FuNGI

P54839

Protein Details

Accession

P54839

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-51	STKLCWCGIKGRLRPQKQQQLHNTNLQMTELKKQKTAEQKTRPQNVGI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, mito 11, cyto_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000590 HMG_CoA_synt_AS IPR013746 HMG_CoA_synt_C_dom IPR013528 HMG_CoA_synth_N IPR010122 HMG_CoA_synthase_euk IPR016039 Thiolase-like
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0004421 F:hydroxymethylglutaryl-CoA synthase activity GO:0006084 P:acetyl-CoA metabolic process GO:0006696 P:ergosterol biosynthetic process GO:0010142 P:farnesyl diphosphate biosynthetic process, mevalonate pathway
KEGG	sce:YML126C -
Pfam	View protein in Pfam PF08540 HMG_CoA_synt_C PF01154 HMG_CoA_synt_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS01226 HMG_COA_SYNTHASE
CDD	cd00827 init_cond_enzymes

Amino Acid Sequences

MKLSTKLCWCGIKGRLRPQKQQQLHNTNLQMTELKKQKTAEQKTRPQNVGIKGIQIYIPTQCVNQSELEKFDGVSQGKYTIGLGQTNMSFVNDREDIYSMSLTVLSKLIKSYNIDTNKIGRLEVGTETLIDKSKSVKSVLMQLFGENTDVEGIDTLNACYGGTNALFNSLNWIESNAWDGRDAIVVCGDIAIYDKGAARPTGGAGTVAMWIGPDAPIVFDSVRASYMEHAYDFYKPDFTSEYPYVDGHFSLTCYVKALDQVYKSYSKKAISKGLVSDPAGSDALNVLKYFDYNVFHVPTCKLVTKSYGRLLYNDFRANPQLFPEVDAELATRDYDESLTDKNIEKTFVNVAKPFHKERVAQSLIVPTNTGNMYTASVYAAFASLLNYVGSDDLQGKRVGLFSYGSGLAASLYSCKIVGDVQHIIKELDITNKLAKRITETPKDYEAAIELRENAHLKKNFKPQGSIEHLQSGVYYLTNIDDKFRRSYDVKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.69
3	0.73
4	0.8
5	0.83
6	0.86
7	0.84
8	0.85
9	0.85
10	0.84
11	0.82
12	0.8
13	0.73
14	0.65
15	0.58
16	0.49
17	0.42
18	0.35
19	0.38
20	0.38
21	0.37
22	0.37
23	0.39
24	0.44
25	0.51
26	0.6
27	0.62
28	0.64
29	0.72
30	0.78
31	0.86
32	0.81
33	0.76
34	0.73
35	0.67
36	0.65
37	0.56
38	0.5
39	0.41
40	0.4
41	0.35
42	0.28
43	0.24
44	0.18
45	0.19
46	0.16
47	0.16
48	0.17
49	0.18
50	0.19
51	0.21
52	0.23
53	0.23
54	0.24
55	0.26
56	0.24
57	0.22
58	0.22
59	0.25
60	0.22
61	0.21
62	0.2
63	0.19
64	0.18
65	0.19
66	0.17
67	0.14
68	0.15
69	0.15
70	0.14
71	0.16
72	0.15
73	0.16
74	0.16
75	0.13
76	0.12
77	0.11
78	0.16
79	0.14
80	0.15
81	0.16
82	0.17
83	0.16
84	0.17
85	0.17
86	0.12
87	0.11
88	0.12
89	0.11
90	0.1
91	0.12
92	0.1
93	0.11
94	0.12
95	0.13
96	0.14
97	0.17
98	0.21
99	0.27
100	0.31
101	0.33
102	0.34
103	0.37
104	0.39
105	0.36
106	0.32
107	0.23
108	0.2
109	0.19
110	0.18
111	0.16
112	0.11
113	0.11
114	0.12
115	0.13
116	0.14
117	0.12
118	0.11
119	0.13
120	0.16
121	0.18
122	0.19
123	0.2
124	0.19
125	0.29
126	0.3
127	0.3
128	0.27
129	0.25
130	0.24
131	0.22
132	0.21
133	0.11
134	0.1
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.06
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.05
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.14
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.15
160	0.12
161	0.12
162	0.16
163	0.11
164	0.12
165	0.11
166	0.12
167	0.1
168	0.12
169	0.12
170	0.09
171	0.08
172	0.08
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.04
177	0.05
178	0.05
179	0.04
180	0.05
181	0.06
182	0.07
183	0.09
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.04
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.08
216	0.09
217	0.09
218	0.11
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.11
223	0.12
224	0.13
225	0.13
226	0.17
227	0.17
228	0.18
229	0.17
230	0.17
231	0.17
232	0.15
233	0.14
234	0.09
235	0.08
236	0.07
237	0.08
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.09
242	0.08
243	0.1
244	0.11
245	0.12
246	0.13
247	0.14
248	0.15
249	0.21
250	0.21
251	0.23
252	0.24
253	0.25
254	0.29
255	0.31
256	0.36
257	0.33
258	0.34
259	0.34
260	0.33
261	0.33
262	0.28
263	0.25
264	0.18
265	0.17
266	0.15
267	0.12
268	0.1
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.07
276	0.08
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.13
281	0.14
282	0.14
283	0.16
284	0.16
285	0.16
286	0.17
287	0.18
288	0.17
289	0.16
290	0.22
291	0.25
292	0.29
293	0.32
294	0.35
295	0.33
296	0.33
297	0.38
298	0.36
299	0.36
300	0.35
301	0.3
302	0.26
303	0.31
304	0.3
305	0.25
306	0.23
307	0.21
308	0.18
309	0.2
310	0.19
311	0.15
312	0.14
313	0.14
314	0.12
315	0.09
316	0.09
317	0.07
318	0.06
319	0.05
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.08
324	0.09
325	0.1
326	0.12
327	0.14
328	0.18
329	0.19
330	0.2
331	0.18
332	0.19
333	0.25
334	0.27
335	0.28
336	0.26
337	0.28
338	0.32
339	0.37
340	0.38
341	0.36
342	0.37
343	0.37
344	0.39
345	0.46
346	0.42
347	0.38
348	0.36
349	0.39
350	0.35
351	0.32
352	0.29
353	0.18
354	0.19
355	0.18
356	0.17
357	0.1
358	0.1
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.1
379	0.11
380	0.13
381	0.13
382	0.13
383	0.14
384	0.16
385	0.15
386	0.13
387	0.12
388	0.11
389	0.14
390	0.14
391	0.13
392	0.11
393	0.11
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.09
404	0.11
405	0.15
406	0.2
407	0.22
408	0.24
409	0.25
410	0.25
411	0.23
412	0.23
413	0.19
414	0.2
415	0.2
416	0.21
417	0.27
418	0.3
419	0.32
420	0.32
421	0.31
422	0.32
423	0.4
424	0.46
425	0.48
426	0.5
427	0.54
428	0.55
429	0.55
430	0.48
431	0.4
432	0.34
433	0.26
434	0.23
435	0.19
436	0.16
437	0.16
438	0.2
439	0.22
440	0.22
441	0.29
442	0.34
443	0.36
444	0.43
445	0.53
446	0.57
447	0.58
448	0.61
449	0.56
450	0.6
451	0.65
452	0.61
453	0.53
454	0.5
455	0.47
456	0.41
457	0.37
458	0.28
459	0.2
460	0.16
461	0.13
462	0.08
463	0.11
464	0.15
465	0.15
466	0.19
467	0.23
468	0.27
469	0.32
470	0.33
471	0.37

P54839

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer