72	0.34
73	0.35
74	0.42
75	0.4
76	0.39
77	0.41
78	0.42
79	0.41
80	0.42
81	0.38
82	0.3
83	0.32
84	0.32
85	0.3
86	0.28
87	0.22
88	0.16
89	0.15
90	0.13
91	0.07
92	0.07
93	0.06
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.06
98	0.06
99	0.07
100	0.07
101	0.08
102	0.11
103	0.19
104	0.26
105	0.3
106	0.34
107	0.36
108	0.46
109	0.49
110	0.5
111	0.45
112	0.4
113	0.36
114	0.4
115	0.41
116	0.33
117	0.31
118	0.27
119	0.24
120	0.24
121	0.3
122	0.23
123	0.19
124	0.19
125	0.21
126	0.21
127	0.26
128	0.28
129	0.25
130	0.28
131	0.3
132	0.31
133	0.3
134	0.3
135	0.25
136	0.23
137	0.2
138	0.2
139	0.23
140	0.25
141	0.29
142	0.32
143	0.31
144	0.3
145	0.3
146	0.25
147	0.2
148	0.19
149	0.13
150	0.11
151	0.12
152	0.13
153	0.18
154	0.22
155	0.27
156	0.28
157	0.33
158	0.35
159	0.41
160	0.44
161	0.43
162	0.45
163	0.48
164	0.55
165	0.56
166	0.6
167	0.6
168	0.58
169	0.6
170	0.54
171	0.51
172	0.46
173	0.44
174	0.41
175	0.38
176	0.37
177	0.33
178	0.34
179	0.28
180	0.22
181	0.18
182	0.14
183	0.12
184	0.11
185	0.12
186	0.12
187	0.14
188	0.16
189	0.17
190	0.17
191	0.18
192	0.17
193	0.16
194	0.18
195	0.16
196	0.14
197	0.12
198	0.12
199	0.11
200	0.12
201	0.1
202	0.08
203	0.09
204	0.1
205	0.11
206	0.11
207	0.14
208	0.17
209	0.2
210	0.25
211	0.28
212	0.29
213	0.28
214	0.29
215	0.27
216	0.23
217	0.21
218	0.15
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.1
228	0.15
229	0.16
230	0.18
231	0.22
232	0.24
233	0.25
234	0.32
235	0.36
236	0.41
237	0.5
238	0.57
239	0.59
240	0.67
241	0.73
242	0.76
243	0.81
244	0.8
245	0.79
246	0.78
247	0.77
248	0.76
249	0.76
250	0.76
251	0.73
252	0.71
253	0.69
254	0.62
255	0.64
256	0.57
257	0.52
258	0.49
259	0.47
260	0.44
261	0.45
262	0.48
263	0.43
264	0.44
265	0.43
266	0.39
267	0.39
268	0.38
269	0.33
270	0.35
271	0.36
272	0.34
273	0.32
274	0.29
275	0.24
276	0.21
277	0.18
278	0.11
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.15
287	0.18
288	0.2
289	0.2
290	0.19
291	0.19
292	0.21
293	0.22
294	0.15
295	0.15
296	0.13
297	0.13
298	0.13
299	0.16
300	0.17
301	0.18
302	0.19
303	0.23
304	0.24
305	0.28
306	0.31
307	0.32
308	0.36
309	0.37
310	0.39
311	0.37
312	0.4
313	0.37
314	0.38
315	0.35
316	0.29
317	0.27
318	0.23
319	0.2
320	0.17
321	0.18
322	0.15
323	0.2
324	0.22
325	0.21
326	0.21
327	0.2
328	0.19
329	0.17
330	0.18
331	0.13
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.1
343	0.12
344	0.13
345	0.13
346	0.12
347	0.12
348	0.11
349	0.1
350	0.1
351	0.07
352	0.07
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.16
357	0.19
358	0.19
359	0.22
360	0.22
361	0.18
362	0.2
363	0.24
364	0.23
365	0.26
366	0.35
367	0.39
368	0.45
369	0.48
370	0.47
371	0.43
372	0.41
373	0.37
374	0.29
375	0.31
376	0.26
377	0.26
378	0.25
379	0.25
380	0.25
381	0.23
382	0.21
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.15
387	0.15
388	0.15
389	0.21
390	0.21
391	0.21
392	0.19
393	0.21
394	0.19
395	0.23
396	0.3
397	0.26
398	0.31
399	0.31
400	0.35
401	0.31
402	0.31
403	0.31
404	0.29
405	0.28
406	0.28
407	0.28
408	0.24
409	0.26
410	0.3
411	0.26
412	0.24
413	0.22
414	0.18
415	0.18
416	0.19
417	0.21
418	0.25
419	0.26
420	0.28
421	0.3
422	0.3
423	0.3
424	0.31
425	0.29
426	0.25
427	0.28
428	0.23
429	0.22
430	0.22
431	0.22
432	0.21
433	0.22
434	0.17
435	0.12
436	0.1
437	0.1
438	0.09
439	0.08
440	0.07
441	0.06
442	0.08
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.08
449	0.08
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.1
459	0.11
460	0.12
461	0.15
462	0.21
463	0.24
464	0.3
465	0.32
466	0.33
467	0.34
468	0.42
469	0.47
470	0.44
471	0.44
472	0.44
473	0.49
474	0.52
475	0.58
476	0.59
477	0.57
478	0.61
479	0.62
480	0.61
481	0.56
482	0.51
483	0.49
484	0.41
485	0.35
486	0.32
487	0.28
488	0.24
489	0.22
490	0.2
491	0.15
492	0.17
493	0.17
494	0.13
495	0.13
496	0.15
497	0.19
498	0.21
499	0.24
500	0.25
501	0.29
502	0.29
503	0.3
504	0.32
505	0.34
506	0.34
507	0.38
508	0.39
509	0.38
510	0.39
511	0.38
512	0.34
513	0.33
514	0.33
515	0.27
516	0.26
517	0.26
518	0.31
519	0.33
520	0.33
521	0.31
522	0.3
523	0.33
524	0.32
525	0.29
526	0.24
527	0.22
528	0.24
529	0.23
530	0.19
531	0.17
532	0.2
533	0.26
534	0.25
535	0.25
536	0.26
537	0.3
538	0.34
539	0.34
540	0.34
541	0.3
542	0.31
543	0.3
544	0.3
545	0.25
546	0.21
547	0.22
548	0.17
549	0.15
550	0.16
551	0.18
552	0.23
553	0.24
554	0.28
555	0.31

P53617

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer