Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40212

Protein Details
Accession P40212    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28LPILKNHFRKHWQERVKVHFDQHydrophilic
171-193RLARSEKKFRGIREKRAREKAEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-50GKKVSRRNARAARAAKIAPRP
173-199ARSEKKFRGIREKRAREKAEAEAEKKK
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001380  Ribosomal_L13e  
IPR018256  Ribosomal_L13e_CS  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0002181  P:cytoplasmic translation  
GO:0016236  P:macroautophagy  
KEGG sce:YMR142C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01294  Ribosomal_L13e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01104  RIBOSOMAL_L13E  
Amino Acid Sequences MAISKNLPILKNHFRKHWQERVKVHFDQAGKKVSRRNARAARAAKIAPRPLDLLRPVVRAPTVKYNRKVRAGRGFTLAEVKAAGLTAAYARTIGIAVDHRRQNRNQEIFDANVQRLKEYQSKIIVFPRDGKAPEAEQVLSAAATFPIAQPATDVEARAVQDNGESAFRTLRLARSEKKFRGIREKRAREKAEAEAEKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.69
3 0.75
4 0.77
5 0.76
6 0.76
7 0.8
8 0.81
9 0.81
10 0.72
11 0.66
12 0.6
13 0.54
14 0.52
15 0.48
16 0.48
17 0.43
18 0.45
19 0.48
20 0.52
21 0.58
22 0.56
23 0.61
24 0.62
25 0.65
26 0.71
27 0.68
28 0.64
29 0.58
30 0.56
31 0.5
32 0.48
33 0.47
34 0.39
35 0.36
36 0.35
37 0.31
38 0.35
39 0.31
40 0.31
41 0.28
42 0.29
43 0.27
44 0.25
45 0.26
46 0.22
47 0.23
48 0.28
49 0.34
50 0.4
51 0.47
52 0.55
53 0.6
54 0.67
55 0.67
56 0.64
57 0.66
58 0.63
59 0.57
60 0.52
61 0.47
62 0.38
63 0.39
64 0.31
65 0.2
66 0.16
67 0.13
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.07
83 0.1
84 0.16
85 0.19
86 0.23
87 0.26
88 0.28
89 0.35
90 0.41
91 0.43
92 0.38
93 0.39
94 0.37
95 0.35
96 0.37
97 0.31
98 0.22
99 0.2
100 0.19
101 0.16
102 0.15
103 0.17
104 0.2
105 0.2
106 0.23
107 0.26
108 0.27
109 0.29
110 0.33
111 0.32
112 0.27
113 0.3
114 0.29
115 0.27
116 0.27
117 0.27
118 0.24
119 0.22
120 0.23
121 0.2
122 0.18
123 0.14
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.04
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.11
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.14
156 0.15
157 0.18
158 0.24
159 0.3
160 0.37
161 0.45
162 0.55
163 0.56
164 0.64
165 0.64
166 0.65
167 0.7
168 0.71
169 0.73
170 0.74
171 0.81
172 0.82
173 0.87
174 0.85
175 0.8
176 0.75
177 0.72
178 0.72
179 0.69