Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12172

Protein Details
Accession Q12172    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-75SGTPTSTSGKKRNKLIKSCGFCRRRKLRCDQQKPMCSTCIHydrophilic
203-227KQLWAKVKVERNKWKQNNQKTMCREHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 3.5, cyto_mito 3.5, cyto 2.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YOR162C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MKRRSDALLGSFQATNVTPPSDNSNSTAGGANGSNSGTPTSTSGKKRNKLIKSCGFCRRRKLRCDQQKPMCSTCISRNLTTCQYAEEFNKNIEKKATYGPYPNADLLKKVEELENKIRILEAEKNTNSSASSMYTSPNFPPLGTSVGRGSTETSSPLPDGVINPYADRYYLQSKHSGRSTLYGPTSMRTQIANSNWGFIEKYKQLWAKVKVERNKWKQNNQKTMCRELGLLDESDWQPDPLIKQICRFLPSYNKALSILDDFFNDGACNEINVILDKAKVRRDFLDYFMPEKEVKAEGDRSIVYILSNPKKNYYKAAVILLILCLKYFHTDVPTPIEKFFTLLKGASTAKVFYIERAQMLILFYYHRETYSFGGDGSDLVNINECLVTTVTTIGLHLNIRETFKEHEVFMGSIESLENVWLMAIFIDYNISCNVGRPLLINKFYLDENQDHCILNSKSKTYEGKLKRYLKLTRPMLLTLYDRDKFPDLKAYSKRIINFVEEELGPLGHYTGENISEEVPLRESRILSMAVGLLLSFYALIHSVLKVRNIESKNNTFQLVLINFSIIVNTTIRCYRIDKALYPEKFEASNPHLPPHMALSMSLTAGLFSKTLVFFCSLIYFKLTLFENGLCLSNDMEVGWSDLTKLTVPLDKDLSLGTAMSLYSSIFDRLFTVGNKELIRTMHRSSQFVIELAIERTYRTILGNVIEFRKLTEETWLAQIKQELDPQSDNPSSEAKIVSDRQRDLSLAVPTPTPSIIPMLPSPGETKNHAKSQSEIIQMLTDEFWANYNSGWEELINQSEFSTLFDDYKDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.17
4 0.18
5 0.16
6 0.17
7 0.25
8 0.27
9 0.28
10 0.29
11 0.3
12 0.28
13 0.29
14 0.29
15 0.21
16 0.2
17 0.18
18 0.16
19 0.14
20 0.14
21 0.13
22 0.12
23 0.13
24 0.11
25 0.12
26 0.14
27 0.19
28 0.26
29 0.34
30 0.44
31 0.53
32 0.59
33 0.68
34 0.74
35 0.79
36 0.81
37 0.83
38 0.83
39 0.82
40 0.83
41 0.84
42 0.83
43 0.79
44 0.81
45 0.81
46 0.8
47 0.81
48 0.83
49 0.84
50 0.86
51 0.9
52 0.9
53 0.9
54 0.9
55 0.87
56 0.81
57 0.73
58 0.64
59 0.58
60 0.55
61 0.54
62 0.5
63 0.47
64 0.47
65 0.49
66 0.51
67 0.49
68 0.42
69 0.35
70 0.32
71 0.32
72 0.33
73 0.33
74 0.3
75 0.31
76 0.39
77 0.37
78 0.38
79 0.38
80 0.35
81 0.32
82 0.39
83 0.41
84 0.37
85 0.43
86 0.45
87 0.45
88 0.47
89 0.46
90 0.42
91 0.37
92 0.35
93 0.31
94 0.3
95 0.26
96 0.24
97 0.27
98 0.27
99 0.34
100 0.4
101 0.42
102 0.38
103 0.37
104 0.36
105 0.32
106 0.31
107 0.32
108 0.29
109 0.33
110 0.33
111 0.36
112 0.36
113 0.36
114 0.32
115 0.25
116 0.21
117 0.14
118 0.16
119 0.14
120 0.16
121 0.17
122 0.19
123 0.19
124 0.23
125 0.21
126 0.19
127 0.2
128 0.19
129 0.22
130 0.2
131 0.21
132 0.18
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.19
137 0.17
138 0.17
139 0.18
140 0.17
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.15
148 0.17
149 0.15
150 0.16
151 0.17
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.21
157 0.24
158 0.26
159 0.33
160 0.36
161 0.41
162 0.44
163 0.43
164 0.35
165 0.35
166 0.35
167 0.33
168 0.31
169 0.29
170 0.26
171 0.25
172 0.27
173 0.24
174 0.23
175 0.18
176 0.18
177 0.21
178 0.23
179 0.28
180 0.25
181 0.26
182 0.24
183 0.25
184 0.24
185 0.18
186 0.23
187 0.18
188 0.2
189 0.25
190 0.28
191 0.32
192 0.4
193 0.45
194 0.47
195 0.53
196 0.6
197 0.61
198 0.68
199 0.74
200 0.75
201 0.8
202 0.8
203 0.82
204 0.84
205 0.86
206 0.87
207 0.83
208 0.83
209 0.77
210 0.76
211 0.68
212 0.58
213 0.48
214 0.38
215 0.35
216 0.27
217 0.22
218 0.15
219 0.17
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.13
224 0.11
225 0.12
226 0.13
227 0.16
228 0.21
229 0.2
230 0.23
231 0.28
232 0.3
233 0.31
234 0.31
235 0.28
236 0.32
237 0.36
238 0.38
239 0.34
240 0.33
241 0.31
242 0.3
243 0.28
244 0.21
245 0.19
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.07
262 0.09
263 0.12
264 0.14
265 0.2
266 0.22
267 0.23
268 0.24
269 0.3
270 0.31
271 0.31
272 0.37
273 0.32
274 0.33
275 0.31
276 0.31
277 0.25
278 0.23
279 0.21
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.16
284 0.14
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.13
290 0.1
291 0.11
292 0.18
293 0.22
294 0.27
295 0.27
296 0.33
297 0.37
298 0.38
299 0.4
300 0.37
301 0.35
302 0.33
303 0.34
304 0.28
305 0.24
306 0.23
307 0.19
308 0.15
309 0.11
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.19
320 0.23
321 0.22
322 0.22
323 0.22
324 0.18
325 0.19
326 0.18
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.13
338 0.12
339 0.11
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.11
389 0.12
390 0.15
391 0.16
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.11
397 0.1
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.02
410 0.03
411 0.02
412 0.02
413 0.03
414 0.03
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.13
425 0.15
426 0.17
427 0.17
428 0.16
429 0.18
430 0.18
431 0.18
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.18
437 0.17
438 0.16
439 0.21
440 0.2
441 0.22
442 0.21
443 0.21
444 0.2
445 0.24
446 0.27
447 0.23
448 0.32
449 0.34
450 0.41
451 0.49
452 0.54
453 0.54
454 0.59
455 0.63
456 0.6
457 0.64
458 0.59
459 0.54
460 0.49
461 0.46
462 0.4
463 0.35
464 0.3
465 0.23
466 0.25
467 0.21
468 0.19
469 0.21
470 0.22
471 0.21
472 0.2
473 0.26
474 0.22
475 0.29
476 0.34
477 0.37
478 0.39
479 0.41
480 0.42
481 0.37
482 0.37
483 0.31
484 0.28
485 0.23
486 0.21
487 0.18
488 0.17
489 0.14
490 0.12
491 0.09
492 0.07
493 0.07
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.09
507 0.11
508 0.12
509 0.11
510 0.11
511 0.13
512 0.12
513 0.1
514 0.11
515 0.09
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.04
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.02
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.09
530 0.1
531 0.13
532 0.14
533 0.15
534 0.23
535 0.25
536 0.32
537 0.35
538 0.4
539 0.42
540 0.43
541 0.42
542 0.34
543 0.32
544 0.31
545 0.25
546 0.2
547 0.15
548 0.14
549 0.13
550 0.13
551 0.12
552 0.07
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.09
557 0.1
558 0.12
559 0.14
560 0.16
561 0.17
562 0.24
563 0.27
564 0.28
565 0.34
566 0.42
567 0.42
568 0.44
569 0.42
570 0.36
571 0.34
572 0.32
573 0.3
574 0.28
575 0.35
576 0.31
577 0.31
578 0.31
579 0.3
580 0.3
581 0.28
582 0.22
583 0.14
584 0.13
585 0.14
586 0.14
587 0.14
588 0.14
589 0.1
590 0.08
591 0.09
592 0.09
593 0.06
594 0.05
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.09
599 0.11
600 0.1
601 0.11
602 0.15
603 0.13
604 0.13
605 0.15
606 0.14
607 0.13
608 0.16
609 0.16
610 0.14
611 0.15
612 0.15
613 0.14
614 0.14
615 0.16
616 0.13
617 0.12
618 0.12
619 0.1
620 0.1
621 0.08
622 0.08
623 0.07
624 0.08
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.08
629 0.09
630 0.08
631 0.09
632 0.1
633 0.13
634 0.14
635 0.17
636 0.19
637 0.18
638 0.18
639 0.18
640 0.17
641 0.13
642 0.12
643 0.09
644 0.07
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.06
650 0.07
651 0.09
652 0.08
653 0.09
654 0.1
655 0.11
656 0.14
657 0.13
658 0.18
659 0.19
660 0.24
661 0.24
662 0.23
663 0.25
664 0.25
665 0.28
666 0.28
667 0.29
668 0.32
669 0.35
670 0.36
671 0.36
672 0.39
673 0.36
674 0.31
675 0.28
676 0.21
677 0.2
678 0.2
679 0.2
680 0.14
681 0.13
682 0.14
683 0.14
684 0.13
685 0.12
686 0.13
687 0.12
688 0.15
689 0.18
690 0.21
691 0.23
692 0.23
693 0.22
694 0.21
695 0.23
696 0.22
697 0.18
698 0.21
699 0.21
700 0.21
701 0.29
702 0.31
703 0.28
704 0.29
705 0.31
706 0.28
707 0.29
708 0.32
709 0.28
710 0.29
711 0.31
712 0.31
713 0.35
714 0.34
715 0.32
716 0.28
717 0.28
718 0.26
719 0.25
720 0.25
721 0.19
722 0.23
723 0.28
724 0.35
725 0.4
726 0.41
727 0.42
728 0.43
729 0.42
730 0.38
731 0.37
732 0.33
733 0.28
734 0.27
735 0.25
736 0.24
737 0.25
738 0.23
739 0.18
740 0.14
741 0.15
742 0.15
743 0.17
744 0.17
745 0.2
746 0.2
747 0.21
748 0.24
749 0.25
750 0.28
751 0.3
752 0.37
753 0.4
754 0.47
755 0.5
756 0.48
757 0.46
758 0.52
759 0.54
760 0.51
761 0.44
762 0.38
763 0.35
764 0.33
765 0.32
766 0.23
767 0.16
768 0.12
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.11
774 0.13
775 0.14
776 0.13
777 0.14
778 0.12
779 0.14
780 0.16
781 0.21
782 0.19
783 0.18
784 0.17
785 0.18
786 0.18
787 0.17
788 0.16
789 0.13
790 0.13