Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12086

Protein Details
Accession Q12086    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-106SLFVKNHTETRRRKKRLENEMIAKKLHydrophilic
356-376ASKLINRERKLKARKLFKVGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-95RRKK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR044752  PIN-like_EXO1  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035312  F:5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000729  P:DNA double-strand break processing  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006298  P:mismatch repair  
KEGG sce:YDR263C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00841  XPG_1  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09857  PIN_EXO1  
Amino Acid Sequences MGIPGLLPQLKRIQKQVSLKKYMYQTLAIDGYAWLHRASCACAFELVMNKPTNKYLQFFIKRLQLLKRLKIKPYIVFDGDSLFVKNHTETRRRKKRLENEMIAKKLWSAGNRYNAMEYFQKSVDITPEMAKCIIDYCKLHSIPYIVAPFEADPQMVYLEKMGLIQGIISEDSDLLVFGCKTLITKLNDQGKALEISKDDFSALPENFPLGELSEQQFRNLVCLAGCDYTSGIWKVGVVTAMKIVKRYSEMKDILIQIERTEKLCFSKAFKQQVEFANYAFQYQRVFCPLSNQITTLNNIPKAVTNSHAEIIKIMKCIGSVVERGSGVRKDVINTKNIDHKVHEMIAKGELHPVDMASKLINRERKLKARKLFKVGLLGGESNSFNKKVEQPLVDTQDVLSERENSLDNKNASSIYMTSPAAISGTVPSIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.63
3 0.7
4 0.7
5 0.72
6 0.7
7 0.69
8 0.68
9 0.65
10 0.58
11 0.51
12 0.42
13 0.38
14 0.38
15 0.31
16 0.25
17 0.19
18 0.19
19 0.16
20 0.16
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.17
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.19
31 0.21
32 0.26
33 0.25
34 0.27
35 0.29
36 0.29
37 0.3
38 0.33
39 0.36
40 0.33
41 0.33
42 0.32
43 0.4
44 0.45
45 0.46
46 0.48
47 0.49
48 0.49
49 0.51
50 0.53
51 0.52
52 0.53
53 0.59
54 0.65
55 0.63
56 0.65
57 0.69
58 0.68
59 0.65
60 0.64
61 0.62
62 0.53
63 0.48
64 0.43
65 0.37
66 0.32
67 0.26
68 0.19
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.18
74 0.25
75 0.34
76 0.43
77 0.54
78 0.65
79 0.72
80 0.79
81 0.83
82 0.86
83 0.87
84 0.88
85 0.86
86 0.85
87 0.85
88 0.79
89 0.68
90 0.58
91 0.47
92 0.4
93 0.34
94 0.26
95 0.25
96 0.29
97 0.36
98 0.38
99 0.39
100 0.36
101 0.34
102 0.34
103 0.31
104 0.27
105 0.22
106 0.2
107 0.2
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.16
112 0.15
113 0.17
114 0.17
115 0.18
116 0.18
117 0.16
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.18
124 0.26
125 0.26
126 0.26
127 0.25
128 0.25
129 0.22
130 0.25
131 0.23
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.07
169 0.13
170 0.15
171 0.19
172 0.25
173 0.33
174 0.34
175 0.34
176 0.33
177 0.28
178 0.27
179 0.25
180 0.2
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.09
187 0.1
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.09
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.15
233 0.19
234 0.19
235 0.25
236 0.26
237 0.26
238 0.29
239 0.29
240 0.28
241 0.26
242 0.22
243 0.15
244 0.18
245 0.18
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.19
251 0.19
252 0.21
253 0.29
254 0.35
255 0.43
256 0.44
257 0.43
258 0.45
259 0.49
260 0.49
261 0.41
262 0.33
263 0.29
264 0.28
265 0.27
266 0.22
267 0.17
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.15
272 0.16
273 0.15
274 0.2
275 0.25
276 0.28
277 0.27
278 0.27
279 0.25
280 0.25
281 0.27
282 0.27
283 0.26
284 0.22
285 0.22
286 0.21
287 0.22
288 0.23
289 0.23
290 0.21
291 0.19
292 0.21
293 0.23
294 0.23
295 0.2
296 0.18
297 0.2
298 0.19
299 0.17
300 0.15
301 0.13
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.18
312 0.18
313 0.16
314 0.19
315 0.18
316 0.19
317 0.27
318 0.3
319 0.31
320 0.32
321 0.34
322 0.39
323 0.4
324 0.4
325 0.34
326 0.35
327 0.34
328 0.35
329 0.35
330 0.27
331 0.26
332 0.28
333 0.26
334 0.22
335 0.23
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.1
344 0.13
345 0.16
346 0.23
347 0.29
348 0.31
349 0.39
350 0.47
351 0.56
352 0.63
353 0.69
354 0.71
355 0.75
356 0.8
357 0.8
358 0.78
359 0.72
360 0.7
361 0.61
362 0.55
363 0.48
364 0.4
365 0.32
366 0.28
367 0.25
368 0.19
369 0.21
370 0.19
371 0.17
372 0.2
373 0.25
374 0.31
375 0.37
376 0.37
377 0.4
378 0.48
379 0.53
380 0.5
381 0.45
382 0.37
383 0.35
384 0.34
385 0.29
386 0.23
387 0.19
388 0.19
389 0.2
390 0.23
391 0.2
392 0.24
393 0.3
394 0.3
395 0.28
396 0.3
397 0.28
398 0.26
399 0.26
400 0.23
401 0.19
402 0.22
403 0.2
404 0.19
405 0.19
406 0.18
407 0.16
408 0.14
409 0.11
410 0.09