Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q06148

Protein Details
Accession Q06148    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-297EARPNSRGKIKPKTDFKPKSRESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-286KIKP
331-341KKRKFGKVRIK
Subcellular Location(s) nucl 21, E.R. 2, mito 1, cyto 1, plas 1, golg 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0032807  C:DNA ligase IV complex  
GO:0031965  C:nuclear membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0045027  F:DNA end binding  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0045002  P:double-strand break repair via single-strand annealing  
GO:0035825  P:homologous recombination  
KEGG sce:YLR265C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
Amino Acid Sequences MDSELKGQQLSDAEWCVKKINGEGNCLLLFLPMSSPTTIVMIVLVSLERLVPYVFKLSQTQLSQQCQSQGFTDSISLNLIKLKLMDILQAPQEINQIGLVDSNLVFSFDVSADITVSINSVPSHVTKDMFYMILQSLCMLLLKLVNLSTQYHYVQRDILNEKQKCLDFLLISLRDLDGGSKVISQWAPENSKNYESLQQCTDDDIIKKLLHKGKFQHQEFLADSLKTLLSLRNKFQDVSRFEESGELNKKERVRFPAVNHFYNDDFELQADPTNEARPNSRGKIKPKTDFKPKSRESSTSSQLRLENFSESEATPEKTKSSSSLVEEYPQKKRKFGKVRIKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.25
4 0.25
5 0.25
6 0.27
7 0.32
8 0.31
9 0.36
10 0.36
11 0.37
12 0.35
13 0.33
14 0.28
15 0.2
16 0.17
17 0.11
18 0.11
19 0.09
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.1
27 0.09
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.05
32 0.04
33 0.05
34 0.05
35 0.04
36 0.05
37 0.06
38 0.06
39 0.08
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.18
44 0.21
45 0.27
46 0.29
47 0.35
48 0.37
49 0.41
50 0.41
51 0.4
52 0.42
53 0.37
54 0.36
55 0.3
56 0.26
57 0.22
58 0.2
59 0.2
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.13
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.12
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.15
78 0.14
79 0.15
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.06
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.05
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.08
135 0.09
136 0.11
137 0.12
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.18
142 0.17
143 0.21
144 0.22
145 0.27
146 0.33
147 0.33
148 0.33
149 0.34
150 0.33
151 0.29
152 0.26
153 0.22
154 0.13
155 0.13
156 0.18
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.1
173 0.13
174 0.17
175 0.19
176 0.22
177 0.22
178 0.24
179 0.24
180 0.23
181 0.26
182 0.24
183 0.25
184 0.23
185 0.22
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.15
194 0.16
195 0.21
196 0.26
197 0.28
198 0.32
199 0.35
200 0.43
201 0.52
202 0.52
203 0.52
204 0.46
205 0.47
206 0.43
207 0.42
208 0.34
209 0.23
210 0.22
211 0.17
212 0.16
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.18
217 0.22
218 0.25
219 0.29
220 0.31
221 0.31
222 0.34
223 0.38
224 0.34
225 0.38
226 0.38
227 0.33
228 0.32
229 0.35
230 0.32
231 0.32
232 0.35
233 0.3
234 0.28
235 0.32
236 0.37
237 0.37
238 0.42
239 0.42
240 0.43
241 0.46
242 0.51
243 0.57
244 0.59
245 0.57
246 0.53
247 0.49
248 0.41
249 0.37
250 0.33
251 0.23
252 0.17
253 0.15
254 0.14
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.17
261 0.19
262 0.19
263 0.22
264 0.24
265 0.3
266 0.34
267 0.42
268 0.46
269 0.52
270 0.62
271 0.67
272 0.73
273 0.76
274 0.79
275 0.81
276 0.84
277 0.83
278 0.83
279 0.8
280 0.79
281 0.75
282 0.72
283 0.67
284 0.65
285 0.66
286 0.62
287 0.59
288 0.54
289 0.51
290 0.48
291 0.45
292 0.39
293 0.34
294 0.27
295 0.27
296 0.25
297 0.22
298 0.24
299 0.23
300 0.23
301 0.22
302 0.23
303 0.23
304 0.22
305 0.24
306 0.23
307 0.25
308 0.28
309 0.31
310 0.35
311 0.34
312 0.39
313 0.46
314 0.49
315 0.54
316 0.57
317 0.54
318 0.57
319 0.64
320 0.69
321 0.71
322 0.76