Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q06665

Protein Details
Accession Q06665    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-98FGNIRRDREKVSKYKRKHNKKAFNYQRLKYGLHydrophilic
120-140ERLNRRLRRSVPKLIGKKFKDBasic
598-618IKEYNKGKRKMQKIKYLDVVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-87DREKVSKYKRKHNKK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 2.5, cyto_mito 2.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000111  C:nucleotide-excision repair factor 2 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071942  C:XPC complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG sce:YDR314C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10405  BHD_3  
Amino Acid Sequences MAKRLLESSQNDQANRKNSKIEKKEVSFYEEEETDDSFDSFYQDEEDDLSDIDWEEVSLDGSLTVTFGNIRRDREKVSKYKRKHNKKAFNYQRLKYGLHLIMIPFMLFLLKSRMKWIDDERLNRRLRRSVPKLIGKKFKDWDVRDPAFKMDSLRTLLLGLVLWFRSNYKMNSNGIRQNFNRLQYLIKYADNQNENSISESTYKKVLENQQEFYGNRPLINHGVEDIRKMAKRKMANRDILTLFFFIILENVLPGPKKLYLCFALPLHDYDIRCNKVKWQIEHGIGKVPNRFDSDLIQPYFWIELEVPTLSDGELYIIDPIAHLGEREMVLKTREDQFVPTYQPSVDMKYNLNQKFHYVVRINHAEKVLQDVSPRYVPNVCYRYFELSESSPILKSKHYTSYQYLSKWLKVLNKKKASVHHYAIMKKIALTNFTLPKSVTEIKRTDNFVIPSLLKSNEVLKACAKQAATFTKGDNSQEPIFWRRDVIQLKSKQHWAILGRSILPNAQPLKRKKYLPMRERMVRNLDKYVIKELFSYEQTMKSPKYPSTYCDHLGQEHVITDLSHYKNKFGNIEIYSKETKPDGFELIPLSKEVDIKCLIKEYNKGKRKMQKIKYLDVVSGFDFKQKKGHAIPKIESILVKETDYKAVQLLKQQTKVLLGLSFWDILLRKLRVNDRLNAEYGNVGNNEETLDDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.52
4 0.52
5 0.57
6 0.66
7 0.69
8 0.72
9 0.72
10 0.72
11 0.77
12 0.71
13 0.69
14 0.6
15 0.53
16 0.49
17 0.39
18 0.35
19 0.28
20 0.26
21 0.2
22 0.19
23 0.17
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.13
34 0.11
35 0.12
36 0.11
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.08
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.08
54 0.11
55 0.2
56 0.24
57 0.3
58 0.34
59 0.38
60 0.44
61 0.51
62 0.58
63 0.59
64 0.67
65 0.71
66 0.75
67 0.83
68 0.87
69 0.89
70 0.91
71 0.91
72 0.91
73 0.91
74 0.94
75 0.94
76 0.94
77 0.92
78 0.84
79 0.81
80 0.74
81 0.65
82 0.56
83 0.53
84 0.44
85 0.36
86 0.35
87 0.27
88 0.25
89 0.23
90 0.21
91 0.12
92 0.1
93 0.09
94 0.07
95 0.08
96 0.14
97 0.17
98 0.17
99 0.23
100 0.27
101 0.28
102 0.34
103 0.39
104 0.41
105 0.45
106 0.54
107 0.55
108 0.6
109 0.65
110 0.64
111 0.63
112 0.61
113 0.62
114 0.64
115 0.66
116 0.67
117 0.7
118 0.76
119 0.8
120 0.8
121 0.82
122 0.75
123 0.74
124 0.68
125 0.67
126 0.67
127 0.62
128 0.63
129 0.63
130 0.63
131 0.58
132 0.55
133 0.5
134 0.41
135 0.37
136 0.31
137 0.24
138 0.24
139 0.23
140 0.22
141 0.2
142 0.19
143 0.18
144 0.15
145 0.12
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.13
153 0.17
154 0.18
155 0.22
156 0.27
157 0.31
158 0.37
159 0.41
160 0.44
161 0.44
162 0.49
163 0.44
164 0.48
165 0.49
166 0.46
167 0.43
168 0.37
169 0.36
170 0.31
171 0.36
172 0.29
173 0.26
174 0.27
175 0.27
176 0.33
177 0.33
178 0.32
179 0.29
180 0.28
181 0.27
182 0.26
183 0.23
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.17
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.24
192 0.31
193 0.37
194 0.4
195 0.42
196 0.41
197 0.45
198 0.44
199 0.41
200 0.4
201 0.3
202 0.27
203 0.25
204 0.24
205 0.23
206 0.24
207 0.2
208 0.14
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.17
213 0.18
214 0.2
215 0.23
216 0.25
217 0.28
218 0.35
219 0.43
220 0.51
221 0.55
222 0.61
223 0.6
224 0.62
225 0.56
226 0.5
227 0.43
228 0.33
229 0.24
230 0.16
231 0.14
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.16
246 0.17
247 0.18
248 0.21
249 0.2
250 0.19
251 0.19
252 0.2
253 0.19
254 0.2
255 0.19
256 0.2
257 0.27
258 0.27
259 0.28
260 0.27
261 0.29
262 0.35
263 0.4
264 0.39
265 0.39
266 0.42
267 0.45
268 0.48
269 0.43
270 0.41
271 0.36
272 0.36
273 0.32
274 0.27
275 0.24
276 0.24
277 0.25
278 0.19
279 0.21
280 0.23
281 0.26
282 0.25
283 0.23
284 0.2
285 0.19
286 0.19
287 0.16
288 0.12
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.04
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.16
323 0.16
324 0.18
325 0.2
326 0.19
327 0.15
328 0.14
329 0.16
330 0.15
331 0.17
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.19
336 0.28
337 0.28
338 0.29
339 0.26
340 0.26
341 0.28
342 0.27
343 0.29
344 0.24
345 0.22
346 0.26
347 0.33
348 0.33
349 0.32
350 0.31
351 0.26
352 0.22
353 0.27
354 0.22
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.16
359 0.17
360 0.17
361 0.13
362 0.14
363 0.15
364 0.22
365 0.25
366 0.24
367 0.24
368 0.26
369 0.29
370 0.28
371 0.27
372 0.22
373 0.19
374 0.2
375 0.18
376 0.18
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.13
381 0.15
382 0.16
383 0.22
384 0.24
385 0.27
386 0.3
387 0.35
388 0.37
389 0.36
390 0.4
391 0.34
392 0.33
393 0.31
394 0.3
395 0.32
396 0.38
397 0.46
398 0.5
399 0.55
400 0.57
401 0.6
402 0.64
403 0.63
404 0.6
405 0.54
406 0.49
407 0.48
408 0.46
409 0.44
410 0.39
411 0.33
412 0.26
413 0.26
414 0.21
415 0.18
416 0.18
417 0.2
418 0.23
419 0.23
420 0.24
421 0.21
422 0.2
423 0.25
424 0.28
425 0.26
426 0.27
427 0.29
428 0.32
429 0.36
430 0.39
431 0.35
432 0.34
433 0.33
434 0.28
435 0.29
436 0.25
437 0.22
438 0.21
439 0.19
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.18
444 0.18
445 0.19
446 0.18
447 0.21
448 0.21
449 0.24
450 0.21
451 0.17
452 0.21
453 0.25
454 0.26
455 0.24
456 0.24
457 0.25
458 0.27
459 0.27
460 0.24
461 0.25
462 0.22
463 0.23
464 0.25
465 0.25
466 0.26
467 0.24
468 0.24
469 0.2
470 0.27
471 0.3
472 0.32
473 0.37
474 0.43
475 0.48
476 0.51
477 0.54
478 0.47
479 0.44
480 0.43
481 0.37
482 0.33
483 0.33
484 0.3
485 0.27
486 0.27
487 0.26
488 0.22
489 0.2
490 0.21
491 0.21
492 0.24
493 0.31
494 0.36
495 0.45
496 0.5
497 0.52
498 0.56
499 0.63
500 0.68
501 0.69
502 0.73
503 0.72
504 0.74
505 0.76
506 0.73
507 0.71
508 0.66
509 0.6
510 0.54
511 0.5
512 0.45
513 0.42
514 0.43
515 0.36
516 0.31
517 0.28
518 0.27
519 0.26
520 0.24
521 0.26
522 0.2
523 0.22
524 0.23
525 0.27
526 0.26
527 0.26
528 0.29
529 0.29
530 0.34
531 0.33
532 0.34
533 0.37
534 0.41
535 0.39
536 0.4
537 0.38
538 0.33
539 0.34
540 0.32
541 0.26
542 0.2
543 0.19
544 0.13
545 0.12
546 0.12
547 0.17
548 0.19
549 0.23
550 0.24
551 0.27
552 0.3
553 0.33
554 0.34
555 0.29
556 0.33
557 0.31
558 0.35
559 0.33
560 0.35
561 0.36
562 0.34
563 0.33
564 0.27
565 0.25
566 0.24
567 0.25
568 0.25
569 0.21
570 0.23
571 0.25
572 0.25
573 0.24
574 0.21
575 0.2
576 0.17
577 0.21
578 0.19
579 0.19
580 0.21
581 0.22
582 0.23
583 0.25
584 0.26
585 0.27
586 0.35
587 0.4
588 0.47
589 0.54
590 0.58
591 0.63
592 0.71
593 0.77
594 0.8
595 0.8
596 0.79
597 0.78
598 0.81
599 0.8
600 0.73
601 0.64
602 0.56
603 0.49
604 0.4
605 0.37
606 0.29
607 0.27
608 0.27
609 0.25
610 0.3
611 0.3
612 0.35
613 0.41
614 0.5
615 0.52
616 0.58
617 0.6
618 0.61
619 0.61
620 0.56
621 0.47
622 0.41
623 0.38
624 0.32
625 0.3
626 0.26
627 0.25
628 0.29
629 0.29
630 0.27
631 0.25
632 0.28
633 0.29
634 0.33
635 0.41
636 0.43
637 0.46
638 0.48
639 0.46
640 0.43
641 0.42
642 0.37
643 0.28
644 0.2
645 0.18
646 0.19
647 0.17
648 0.15
649 0.17
650 0.15
651 0.17
652 0.25
653 0.24
654 0.25
655 0.32
656 0.4
657 0.46
658 0.51
659 0.55
660 0.56
661 0.58
662 0.56
663 0.5
664 0.43
665 0.37
666 0.32
667 0.29
668 0.22
669 0.19
670 0.17
671 0.16
672 0.16