FuNGI

O13527

Protein Details

Accession

O13527

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-103	CLIGKSTKHRHIKGSRLKYQNSY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 8.5, cyto_mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0000943 C:retrotransposon nucleocapsid GO:0003677 F:DNA binding GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0046872 F:metal ion binding GO:0008233 F:peptidase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0004540 F:RNA nuclease activity GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0006310 P:DNA recombination GO:0032197 P:retrotransposition
KEGG	sce:YAR009C -
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

METFTGYLKSTCFHQISPYPPSIMSIQVKVHANILILSFIECLRMPMHRQIRYSLKNNTITYFNESDVDWSSAIDYQCPDCLIGKSTKHRHIKGSRLKYQNSYEPFQYLHTDIFGPVHNLPKSAPSYFISFTDETTKLRWVYPLHDRREDSILDVFTTILAFIKNQFQASVLVIQMDRGSEYTNRTLHKFLEKNGITPCYTTTADSRAHGVAERLNRTLLDDCRTQLQCSGLPNHLWFSAIEFSTIVRNSLASPKSKKSARQHAGLAGLDISTLLPFGQPVIVNDHNPNSKIHPRGIPGYALHPSRNSYGYIIYLPSLKKTVDTTNYVILQGKESRLDQFNYDALTFDEDLNRLTASYHSFIASNEIQESNDLNIESDHDFQSDIELHPEQPRNVLSKAVSPTDSTPPSTHTEDSKRVSKTNIRAPREVDPNISESNILPSKKRSSTPQISNIESTGSGGMHKLNVPLLAPMSQSNTHESSHASKSKDFRHSDSYSENETNHTNVPISSTGGTNNKTVPQISDQETEKRIIHRSPSIDASPPENNSSHNIVPIKTPTTVSEQNTEESIIADLPLPDLPPESPTEFPDPFKELPPINSHQTNSSLGGIGDSNAYTTINSKKRSLEDNETEIKVSRDTWNTKNMRSLEPPRSKKRIHLIAAVKAVKSIKPIRTTLRYDEAITYNKDIKEKEKYIEAYHKEVNQLLKMNTWDTDKYYDRKEIDPKRVINSMFIFNKKRDGTHKARFVARGDIQHPDTYDTGMQSNTVHHYALMTSLSLALDNNYYITQLDISSAYLYADIKEELYIRPPPHLGMNDKLIRLKKSLYGLKQSGANWYETIKSYLIKQCGMEEVRGWSCVFKNSQVTICLFVDDMILFSKDLNANKKIITTLKKQYDTKIINLGESDNEIQYDILGLEIKYQRGKYMKLGMEKSLTEKLPKLNVPLNPKGKKLRAPGQPGLYIDQDELEIDEDEYKEKVHEMQKLIGLASYVGYKFRFDLLYYINTLAQHILFPSRQVLDMTYELIQFMWDTRDKQLIWHKNKPTEPDNKLVAISDASYGNQPYYKSQIGNIYLLNGKVIGGKSTKASLTCTSTTEAEIHAISESVPLLNNLSYLIQELNKKPIIKGLLTDSRSTISIIKSTNEEKFRNRFFGTKAMRLRDEVSGNNLYVYYIETKKNIADVMTKPLPIKTFKLLTNKWIH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.36
3	0.41
4	0.47
5	0.46
6	0.4
7	0.38
8	0.39
9	0.34
10	0.35
11	0.33
12	0.3
13	0.29
14	0.33
15	0.36
16	0.34
17	0.35
18	0.29
19	0.26
20	0.23
21	0.21
22	0.16
23	0.13
24	0.13
25	0.12
26	0.1
27	0.12
28	0.1
29	0.11
30	0.12
31	0.16
32	0.2
33	0.29
34	0.38
35	0.42
36	0.44
37	0.5
38	0.59
39	0.63
40	0.66
41	0.65
42	0.64
43	0.67
44	0.66
45	0.62
46	0.55
47	0.5
48	0.49
49	0.43
50	0.35
51	0.28
52	0.26
53	0.26
54	0.26
55	0.25
56	0.17
57	0.15
58	0.15
59	0.18
60	0.18
61	0.18
62	0.17
63	0.16
64	0.18
65	0.18
66	0.18
67	0.17
68	0.18
69	0.21
70	0.25
71	0.31
72	0.4
73	0.48
74	0.57
75	0.64
76	0.67
77	0.73
78	0.75
79	0.79
80	0.8
81	0.81
82	0.81
83	0.8
84	0.8
85	0.77
86	0.75
87	0.73
88	0.68
89	0.62
90	0.55
91	0.48
92	0.44
93	0.39
94	0.36
95	0.29
96	0.24
97	0.21
98	0.2
99	0.18
100	0.19
101	0.18
102	0.17
103	0.18
104	0.25
105	0.24
106	0.24
107	0.24
108	0.28
109	0.31
110	0.28
111	0.29
112	0.24
113	0.28
114	0.29
115	0.3
116	0.29
117	0.25
118	0.26
119	0.29
120	0.28
121	0.25
122	0.26
123	0.29
124	0.25
125	0.25
126	0.28
127	0.24
128	0.29
129	0.39
130	0.45
131	0.48
132	0.54
133	0.55
134	0.54
135	0.56
136	0.5
137	0.42
138	0.38
139	0.31
140	0.24
141	0.23
142	0.19
143	0.15
144	0.14
145	0.11
146	0.07
147	0.06
148	0.06
149	0.08
150	0.15
151	0.16
152	0.17
153	0.17
154	0.17
155	0.19
156	0.2
157	0.2
158	0.14
159	0.14
160	0.13
161	0.14
162	0.13
163	0.12
164	0.11
165	0.09
166	0.11
167	0.12
168	0.16
169	0.22
170	0.26
171	0.28
172	0.3
173	0.32
174	0.33
175	0.41
176	0.4
177	0.37
178	0.44
179	0.42
180	0.43
181	0.45
182	0.45
183	0.36
184	0.33
185	0.31
186	0.25
187	0.25
188	0.23
189	0.21
190	0.22
191	0.24
192	0.24
193	0.25
194	0.21
195	0.21
196	0.2
197	0.19
198	0.2
199	0.24
200	0.27
201	0.25
202	0.25
203	0.24
204	0.26
205	0.3
206	0.28
207	0.25
208	0.24
209	0.24
210	0.31
211	0.33
212	0.3
213	0.28
214	0.27
215	0.26
216	0.28
217	0.31
218	0.26
219	0.27
220	0.27
221	0.27
222	0.24
223	0.22
224	0.18
225	0.17
226	0.19
227	0.16
228	0.16
229	0.14
230	0.14
231	0.18
232	0.18
233	0.16
234	0.11
235	0.12
236	0.13
237	0.2
238	0.23
239	0.25
240	0.31
241	0.35
242	0.43
243	0.47
244	0.54
245	0.57
246	0.65
247	0.64
248	0.64
249	0.62
250	0.59
251	0.58
252	0.49
253	0.4
254	0.28
255	0.22
256	0.16
257	0.13
258	0.09
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.03
263	0.04
264	0.04
265	0.06
266	0.07
267	0.08
268	0.15
269	0.17
270	0.19
271	0.22
272	0.26
273	0.27
274	0.28
275	0.28
276	0.27
277	0.32
278	0.34
279	0.36
280	0.36
281	0.37
282	0.4
283	0.4
284	0.37
285	0.31
286	0.31
287	0.32
288	0.29
289	0.27
290	0.24
291	0.25
292	0.24
293	0.25
294	0.22
295	0.18
296	0.17
297	0.17
298	0.17
299	0.15
300	0.13
301	0.16
302	0.15
303	0.15
304	0.16
305	0.14
306	0.15
307	0.17
308	0.23
309	0.24
310	0.28
311	0.28
312	0.31
313	0.32
314	0.31
315	0.31
316	0.25
317	0.24
318	0.22
319	0.2
320	0.18
321	0.18
322	0.21
323	0.22
324	0.23
325	0.21
326	0.21
327	0.21
328	0.2
329	0.19
330	0.16
331	0.13
332	0.15
333	0.14
334	0.12
335	0.12
336	0.11
337	0.12
338	0.12
339	0.11
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.11
344	0.12
345	0.12
346	0.12
347	0.13
348	0.13
349	0.18
350	0.17
351	0.14
352	0.14
353	0.14
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.11
358	0.11
359	0.1
360	0.09
361	0.08
362	0.1
363	0.11
364	0.12
365	0.12
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.13
370	0.12
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.14
375	0.19
376	0.22
377	0.2
378	0.21
379	0.23
380	0.24
381	0.23
382	0.25
383	0.2
384	0.22
385	0.25
386	0.24
387	0.23
388	0.2
389	0.23
390	0.26
391	0.27
392	0.24
393	0.22
394	0.23
395	0.27
396	0.28
397	0.27
398	0.26
399	0.3
400	0.34
401	0.38
402	0.42
403	0.39
404	0.38
405	0.41
406	0.43
407	0.44
408	0.48
409	0.53
410	0.51
411	0.52
412	0.53
413	0.55
414	0.55
415	0.49
416	0.41
417	0.33
418	0.32
419	0.29
420	0.27
421	0.2
422	0.14
423	0.18
424	0.2
425	0.19
426	0.17
427	0.21
428	0.27
429	0.3
430	0.32
431	0.32
432	0.38
433	0.47
434	0.52
435	0.58
436	0.56
437	0.55
438	0.53
439	0.47
440	0.38
441	0.29
442	0.22
443	0.13
444	0.09
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.09
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.11
460	0.12
461	0.13
462	0.16
463	0.17
464	0.16
465	0.16
466	0.18
467	0.19
468	0.24
469	0.28
470	0.26
471	0.28
472	0.33
473	0.4
474	0.46
475	0.45
476	0.42
477	0.45
478	0.45
479	0.45
480	0.43
481	0.38
482	0.34
483	0.33
484	0.29
485	0.23
486	0.22
487	0.21
488	0.19
489	0.16
490	0.12
491	0.1
492	0.12
493	0.11
494	0.11
495	0.1
496	0.1
497	0.12
498	0.15
499	0.16
500	0.15
501	0.16
502	0.17
503	0.17
504	0.17
505	0.16
506	0.15
507	0.18
508	0.2
509	0.23
510	0.22
511	0.25
512	0.26
513	0.27
514	0.25
515	0.24
516	0.23
517	0.21
518	0.23
519	0.24
520	0.25
521	0.25
522	0.26
523	0.25
524	0.25
525	0.24
526	0.24
527	0.22
528	0.21
529	0.21
530	0.19
531	0.18
532	0.19
533	0.22
534	0.18
535	0.19
536	0.19
537	0.18
538	0.19
539	0.19
540	0.18
541	0.15
542	0.16
543	0.14
544	0.19
545	0.23
546	0.23
547	0.25
548	0.24
549	0.24
550	0.24
551	0.22
552	0.16
553	0.12
554	0.11
555	0.06
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.06
566	0.08
567	0.1
568	0.1
569	0.13
570	0.17
571	0.18
572	0.18
573	0.19
574	0.22
575	0.2
576	0.21
577	0.22
578	0.18
579	0.19
580	0.23
581	0.24
582	0.23
583	0.24
584	0.24
585	0.22
586	0.24
587	0.23
588	0.19
589	0.17
590	0.13
591	0.11
592	0.11
593	0.09
594	0.07
595	0.06
596	0.05
597	0.05
598	0.04
599	0.05
600	0.04
601	0.06
602	0.14
603	0.19
604	0.21
605	0.23
606	0.25
607	0.28
608	0.33
609	0.36
610	0.37
611	0.35
612	0.38
613	0.39
614	0.37
615	0.35
616	0.3
617	0.25
618	0.18
619	0.16
620	0.14
621	0.17
622	0.21
623	0.23
624	0.32
625	0.34
626	0.34
627	0.39
628	0.38
629	0.36
630	0.38
631	0.42
632	0.43
633	0.51
634	0.57
635	0.59
636	0.63
637	0.61
638	0.6
639	0.63
640	0.61
641	0.54
642	0.54
643	0.51
644	0.49
645	0.54
646	0.49
647	0.4
648	0.33
649	0.31
650	0.23
651	0.24
652	0.25
653	0.23
654	0.26
655	0.29
656	0.33
657	0.38
658	0.41
659	0.4
660	0.4
661	0.36
662	0.33
663	0.33
664	0.31
665	0.27
666	0.25
667	0.23
668	0.22
669	0.22
670	0.23
671	0.22
672	0.23
673	0.28
674	0.3
675	0.29
676	0.3
677	0.31
678	0.32
679	0.4
680	0.38
681	0.34
682	0.35
683	0.34
684	0.3
685	0.31
686	0.29
687	0.23
688	0.23
689	0.19
690	0.19
691	0.18
692	0.18
693	0.16
694	0.17
695	0.16
696	0.14
697	0.19
698	0.2
699	0.22
700	0.25
701	0.29
702	0.29
703	0.33
704	0.4
705	0.43
706	0.49
707	0.53
708	0.52
709	0.5
710	0.52
711	0.48
712	0.42
713	0.37
714	0.34
715	0.31
716	0.33
717	0.33
718	0.29
719	0.36
720	0.33
721	0.33
722	0.33
723	0.38
724	0.42
725	0.47
726	0.54
727	0.51
728	0.54
729	0.54
730	0.5
731	0.48
732	0.42
733	0.38
734	0.32
735	0.32
736	0.3
737	0.29
738	0.27
739	0.23
740	0.2
741	0.17
742	0.16
743	0.13
744	0.12
745	0.11
746	0.11
747	0.09
748	0.1
749	0.12
750	0.12
751	0.11
752	0.1
753	0.1
754	0.1
755	0.1
756	0.09
757	0.06
758	0.05
759	0.06
760	0.06
761	0.06
762	0.06
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.06
767	0.06
768	0.06
769	0.06
770	0.06
771	0.06
772	0.05
773	0.06
774	0.06
775	0.06
776	0.07
777	0.07
778	0.06
779	0.07
780	0.07
781	0.06
782	0.07
783	0.07
784	0.07
785	0.07
786	0.08
787	0.08
788	0.12
789	0.16
790	0.16
791	0.17
792	0.18
793	0.18
794	0.21
795	0.24
796	0.24
797	0.23
798	0.3
799	0.31
800	0.32
801	0.35
802	0.34
803	0.33
804	0.31
805	0.3
806	0.26
807	0.3
808	0.36
809	0.36
810	0.41
811	0.4
812	0.4
813	0.42
814	0.39
815	0.38
816	0.32
817	0.29
818	0.21
819	0.21
820	0.21
821	0.19
822	0.2
823	0.15
824	0.14
825	0.18
826	0.23
827	0.24
828	0.24
829	0.23
830	0.22
831	0.27
832	0.28
833	0.23
834	0.19
835	0.21
836	0.2
837	0.21
838	0.2
839	0.16
840	0.16
841	0.19
842	0.2
843	0.19
844	0.23
845	0.24
846	0.26
847	0.27
848	0.27
849	0.27
850	0.25
851	0.22
852	0.17
853	0.15
854	0.13
855	0.11
856	0.1
857	0.07
858	0.07
859	0.07
860	0.07
861	0.1
862	0.13
863	0.17
864	0.22
865	0.23
866	0.24
867	0.25
868	0.26
869	0.25
870	0.28
871	0.3
872	0.32
873	0.39
874	0.46
875	0.52
876	0.53
877	0.54
878	0.58
879	0.55
880	0.51
881	0.49
882	0.41
883	0.35
884	0.34
885	0.31
886	0.22
887	0.21
888	0.2
889	0.12
890	0.11
891	0.11
892	0.1
893	0.09
894	0.09
895	0.06
896	0.05
897	0.06
898	0.06
899	0.11
900	0.13
901	0.16
902	0.19
903	0.19
904	0.24
905	0.26
906	0.29
907	0.29
908	0.36
909	0.39
910	0.43
911	0.45
912	0.43
913	0.43
914	0.41
915	0.4
916	0.36
917	0.32
918	0.27
919	0.28
920	0.29
921	0.32
922	0.33
923	0.34
924	0.34
925	0.38
926	0.43
927	0.5
928	0.56
929	0.53
930	0.57
931	0.6
932	0.61
933	0.63
934	0.63
935	0.63
936	0.62
937	0.67
938	0.68
939	0.64
940	0.62
941	0.56
942	0.51
943	0.43
944	0.35
945	0.26
946	0.2
947	0.15
948	0.12
949	0.1
950	0.09
951	0.08
952	0.08
953	0.09
954	0.09
955	0.1
956	0.11
957	0.1
958	0.09
959	0.1
960	0.16
961	0.2
962	0.26
963	0.28
964	0.32
965	0.34
966	0.34
967	0.34
968	0.27
969	0.22
970	0.16
971	0.13
972	0.12
973	0.1
974	0.11
975	0.12
976	0.12
977	0.13
978	0.15
979	0.15
980	0.13
981	0.17
982	0.19
983	0.21
984	0.23
985	0.23
986	0.22
987	0.21
988	0.21
989	0.18
990	0.15
991	0.12
992	0.11
993	0.14
994	0.12
995	0.13
996	0.16
997	0.16
998	0.17
999	0.17
1000	0.17
1001	0.17
1002	0.18
1003	0.19
1004	0.17
1005	0.16
1006	0.15
1007	0.14
1008	0.13
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.12
1012	0.14
1013	0.16
1014	0.19
1015	0.24
1016	0.24
1017	0.31
1018	0.4
1019	0.46
1020	0.52
1021	0.59
1022	0.65
1023	0.68
1024	0.72
1025	0.72
1026	0.7
1027	0.7
1028	0.66
1029	0.63
1030	0.59
1031	0.52
1032	0.48
1033	0.42
1034	0.34
1035	0.25
1036	0.21
1037	0.16
1038	0.13
1039	0.12
1040	0.13
1041	0.13
1042	0.14
1043	0.15
1044	0.16
1045	0.17
1046	0.22
1047	0.25
1048	0.24
1049	0.27
1050	0.33
1051	0.34
1052	0.35
1053	0.32
1054	0.29
1055	0.28
1056	0.27
1057	0.24
1058	0.16
1059	0.14
1060	0.15
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.15
1064	0.16
1065	0.18
1066	0.21
1067	0.23
1068	0.2
1069	0.24
1070	0.25
1071	0.3
1072	0.3
1073	0.3
1074	0.3
1075	0.29
1076	0.29
1077	0.26
1078	0.22
1079	0.18
1080	0.16
1081	0.15
1082	0.12
1083	0.11
1084	0.1
1085	0.1
1086	0.09
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.08
1090	0.1
1091	0.1
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.1
1095	0.09
1096	0.1
1097	0.12
1098	0.14
1099	0.21
1100	0.23
1101	0.3
1102	0.34
1103	0.35
1104	0.34
1105	0.38
1106	0.4
1107	0.34
1108	0.35
1109	0.36
1110	0.4
1111	0.41
1112	0.42
1113	0.38
1114	0.34
1115	0.34
1116	0.32
1117	0.27
1118	0.2
1119	0.23
1120	0.23
1121	0.24
1122	0.27
1123	0.31
1124	0.37
1125	0.41
1126	0.44
1127	0.47
1128	0.55
1129	0.59
1130	0.6
1131	0.59
1132	0.56
1133	0.52
1134	0.57
1135	0.57
1136	0.57
1137	0.58
1138	0.59
1139	0.58
1140	0.56
1141	0.55
1142	0.51
1143	0.48
1144	0.41
1145	0.4
1146	0.36
1147	0.34
1148	0.32
1149	0.29
1150	0.22
1151	0.18
1152	0.19
1153	0.18
1154	0.19
1155	0.22
1156	0.23
1157	0.25
1158	0.26
1159	0.28
1160	0.26
1161	0.23
1162	0.25
1163	0.25
1164	0.32
1165	0.34
1166	0.35
1167	0.34
1168	0.36
1169	0.38
1170	0.36
1171	0.38
1172	0.36
1173	0.39
1174	0.43
1175	0.52
1176	0.51

O13527

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer