Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38140

Protein Details
Accession P38140    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-45DTSANTNHTLEKKKRKKRKNTNVACVNCSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-34KKKRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013767  PAS_fold  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0001227  F:DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0009267  P:cellular response to starvation  
GO:0006094  P:gluconeogenesis  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0061415  P:negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by a nonfermentable carbon source  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0061414  P:positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by a nonfermentable carbon source  
KEGG sce:YBR239C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00989  PAS  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50112  PAS  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
cd00130  PAS  
Amino Acid Sequences MCTPDENDYKTSTDPDTSANTNHTLEKKKRKKRKNTNVACVNCSRLHVSCEAKRPCLRCISKGLTATCVDAPRKKSKYLAGIPNRELPMNIQPDLPPRKIMIPIYNNSSNSSLNVNNMGEQQKFTSPQHIVHKAKFLSNAADSEYSILSNIIYQDTLSNKIPIDILYSNTNSTSNSTIGNSSNNSPTGTNTSPEETEMEKIRQLYSEQRANIPPHPYPSSNQNVYSILLGPNSAKIVASQVNLFANHFPLVPVDSADNSLNFKRLLPRDPSEKSSQINWDSSINQYYLNSETVTFPELAIPLKRRKNHLVSVSLESCSPDAANIKSNVEWEHSLRYSTPMEIYTSINAPFSHTPGFHHLLVYLKHRFNQQDLVKMCRSIAEFRPIFIACSVTLTEEDMIFMEQCYQRTLLEYVKFIAQIGTPTCIWRRNGQISYVNEEFEILCGWTREELLNKMTFIVEIMDDESVRDYFKTLSKVAYRDFRGSEKMKVCRLLSPIKGKIIHCCCMWTLKRDVSGLPLMILGNFMPILN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.28
4 0.28
5 0.29
6 0.29
7 0.29
8 0.29
9 0.33
10 0.37
11 0.42
12 0.49
13 0.58
14 0.66
15 0.73
16 0.82
17 0.87
18 0.92
19 0.94
20 0.95
21 0.95
22 0.95
23 0.95
24 0.95
25 0.89
26 0.83
27 0.75
28 0.69
29 0.59
30 0.51
31 0.44
32 0.35
33 0.33
34 0.34
35 0.38
36 0.39
37 0.48
38 0.5
39 0.54
40 0.58
41 0.58
42 0.57
43 0.6
44 0.58
45 0.53
46 0.57
47 0.56
48 0.56
49 0.59
50 0.55
51 0.49
52 0.45
53 0.43
54 0.37
55 0.36
56 0.34
57 0.35
58 0.4
59 0.46
60 0.49
61 0.49
62 0.51
63 0.52
64 0.57
65 0.6
66 0.65
67 0.64
68 0.68
69 0.69
70 0.7
71 0.65
72 0.55
73 0.46
74 0.39
75 0.37
76 0.33
77 0.31
78 0.25
79 0.25
80 0.34
81 0.4
82 0.38
83 0.32
84 0.29
85 0.31
86 0.34
87 0.36
88 0.36
89 0.37
90 0.39
91 0.44
92 0.47
93 0.45
94 0.43
95 0.42
96 0.33
97 0.28
98 0.28
99 0.22
100 0.19
101 0.21
102 0.19
103 0.18
104 0.22
105 0.24
106 0.21
107 0.21
108 0.21
109 0.21
110 0.24
111 0.24
112 0.27
113 0.26
114 0.31
115 0.39
116 0.46
117 0.47
118 0.46
119 0.53
120 0.47
121 0.48
122 0.45
123 0.37
124 0.32
125 0.29
126 0.27
127 0.22
128 0.21
129 0.19
130 0.17
131 0.16
132 0.12
133 0.1
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.09
142 0.1
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.13
150 0.16
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.18
171 0.18
172 0.16
173 0.17
174 0.21
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.19
179 0.18
180 0.19
181 0.19
182 0.14
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.21
192 0.24
193 0.28
194 0.28
195 0.3
196 0.34
197 0.36
198 0.38
199 0.35
200 0.3
201 0.3
202 0.32
203 0.3
204 0.28
205 0.32
206 0.34
207 0.32
208 0.32
209 0.29
210 0.27
211 0.26
212 0.25
213 0.19
214 0.13
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.15
251 0.18
252 0.22
253 0.25
254 0.28
255 0.33
256 0.35
257 0.39
258 0.37
259 0.37
260 0.34
261 0.32
262 0.34
263 0.29
264 0.28
265 0.25
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.19
270 0.14
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.15
288 0.21
289 0.27
290 0.3
291 0.35
292 0.42
293 0.47
294 0.51
295 0.52
296 0.5
297 0.47
298 0.5
299 0.46
300 0.38
301 0.32
302 0.26
303 0.2
304 0.15
305 0.12
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.16
315 0.16
316 0.17
317 0.14
318 0.18
319 0.17
320 0.18
321 0.17
322 0.19
323 0.18
324 0.17
325 0.17
326 0.13
327 0.14
328 0.15
329 0.15
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.15
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.14
340 0.16
341 0.21
342 0.25
343 0.22
344 0.22
345 0.2
346 0.22
347 0.24
348 0.27
349 0.28
350 0.25
351 0.27
352 0.32
353 0.33
354 0.32
355 0.39
356 0.36
357 0.38
358 0.38
359 0.42
360 0.39
361 0.37
362 0.35
363 0.28
364 0.28
365 0.24
366 0.26
367 0.3
368 0.29
369 0.29
370 0.33
371 0.3
372 0.29
373 0.24
374 0.21
375 0.12
376 0.14
377 0.14
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.15
392 0.15
393 0.15
394 0.17
395 0.2
396 0.2
397 0.21
398 0.21
399 0.21
400 0.22
401 0.22
402 0.19
403 0.18
404 0.13
405 0.14
406 0.14
407 0.15
408 0.14
409 0.17
410 0.2
411 0.24
412 0.26
413 0.28
414 0.35
415 0.41
416 0.43
417 0.45
418 0.5
419 0.48
420 0.53
421 0.48
422 0.4
423 0.31
424 0.3
425 0.25
426 0.17
427 0.15
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.11
434 0.12
435 0.15
436 0.18
437 0.21
438 0.23
439 0.22
440 0.22
441 0.21
442 0.19
443 0.16
444 0.14
445 0.09
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.11
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.12
457 0.17
458 0.21
459 0.2
460 0.26
461 0.31
462 0.35
463 0.4
464 0.46
465 0.45
466 0.46
467 0.48
468 0.46
469 0.49
470 0.48
471 0.51
472 0.5
473 0.53
474 0.53
475 0.56
476 0.53
477 0.51
478 0.54
479 0.53
480 0.53
481 0.56
482 0.56
483 0.56
484 0.6
485 0.56
486 0.6
487 0.59
488 0.55
489 0.46
490 0.44
491 0.39
492 0.43
493 0.46
494 0.42
495 0.43
496 0.44
497 0.47
498 0.46
499 0.45
500 0.41
501 0.41
502 0.36
503 0.28
504 0.24
505 0.2
506 0.18
507 0.18
508 0.12
509 0.09