Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40693

Protein Details
Accession P40693    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-62NPEILLRKRRNADRTRIERQELAKKKREEQIKKKRSNKNKFVRAESIVHydrophilic
281-302GSLNRLRKIKQREAESRTRQFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-57RKRRNADRTRIERQELAKKKREEQIKKKRSNKNKFVR
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036919  L30_ferredoxin-like_sf  
IPR018038  Ribosomal_L30_CS  
IPR016082  Ribosomal_L30_ferredoxin-like  
IPR039699  Ribosomal_L7/L30  
IPR035808  Ribosomal_L7_euk_arc  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000465  P:exonucleolytic trimming to generate mature 5'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG sce:YNL002C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00327  Ribosomal_L30  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00634  RIBOSOMAL_L30  
CDD cd01657  Ribosomal_L7_archeal_euk  
Amino Acid Sequences MSSTQDSKAQTLNSNPEILLRKRRNADRTRIERQELAKKKREEQIKKKRSNKNKFVRAESIVAKTLATSREKERIKRVSILEDKKAKNETQHIASGKDFILKITEKANGAEENSVDLEETEEEEDDGLIREKTTYDGKPALLFIVRVRGPLAVNIPNKAFKILSLLRLVETNTGVFVKLTKNVYPLLKVIAPYVVIGKPSLSSIRSLIQKRGRIIYKGENEAEPHEIVLNDNNIVEEQLGDHGIICVEDIIHEIATMGESFSVCNFFLQPFKLNREVSGFGSLNRLRKIKQREAESRTRQFSNAATAPVIEVDIDSLLAKLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.37
4 0.41
5 0.42
6 0.47
7 0.46
8 0.52
9 0.59
10 0.68
11 0.72
12 0.74
13 0.79
14 0.79
15 0.81
16 0.83
17 0.81
18 0.76
19 0.72
20 0.7
21 0.7
22 0.69
23 0.69
24 0.69
25 0.66
26 0.69
27 0.7
28 0.74
29 0.75
30 0.76
31 0.78
32 0.8
33 0.86
34 0.89
35 0.92
36 0.93
37 0.93
38 0.92
39 0.92
40 0.91
41 0.87
42 0.84
43 0.8
44 0.73
45 0.67
46 0.6
47 0.53
48 0.45
49 0.38
50 0.31
51 0.24
52 0.23
53 0.23
54 0.21
55 0.21
56 0.23
57 0.32
58 0.38
59 0.43
60 0.49
61 0.53
62 0.54
63 0.57
64 0.56
65 0.56
66 0.61
67 0.61
68 0.6
69 0.61
70 0.58
71 0.56
72 0.57
73 0.49
74 0.45
75 0.46
76 0.42
77 0.37
78 0.42
79 0.39
80 0.37
81 0.36
82 0.33
83 0.26
84 0.24
85 0.2
86 0.14
87 0.17
88 0.15
89 0.16
90 0.16
91 0.19
92 0.16
93 0.17
94 0.19
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.08
120 0.12
121 0.12
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.16
128 0.12
129 0.12
130 0.09
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.13
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.18
142 0.19
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.16
147 0.09
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.12
157 0.11
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.17
170 0.18
171 0.18
172 0.17
173 0.16
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.11
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.15
192 0.22
193 0.23
194 0.3
195 0.35
196 0.39
197 0.41
198 0.46
199 0.45
200 0.4
201 0.43
202 0.44
203 0.43
204 0.43
205 0.42
206 0.36
207 0.34
208 0.34
209 0.32
210 0.23
211 0.17
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.13
255 0.16
256 0.21
257 0.24
258 0.3
259 0.36
260 0.36
261 0.36
262 0.39
263 0.39
264 0.35
265 0.37
266 0.32
267 0.26
268 0.34
269 0.35
270 0.36
271 0.39
272 0.39
273 0.35
274 0.43
275 0.53
276 0.54
277 0.59
278 0.63
279 0.68
280 0.73
281 0.81
282 0.82
283 0.81
284 0.77
285 0.71
286 0.62
287 0.55
288 0.49
289 0.47
290 0.4
291 0.33
292 0.28
293 0.26
294 0.25
295 0.22
296 0.2
297 0.11
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07