FuNGI

P43554

Protein Details

Accession

P43554

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
480-506	TGLQNVRKVRTKKWKKYWQYKAGIPIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013933 CRC_Rsc7/Swp82
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0016586 C:RSC-type complex GO:0016514 C:SWI/SNF complex GO:0031490 F:chromatin DNA binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:1905168 P:positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	sce:YFL049W -
Pfam	View protein in Pfam PF08624 CRC_subunit

Amino Acid Sequences

MLGEDEGNTVLEKGNNPSVKQGEVGAVFIVPKILIREHERVILKQILQILDQDELVQPPLDKFPYKKLELPKYIDELKTRDATNTSYKMIQLDAYGEKKVGSNGELFGGRHYLFNTFTFTAHMGVLLVLLQDVIKVLYQSNATHDEDEFIVQHDQILVMETSEEQTKFLAKNGVIPEESKGSFKYITARSAFVEFGASVIAGGQRIVDDYWESLAKKQNLSSHQRVFKLSTNLISKISLLRPSFQNNRISNANEISANTNNTCTISTSKFESQYPIVTEQPSAEIREAYIENFAKGEHISAIVPGQSISGTLELSAQFRVPRYHSKNSFQQALQMKAMDIPIGRHEELLAQYESQAPDGSASISLPNHIPSVNPSNKPIKRMLSSILDINVSSSKNKKSEENEMIKPMNKGQHKNNTSLNINGWKFESLPLKSAENSGKQQYYRGLPLYEKNTLLERLKQLTPNEIKELEHLHDAVFVNTGLQNVRKVRTKKWKKYWQYKAGIPIGLKRSQLDEFKNKYLKDVLAQTSVTTNFNEITNTDETITTKRVPNPNFLGNCNIKDFKPPYIYSHVNKVPQNVAGDKTAVKLDTEVKNTNANPVVATDPVAAKPDNLANFSNEVAMNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.3
3	0.3
4	0.37
5	0.38
6	0.36
7	0.35
8	0.31
9	0.27
10	0.24
11	0.24
12	0.17
13	0.16
14	0.14
15	0.13
16	0.12
17	0.07
18	0.08
19	0.1
20	0.12
21	0.16
22	0.23
23	0.28
24	0.3
25	0.38
26	0.39
27	0.38
28	0.43
29	0.43
30	0.38
31	0.35
32	0.37
33	0.31
34	0.28
35	0.29
36	0.25
37	0.2
38	0.19
39	0.17
40	0.14
41	0.13
42	0.14
43	0.13
44	0.12
45	0.13
46	0.17
47	0.19
48	0.22
49	0.24
50	0.32
51	0.39
52	0.43
53	0.48
54	0.54
55	0.61
56	0.65
57	0.68
58	0.63
59	0.61
60	0.63
61	0.6
62	0.54
63	0.48
64	0.45
65	0.43
66	0.38
67	0.35
68	0.31
69	0.32
70	0.36
71	0.35
72	0.33
73	0.31
74	0.31
75	0.29
76	0.28
77	0.24
78	0.17
79	0.17
80	0.2
81	0.2
82	0.2
83	0.19
84	0.19
85	0.19
86	0.2
87	0.18
88	0.14
89	0.14
90	0.14
91	0.17
92	0.18
93	0.18
94	0.17
95	0.19
96	0.17
97	0.17
98	0.17
99	0.16
100	0.16
101	0.17
102	0.21
103	0.19
104	0.18
105	0.19
106	0.19
107	0.18
108	0.16
109	0.15
110	0.1
111	0.09
112	0.08
113	0.06
114	0.05
115	0.04
116	0.04
117	0.04
118	0.03
119	0.04
120	0.04
121	0.04
122	0.05
123	0.05
124	0.08
125	0.1
126	0.1
127	0.14
128	0.19
129	0.2
130	0.2
131	0.2
132	0.2
133	0.18
134	0.19
135	0.15
136	0.13
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.09
141	0.09
142	0.08
143	0.09
144	0.07
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.08
149	0.1
150	0.11
151	0.09
152	0.09
153	0.13
154	0.13
155	0.15
156	0.19
157	0.16
158	0.22
159	0.24
160	0.27
161	0.24
162	0.24
163	0.24
164	0.23
165	0.24
166	0.19
167	0.17
168	0.16
169	0.16
170	0.16
171	0.22
172	0.21
173	0.26
174	0.26
175	0.27
176	0.25
177	0.27
178	0.26
179	0.18
180	0.16
181	0.11
182	0.09
183	0.08
184	0.07
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.06
197	0.07
198	0.1
199	0.1
200	0.13
201	0.2
202	0.22
203	0.23
204	0.25
205	0.3
206	0.35
207	0.43
208	0.47
209	0.48
210	0.51
211	0.52
212	0.51
213	0.49
214	0.46
215	0.44
216	0.37
217	0.35
218	0.33
219	0.32
220	0.31
221	0.28
222	0.23
223	0.21
224	0.21
225	0.22
226	0.19
227	0.2
228	0.22
229	0.28
230	0.34
231	0.36
232	0.43
233	0.38
234	0.41
235	0.42
236	0.4
237	0.37
238	0.31
239	0.27
240	0.18
241	0.18
242	0.17
243	0.16
244	0.16
245	0.14
246	0.13
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.11
251	0.12
252	0.13
253	0.14
254	0.17
255	0.2
256	0.21
257	0.21
258	0.22
259	0.21
260	0.21
261	0.22
262	0.2
263	0.19
264	0.17
265	0.17
266	0.14
267	0.16
268	0.14
269	0.13
270	0.11
271	0.1
272	0.09
273	0.11
274	0.11
275	0.09
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.05
285	0.06
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.05
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.09
306	0.1
307	0.13
308	0.22
309	0.28
310	0.36
311	0.41
312	0.45
313	0.51
314	0.53
315	0.54
316	0.44
317	0.45
318	0.4
319	0.39
320	0.34
321	0.27
322	0.23
323	0.2
324	0.2
325	0.14
326	0.1
327	0.07
328	0.09
329	0.13
330	0.13
331	0.11
332	0.12
333	0.13
334	0.13
335	0.15
336	0.13
337	0.09
338	0.1
339	0.12
340	0.12
341	0.11
342	0.1
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.05
348	0.05
349	0.07
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.1
358	0.19
359	0.24
360	0.25
361	0.28
362	0.38
363	0.39
364	0.43
365	0.43
366	0.39
367	0.36
368	0.37
369	0.37
370	0.31
371	0.31
372	0.29
373	0.25
374	0.21
375	0.18
376	0.17
377	0.16
378	0.12
379	0.13
380	0.16
381	0.19
382	0.23
383	0.24
384	0.29
385	0.31
386	0.4
387	0.47
388	0.5
389	0.48
390	0.5
391	0.5
392	0.47
393	0.43
394	0.37
395	0.35
396	0.34
397	0.36
398	0.4
399	0.48
400	0.49
401	0.52
402	0.53
403	0.52
404	0.48
405	0.44
406	0.4
407	0.37
408	0.35
409	0.31
410	0.28
411	0.23
412	0.21
413	0.24
414	0.26
415	0.19
416	0.22
417	0.23
418	0.23
419	0.23
420	0.27
421	0.27
422	0.26
423	0.28
424	0.3
425	0.32
426	0.31
427	0.33
428	0.32
429	0.32
430	0.31
431	0.3
432	0.27
433	0.25
434	0.31
435	0.33
436	0.32
437	0.29
438	0.26
439	0.27
440	0.29
441	0.29
442	0.29
443	0.28
444	0.29
445	0.32
446	0.35
447	0.34
448	0.39
449	0.42
450	0.4
451	0.4
452	0.36
453	0.34
454	0.31
455	0.34
456	0.26
457	0.23
458	0.2
459	0.16
460	0.19
461	0.19
462	0.17
463	0.14
464	0.12
465	0.11
466	0.12
467	0.13
468	0.1
469	0.11
470	0.16
471	0.18
472	0.23
473	0.3
474	0.33
475	0.43
476	0.53
477	0.63
478	0.69
479	0.76
480	0.83
481	0.85
482	0.93
483	0.94
484	0.93
485	0.89
486	0.83
487	0.8
488	0.74
489	0.67
490	0.57
491	0.52
492	0.47
493	0.43
494	0.39
495	0.32
496	0.31
497	0.32
498	0.37
499	0.37
500	0.42
501	0.44
502	0.52
503	0.57
504	0.53
505	0.52
506	0.5
507	0.44
508	0.39
509	0.4
510	0.35
511	0.33
512	0.33
513	0.3
514	0.3
515	0.3
516	0.26
517	0.19
518	0.17
519	0.15
520	0.15
521	0.16
522	0.12
523	0.15
524	0.16
525	0.16
526	0.16
527	0.16
528	0.17
529	0.2
530	0.23
531	0.22
532	0.26
533	0.33
534	0.4
535	0.42
536	0.48
537	0.51
538	0.56
539	0.56
540	0.52
541	0.53
542	0.5
543	0.5
544	0.47
545	0.44
546	0.35
547	0.42
548	0.42
549	0.41
550	0.43
551	0.43
552	0.42
553	0.48
554	0.55
555	0.49
556	0.56
557	0.55
558	0.55
559	0.55
560	0.54
561	0.49
562	0.46
563	0.47
564	0.4
565	0.36
566	0.31
567	0.31
568	0.27
569	0.25
570	0.24
571	0.2
572	0.18
573	0.18
574	0.23
575	0.28
576	0.33
577	0.35
578	0.34
579	0.41
580	0.41
581	0.45
582	0.42
583	0.35
584	0.3
585	0.29
586	0.29
587	0.22
588	0.24
589	0.18
590	0.17
591	0.18
592	0.2
593	0.18
594	0.16
595	0.19
596	0.23
597	0.24
598	0.25
599	0.26
600	0.26
601	0.27
602	0.27
603	0.27

P43554

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer