Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53942

Protein Details
Accession P53942    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-307QLQMVAKPVRRKRLRTLDNWYRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 11, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004649  RNase_H2_suA  
IPR001352  RNase_HII/HIII  
IPR024567  RNase_HII/HIII_dom  
IPR023160  RNase_HII_hlx-loop-hlx_cap_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032299  C:ribonuclease H2 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0043137  P:DNA replication, removal of RNA primer  
GO:0006298  P:mismatch repair  
KEGG sce:YNL072W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01351  RNase_HII  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51975  RNASE_H_2  
CDD cd07181  RNase_HII_eukaryota_like  
Amino Acid Sequences MVPPTVEASLESPYTKSYFSPVPSALLEQNDSPIIMGIDEAGRGPVLGPMVYAVAYSTQKYQDETIIPNYEFDDSKKLTDPIRRMLFSKIYQDNEELTQIGYATTCITPLDISRGMSKFPPTRNYNLNEQAHDVTMALIDGVIKQNVKLSHVYVDTVGPPASYQKKLEQRFPGVKFTVAKKADSLYCMVSVASVVAKVTRDILVESLKRDPDEILGSGYPSDPKTVAWLKRNQTSLMGWPANMVRFSWQTCQTLLDDASKNSIPIKWEEQYMDSRKNAAQKTKQLQLQMVAKPVRRKRLRTLDNWYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.18
5 0.22
6 0.24
7 0.29
8 0.27
9 0.29
10 0.29
11 0.32
12 0.3
13 0.27
14 0.26
15 0.21
16 0.22
17 0.19
18 0.18
19 0.15
20 0.13
21 0.1
22 0.08
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.08
42 0.09
43 0.11
44 0.13
45 0.16
46 0.17
47 0.19
48 0.2
49 0.2
50 0.22
51 0.24
52 0.27
53 0.28
54 0.27
55 0.26
56 0.26
57 0.24
58 0.21
59 0.2
60 0.21
61 0.18
62 0.2
63 0.22
64 0.24
65 0.26
66 0.33
67 0.35
68 0.38
69 0.43
70 0.42
71 0.41
72 0.43
73 0.44
74 0.4
75 0.43
76 0.4
77 0.36
78 0.37
79 0.36
80 0.33
81 0.29
82 0.27
83 0.19
84 0.14
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.11
98 0.1
99 0.11
100 0.15
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.23
105 0.24
106 0.27
107 0.34
108 0.33
109 0.37
110 0.42
111 0.44
112 0.46
113 0.49
114 0.47
115 0.4
116 0.39
117 0.35
118 0.29
119 0.26
120 0.19
121 0.1
122 0.08
123 0.07
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.08
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.11
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.06
146 0.06
147 0.1
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.21
152 0.3
153 0.33
154 0.4
155 0.41
156 0.44
157 0.5
158 0.51
159 0.49
160 0.41
161 0.41
162 0.37
163 0.35
164 0.37
165 0.3
166 0.28
167 0.24
168 0.25
169 0.24
170 0.23
171 0.21
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.1
190 0.14
191 0.15
192 0.17
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.19
197 0.18
198 0.15
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.1
208 0.11
209 0.09
210 0.09
211 0.15
212 0.22
213 0.28
214 0.33
215 0.41
216 0.44
217 0.5
218 0.53
219 0.48
220 0.43
221 0.39
222 0.37
223 0.37
224 0.33
225 0.27
226 0.26
227 0.27
228 0.26
229 0.24
230 0.19
231 0.15
232 0.17
233 0.2
234 0.24
235 0.27
236 0.27
237 0.27
238 0.29
239 0.26
240 0.26
241 0.25
242 0.26
243 0.24
244 0.22
245 0.26
246 0.24
247 0.24
248 0.22
249 0.22
250 0.19
251 0.21
252 0.27
253 0.25
254 0.27
255 0.29
256 0.31
257 0.38
258 0.42
259 0.43
260 0.38
261 0.39
262 0.39
263 0.45
264 0.48
265 0.49
266 0.52
267 0.56
268 0.62
269 0.67
270 0.67
271 0.63
272 0.6
273 0.57
274 0.56
275 0.5
276 0.51
277 0.48
278 0.5
279 0.56
280 0.6
281 0.64
282 0.65
283 0.68
284 0.71
285 0.77
286 0.8
287 0.79