Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12046

Protein Details
Accession Q12046    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-321IEKLKKVKKNISRENISSKPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR034181  Cwc2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0036002  F:pre-mRNA binding  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0045787  P:positive regulation of cell cycle  
GO:0033120  P:positive regulation of RNA splicing  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG sce:YDL209C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12360  RRM_cwf2  
Amino Acid Sequences MTSWRDKSAKVQVKESELPSSIPAQTGLTFNIWYNKWSQGFAGNTRFVSPFALQPQLHSGKTRGDNDGQLFFCLFFAKGMCCLGPKCEYLHHIPDEEDIGKLALRTEVLDCFGREKFADYREDMGGIGSFRKKNKTLYVGGIDGALNSKHLKPAQIESRIRFVFSRLGDIDRIRYVESKNCGFVKFKYQANAEFAKEAMSNQTLLLPSDKEWDDRREGTGLLVKWANEDPDPAAQKRLQEELKLESLNMMVHLINNNTNSAGTEVNNKNNERLDRTFPEASVDNVKKRLLPLDNGMESDDFIEKLKKVKKNISRENISSKPSVGKLGGPLLDYLSSDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.59
3 0.54
4 0.45
5 0.42
6 0.37
7 0.35
8 0.28
9 0.23
10 0.21
11 0.17
12 0.17
13 0.18
14 0.18
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.22
19 0.21
20 0.2
21 0.22
22 0.27
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.27
27 0.31
28 0.36
29 0.39
30 0.35
31 0.34
32 0.36
33 0.35
34 0.29
35 0.28
36 0.23
37 0.21
38 0.22
39 0.29
40 0.26
41 0.27
42 0.35
43 0.36
44 0.36
45 0.34
46 0.32
47 0.32
48 0.39
49 0.41
50 0.37
51 0.36
52 0.4
53 0.4
54 0.44
55 0.37
56 0.31
57 0.28
58 0.23
59 0.2
60 0.16
61 0.14
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.15
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.2
75 0.24
76 0.27
77 0.33
78 0.31
79 0.29
80 0.28
81 0.27
82 0.27
83 0.24
84 0.18
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.1
96 0.12
97 0.11
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.12
102 0.15
103 0.16
104 0.18
105 0.21
106 0.2
107 0.23
108 0.22
109 0.22
110 0.18
111 0.16
112 0.13
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.15
117 0.17
118 0.22
119 0.24
120 0.28
121 0.34
122 0.37
123 0.36
124 0.37
125 0.38
126 0.34
127 0.32
128 0.28
129 0.22
130 0.16
131 0.13
132 0.09
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.1
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.2
141 0.26
142 0.34
143 0.36
144 0.35
145 0.41
146 0.39
147 0.38
148 0.32
149 0.27
150 0.23
151 0.2
152 0.22
153 0.16
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.14
159 0.15
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.16
164 0.19
165 0.19
166 0.21
167 0.22
168 0.23
169 0.22
170 0.22
171 0.25
172 0.26
173 0.27
174 0.28
175 0.28
176 0.29
177 0.32
178 0.33
179 0.26
180 0.22
181 0.2
182 0.17
183 0.16
184 0.13
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.18
199 0.21
200 0.24
201 0.25
202 0.26
203 0.23
204 0.22
205 0.21
206 0.23
207 0.19
208 0.18
209 0.18
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.17
214 0.12
215 0.13
216 0.12
217 0.16
218 0.2
219 0.19
220 0.22
221 0.22
222 0.24
223 0.25
224 0.3
225 0.26
226 0.25
227 0.27
228 0.27
229 0.29
230 0.27
231 0.24
232 0.19
233 0.18
234 0.15
235 0.13
236 0.1
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.19
251 0.22
252 0.29
253 0.34
254 0.35
255 0.36
256 0.4
257 0.43
258 0.41
259 0.41
260 0.42
261 0.4
262 0.46
263 0.45
264 0.39
265 0.4
266 0.34
267 0.32
268 0.35
269 0.35
270 0.32
271 0.34
272 0.35
273 0.32
274 0.33
275 0.38
276 0.33
277 0.32
278 0.35
279 0.4
280 0.4
281 0.39
282 0.39
283 0.32
284 0.27
285 0.25
286 0.19
287 0.12
288 0.12
289 0.15
290 0.14
291 0.22
292 0.3
293 0.35
294 0.42
295 0.52
296 0.6
297 0.68
298 0.77
299 0.8
300 0.8
301 0.79
302 0.81
303 0.76
304 0.71
305 0.62
306 0.54
307 0.49
308 0.42
309 0.4
310 0.32
311 0.29
312 0.29
313 0.32
314 0.31
315 0.27
316 0.26
317 0.23
318 0.22
319 0.2