Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25567

Protein Details
Accession P25567    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-79DLDATRKKKNRTPTPKSSTATKHydrophilic
117-144SSTSSSNANRKKKHHQHNAKKQQQMKKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-130RKKKH
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0017053  C:transcription repressor complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
GO:0045727  P:positive regulation of translation  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0070482  P:response to oxygen levels  
KEGG sce:YCL037C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSAETAAANTATAPVPEVQEQESSKSKQVNLTPAPLPTSSPWKLAPTEIPVSTISIEDLDATRKKKNRTPTPKSSTATKWVPIKASITVSGTKRSGSKNGASNGNSNKSKNNKTAASSTSSSNANRKKKHHQHNAKKQQQMKKDGFESAVGEEDSKDATSQENGQSTQQQQPPHHRNHHHSHHHNSNGPQRRKFHNSNNAGMPQNQGFPPQFKPYQGRNARNNNNNRSKYHNHFHHNQQHPQQPMVKLQQQFYPVQPVLMAINNIARQIEYYFSEENLTVDNYLRSKLSKDGFAPLSLISKFYRVVNMSFGGDTNLILAALREIVANEAATVNVAEGTLAAKEGDNVTGEAKEPSPLDKYFVRSKSWSNWLPETFETEINIEKELVGDALDQFMISLPPVPQQEEESSTELASQEQETKEDSAPVAAGESESSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.14
3 0.16
4 0.18
5 0.18
6 0.23
7 0.24
8 0.27
9 0.33
10 0.33
11 0.36
12 0.39
13 0.4
14 0.42
15 0.46
16 0.51
17 0.48
18 0.5
19 0.48
20 0.45
21 0.45
22 0.38
23 0.35
24 0.29
25 0.33
26 0.3
27 0.31
28 0.31
29 0.32
30 0.33
31 0.34
32 0.35
33 0.33
34 0.35
35 0.32
36 0.32
37 0.29
38 0.29
39 0.26
40 0.22
41 0.16
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.14
47 0.18
48 0.21
49 0.28
50 0.34
51 0.41
52 0.46
53 0.56
54 0.62
55 0.68
56 0.76
57 0.79
58 0.82
59 0.84
60 0.8
61 0.76
62 0.7
63 0.67
64 0.62
65 0.57
66 0.54
67 0.48
68 0.48
69 0.43
70 0.41
71 0.35
72 0.33
73 0.3
74 0.26
75 0.29
76 0.28
77 0.3
78 0.29
79 0.27
80 0.29
81 0.3
82 0.33
83 0.33
84 0.37
85 0.39
86 0.43
87 0.48
88 0.46
89 0.49
90 0.49
91 0.53
92 0.5
93 0.45
94 0.48
95 0.49
96 0.54
97 0.54
98 0.54
99 0.49
100 0.5
101 0.54
102 0.49
103 0.46
104 0.41
105 0.36
106 0.32
107 0.32
108 0.3
109 0.33
110 0.4
111 0.43
112 0.48
113 0.54
114 0.62
115 0.69
116 0.78
117 0.81
118 0.83
119 0.86
120 0.9
121 0.95
122 0.92
123 0.89
124 0.86
125 0.83
126 0.8
127 0.78
128 0.72
129 0.66
130 0.6
131 0.54
132 0.47
133 0.4
134 0.33
135 0.24
136 0.2
137 0.14
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.11
148 0.13
149 0.15
150 0.16
151 0.17
152 0.2
153 0.22
154 0.28
155 0.29
156 0.3
157 0.32
158 0.42
159 0.48
160 0.53
161 0.58
162 0.57
163 0.61
164 0.65
165 0.72
166 0.71
167 0.71
168 0.7
169 0.69
170 0.68
171 0.65
172 0.61
173 0.6
174 0.6
175 0.6
176 0.58
177 0.54
178 0.56
179 0.6
180 0.62
181 0.63
182 0.63
183 0.61
184 0.6
185 0.59
186 0.56
187 0.49
188 0.42
189 0.34
190 0.25
191 0.22
192 0.18
193 0.16
194 0.14
195 0.15
196 0.17
197 0.2
198 0.2
199 0.21
200 0.26
201 0.28
202 0.38
203 0.44
204 0.48
205 0.52
206 0.61
207 0.66
208 0.69
209 0.73
210 0.72
211 0.74
212 0.69
213 0.63
214 0.61
215 0.59
216 0.58
217 0.58
218 0.57
219 0.52
220 0.54
221 0.61
222 0.64
223 0.65
224 0.64
225 0.62
226 0.6
227 0.56
228 0.53
229 0.48
230 0.4
231 0.39
232 0.38
233 0.37
234 0.34
235 0.33
236 0.34
237 0.33
238 0.32
239 0.28
240 0.29
241 0.23
242 0.21
243 0.19
244 0.17
245 0.15
246 0.14
247 0.13
248 0.07
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.09
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.17
275 0.18
276 0.2
277 0.21
278 0.26
279 0.27
280 0.26
281 0.26
282 0.2
283 0.22
284 0.18
285 0.19
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.18
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.19
295 0.19
296 0.18
297 0.17
298 0.14
299 0.12
300 0.11
301 0.09
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.11
339 0.13
340 0.12
341 0.14
342 0.18
343 0.18
344 0.21
345 0.22
346 0.28
347 0.34
348 0.37
349 0.39
350 0.38
351 0.43
352 0.47
353 0.53
354 0.53
355 0.5
356 0.54
357 0.51
358 0.52
359 0.48
360 0.46
361 0.39
362 0.34
363 0.3
364 0.24
365 0.26
366 0.22
367 0.22
368 0.17
369 0.14
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.09
384 0.08
385 0.14
386 0.16
387 0.18
388 0.19
389 0.23
390 0.26
391 0.28
392 0.31
393 0.29
394 0.28
395 0.26
396 0.26
397 0.22
398 0.19
399 0.17
400 0.15
401 0.18
402 0.18
403 0.19
404 0.21
405 0.24
406 0.24
407 0.25
408 0.23
409 0.18
410 0.18
411 0.16
412 0.15
413 0.11
414 0.11