Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47006

Protein Details
Accession P47006    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-43SIPDGFKKCKHLKNFPLNGDHydrophilic
183-233AEEVKENKKEPKKRSHHDDEEESSEKKKKKKEKREKREKKDKKDKKKKHRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-233KKEPKKRSHHDDEEESSEKKKKKKEKREKREKKDKKDKKKKHRD
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0001054  F:RNA polymerase I activity  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
GO:0006363  P:termination of RNA polymerase I transcription  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
GO:0006362  P:transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0006361  P:transcription initiation at RNA polymerase I promoter  
KEGG sce:YJL148W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSKLSKDYVSDSDSDDEVISNEFSIPDGFKKCKHLKNFPLNGDNKKKAKQQQVWLIKFPSNVDISKLKSLPVDFESSTTMTIDKHDYKIMDDTDIESSLTQDNLSNMTLLVPSESKESLKIASTAKDNAPLQFDKVFSVSETAKIPAIDYSKVRVPRKDVPKVEGLKLEHFATGYDAEDFHVAEEVKENKKEPKKRSHHDDEEESSEKKKKKKEKREKREKKDKKDKKKKHRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.2
3 0.16
4 0.14
5 0.14
6 0.11
7 0.09
8 0.09
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.14
14 0.19
15 0.22
16 0.25
17 0.35
18 0.43
19 0.5
20 0.58
21 0.64
22 0.69
23 0.77
24 0.82
25 0.79
26 0.8
27 0.77
28 0.78
29 0.77
30 0.74
31 0.69
32 0.66
33 0.67
34 0.67
35 0.71
36 0.7
37 0.7
38 0.72
39 0.77
40 0.76
41 0.72
42 0.66
43 0.57
44 0.5
45 0.42
46 0.35
47 0.27
48 0.23
49 0.23
50 0.23
51 0.24
52 0.28
53 0.27
54 0.24
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.21
59 0.22
60 0.17
61 0.18
62 0.19
63 0.18
64 0.18
65 0.15
66 0.13
67 0.09
68 0.11
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.21
76 0.2
77 0.16
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.12
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.11
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.19
114 0.19
115 0.17
116 0.2
117 0.18
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.1
125 0.12
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.16
138 0.2
139 0.28
140 0.31
141 0.31
142 0.35
143 0.43
144 0.51
145 0.58
146 0.56
147 0.52
148 0.57
149 0.58
150 0.54
151 0.5
152 0.43
153 0.36
154 0.35
155 0.32
156 0.24
157 0.21
158 0.18
159 0.15
160 0.13
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.14
172 0.18
173 0.22
174 0.25
175 0.27
176 0.34
177 0.44
178 0.53
179 0.56
180 0.62
181 0.68
182 0.76
183 0.83
184 0.85
185 0.85
186 0.83
187 0.82
188 0.76
189 0.73
190 0.67
191 0.58
192 0.52
193 0.5
194 0.48
195 0.48
196 0.52
197 0.56
198 0.64
199 0.74
200 0.81
201 0.85
202 0.9
203 0.95
204 0.97
205 0.97
206 0.98
207 0.97
208 0.97
209 0.97
210 0.96
211 0.96
212 0.97
213 0.96