Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P49626

Protein Details
Accession P49626    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-120FAPTKTWRKWNVKVNHNEKRYHydrophilic
181-208VLKSKKLRAGKGKYRNRRWTQRRGPLVVHydrophilic
303-326GQATQKRTHVLKKNPLKNKQVLLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-202KSKKLRAGKGKYRNRRWTQR
Subcellular Location(s) extr 19, cyto 3, mito 2, cyto_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025755  Ribos_L4_C_dom  
IPR002136  Ribosomal_L4/L1e  
IPR013000  Ribosomal_L4/L1e_euk/arc_CS  
IPR023574  Ribosomal_L4_dom_sf  
IPR045240  Ribosomal_L4_euk/arch  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0002181  P:cytoplasmic translation  
KEGG sce:YDR012W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14374  Ribos_L4_asso_C  
PF00573  Ribosomal_L4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00939  RIBOSOMAL_L1E  
Amino Acid Sequences MSRPQVTVHSLTGEATANALPLPAVFSAPIRPDIVHTVFTSVNKNKRQAYAVSEKAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVGGGGTGRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRKWNVKVNHNEKRYATASAIAATAVASLVLARGHRVEKIPEIPLVVSTDLESIQKTKEAVAALKAVGAHSDLLKVLKSKKLRAGKGKYRNRRWTQRRGPLVVYAEDNGIVKALRNVPGVETANVASLNLLQLAPGAHLGRFVIWTEAAFTKLDQVWGSETVASSKVGYTLPSHIISTSDVTRIINSSEIQSAIRPAGQATQKRTHVLKKNPLKNKQVLLRLNPYAKVFAAEKLGSKKAEKTGTKPAAVFAETLKHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.13
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.07
8 0.06
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.09
14 0.13
15 0.16
16 0.19
17 0.18
18 0.18
19 0.2
20 0.26
21 0.28
22 0.26
23 0.24
24 0.25
25 0.26
26 0.27
27 0.33
28 0.34
29 0.4
30 0.44
31 0.5
32 0.52
33 0.54
34 0.56
35 0.5
36 0.51
37 0.52
38 0.5
39 0.48
40 0.45
41 0.41
42 0.42
43 0.4
44 0.32
45 0.22
46 0.19
47 0.17
48 0.22
49 0.21
50 0.16
51 0.15
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.12
57 0.16
58 0.19
59 0.22
60 0.22
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.2
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.11
84 0.12
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.26
89 0.33
90 0.41
91 0.43
92 0.49
93 0.53
94 0.58
95 0.65
96 0.67
97 0.69
98 0.7
99 0.77
100 0.8
101 0.8
102 0.75
103 0.71
104 0.62
105 0.58
106 0.5
107 0.42
108 0.32
109 0.26
110 0.23
111 0.19
112 0.19
113 0.13
114 0.11
115 0.08
116 0.07
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.02
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.11
129 0.13
130 0.15
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.18
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.12
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.08
168 0.1
169 0.15
170 0.18
171 0.21
172 0.29
173 0.36
174 0.42
175 0.5
176 0.57
177 0.62
178 0.7
179 0.77
180 0.79
181 0.81
182 0.85
183 0.84
184 0.86
185 0.84
186 0.85
187 0.85
188 0.84
189 0.8
190 0.73
191 0.67
192 0.6
193 0.54
194 0.44
195 0.34
196 0.26
197 0.19
198 0.16
199 0.14
200 0.1
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.08
205 0.1
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.19
211 0.2
212 0.17
213 0.16
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.14
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.14
263 0.17
264 0.18
265 0.18
266 0.16
267 0.17
268 0.17
269 0.18
270 0.16
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.15
282 0.14
283 0.14
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.12
288 0.11
289 0.17
290 0.24
291 0.29
292 0.34
293 0.41
294 0.43
295 0.48
296 0.52
297 0.55
298 0.58
299 0.62
300 0.66
301 0.68
302 0.76
303 0.81
304 0.85
305 0.84
306 0.82
307 0.8
308 0.78
309 0.77
310 0.74
311 0.71
312 0.7
313 0.68
314 0.64
315 0.59
316 0.52
317 0.45
318 0.38
319 0.34
320 0.28
321 0.23
322 0.25
323 0.24
324 0.27
325 0.3
326 0.35
327 0.34
328 0.36
329 0.39
330 0.41
331 0.49
332 0.49
333 0.49
334 0.56
335 0.6
336 0.61
337 0.56
338 0.51
339 0.46
340 0.42
341 0.37
342 0.28