FuNGI

P40041

Protein Details

Accession

P40041

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
95-125	VTAAVQSVRRNRKRSKKKLLDSKKKIARGKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
103-126	RRNRKRSKKKLLDSKKKIARGKVQ

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007147 TF_Vhr
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
KEGG	sce:YER064C -
Pfam	View protein in Pfam PF04001 Vhr1

Amino Acid Sequences

MIDDTENSKIHLEGSHKTGKYTGYGTTHKIRAQLNFNDEKKWKKFSSRRLELIDSFGLSQHKASEQDDNIRQIATILRSEFEYPDTFSAEFEKLVTAAVQSVRRNRKRSKKKLLDSKKKIARGKVQKIPLSPPSSSNMGSCSASNASSSDEEASVKEEPAEHALPSLNTITSQKLLPYPNGRTLPPVPTQVRSLLKKNASLLRDPSAPYAHGGDEKLQKFDIEDQPLESEQEYDFIAKSIIVEIVNNAIPLPEQIQRDKFIRPNLTKKKGCQSKVVISNNLRKLILSKIHNSRTCLEMSKDERNLDSFANLETLGKNSLMASISLVVENSFSHLPSSTKQYLTERLSSIEFLTILSQRLFMPATRQLFADLSQEKIQVRVLNLILGSLVKDYGFDASLAPINEIIYHMTLHQYPLVCSNKQSNPMRPHSTSEVLSAHSSTKDASTPGKEEPRVTRSSTSADSTIITLPSIEVPNTYDDDRLKMLSAISLQIENSTFSKPFSTISK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.36
3	0.36
4	0.37
5	0.38
6	0.35
7	0.35
8	0.33
9	0.32
10	0.3
11	0.34
12	0.38
13	0.43
14	0.47
15	0.45
16	0.48
17	0.47
18	0.47
19	0.51
20	0.53
21	0.53
22	0.58
23	0.57
24	0.59
25	0.6
26	0.63
27	0.6
28	0.61
29	0.58
30	0.59
31	0.67
32	0.7
33	0.76
34	0.76
35	0.78
36	0.76
37	0.77
38	0.68
39	0.64
40	0.55
41	0.45
42	0.35
43	0.31
44	0.26
45	0.2
46	0.19
47	0.16
48	0.17
49	0.18
50	0.2
51	0.25
52	0.27
53	0.35
54	0.39
55	0.41
56	0.38
57	0.36
58	0.33
59	0.27
60	0.27
61	0.21
62	0.2
63	0.17
64	0.17
65	0.18
66	0.2
67	0.2
68	0.19
69	0.18
70	0.17
71	0.17
72	0.19
73	0.18
74	0.17
75	0.19
76	0.17
77	0.16
78	0.14
79	0.13
80	0.1
81	0.11
82	0.1
83	0.07
84	0.09
85	0.13
86	0.17
87	0.21
88	0.3
89	0.41
90	0.49
91	0.57
92	0.64
93	0.72
94	0.78
95	0.85
96	0.88
97	0.88
98	0.9
99	0.93
100	0.95
101	0.95
102	0.93
103	0.92
104	0.89
105	0.86
106	0.82
107	0.78
108	0.78
109	0.77
110	0.77
111	0.75
112	0.75
113	0.7
114	0.67
115	0.65
116	0.63
117	0.56
118	0.48
119	0.42
120	0.37
121	0.36
122	0.34
123	0.28
124	0.22
125	0.2
126	0.2
127	0.17
128	0.17
129	0.15
130	0.14
131	0.14
132	0.12
133	0.13
134	0.12
135	0.13
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.11
140	0.13
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.14
147	0.15
148	0.12
149	0.12
150	0.13
151	0.13
152	0.14
153	0.13
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.15
162	0.16
163	0.2
164	0.25
165	0.27
166	0.33
167	0.35
168	0.34
169	0.34
170	0.35
171	0.35
172	0.32
173	0.35
174	0.3
175	0.3
176	0.31
177	0.32
178	0.36
179	0.35
180	0.37
181	0.37
182	0.37
183	0.38
184	0.4
185	0.4
186	0.36
187	0.35
188	0.33
189	0.29
190	0.29
191	0.28
192	0.26
193	0.21
194	0.19
195	0.17
196	0.16
197	0.13
198	0.13
199	0.12
200	0.15
201	0.21
202	0.21
203	0.21
204	0.2
205	0.19
206	0.19
207	0.24
208	0.25
209	0.21
210	0.21
211	0.2
212	0.22
213	0.22
214	0.22
215	0.16
216	0.11
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.07
239	0.1
240	0.11
241	0.14
242	0.16
243	0.18
244	0.2
245	0.23
246	0.25
247	0.26
248	0.33
249	0.36
250	0.45
251	0.52
252	0.6
253	0.6
254	0.6
255	0.64
256	0.64
257	0.62
258	0.58
259	0.54
260	0.53
261	0.59
262	0.59
263	0.55
264	0.52
265	0.58
266	0.54
267	0.5
268	0.42
269	0.32
270	0.3
271	0.29
272	0.3
273	0.25
274	0.28
275	0.34
276	0.42
277	0.44
278	0.45
279	0.42
280	0.38
281	0.36
282	0.32
283	0.26
284	0.25
285	0.28
286	0.32
287	0.33
288	0.32
289	0.31
290	0.3
291	0.3
292	0.23
293	0.19
294	0.13
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.1
322	0.11
323	0.19
324	0.2
325	0.21
326	0.24
327	0.26
328	0.33
329	0.35
330	0.38
331	0.31
332	0.29
333	0.29
334	0.27
335	0.24
336	0.17
337	0.13
338	0.1
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.11
343	0.11
344	0.1
345	0.12
346	0.12
347	0.11
348	0.14
349	0.19
350	0.22
351	0.22
352	0.22
353	0.22
354	0.22
355	0.23
356	0.25
357	0.19
358	0.2
359	0.21
360	0.23
361	0.21
362	0.22
363	0.23
364	0.19
365	0.19
366	0.2
367	0.19
368	0.18
369	0.17
370	0.16
371	0.14
372	0.11
373	0.11
374	0.07
375	0.07
376	0.05
377	0.05
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.11
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.1
396	0.11
397	0.12
398	0.14
399	0.14
400	0.14
401	0.22
402	0.26
403	0.25
404	0.27
405	0.34
406	0.36
407	0.45
408	0.5
409	0.51
410	0.56
411	0.63
412	0.68
413	0.63
414	0.63
415	0.6
416	0.58
417	0.49
418	0.45
419	0.38
420	0.32
421	0.31
422	0.26
423	0.22
424	0.18
425	0.18
426	0.15
427	0.15
428	0.14
429	0.16
430	0.2
431	0.22
432	0.25
433	0.32
434	0.39
435	0.4
436	0.43
437	0.48
438	0.49
439	0.49
440	0.5
441	0.46
442	0.41
443	0.44
444	0.42
445	0.38
446	0.33
447	0.3
448	0.27
449	0.25
450	0.24
451	0.19
452	0.16
453	0.12
454	0.12
455	0.15
456	0.16
457	0.14
458	0.12
459	0.14
460	0.17
461	0.2
462	0.2
463	0.2
464	0.2
465	0.23
466	0.24
467	0.24
468	0.22
469	0.2
470	0.19
471	0.18
472	0.18
473	0.17
474	0.17
475	0.17
476	0.16
477	0.17
478	0.17
479	0.17
480	0.17
481	0.19
482	0.17
483	0.18
484	0.2
485	0.19

P40041

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer