Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40344

Protein Details
Accession P40344    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-265LLDKVRVVRQRRRKELQEEQELDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046962  Atg3  
IPR007135  Atg3/Atg10  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0061908  C:phagophore  
GO:0000407  C:phagophore assembly site  
GO:0019776  F:Atg8 ligase activity  
GO:0000045  P:autophagosome assembly  
GO:0000422  P:autophagy of mitochondrion  
GO:0044804  P:autophagy of nucleus  
GO:0006501  P:C-terminal protein lipidation  
GO:0032258  P:cytoplasm to vacuole transport by the Cvt pathway  
GO:0044805  P:late nucleophagy  
GO:0034727  P:piecemeal microautophagy of the nucleus  
GO:0006612  P:protein targeting to membrane  
GO:0061912  P:selective autophagy  
KEGG sce:YNR007C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03987  Autophagy_act_C  
Amino Acid Sequences MIRSTLSSWREYLTPITHKSTFLTTGQITPEEFVQAGDYLCHMFPTWKWNEESSDISYRDFLPKNKQFLIIRKVPCDKRAEQCVEVEGPDVIMKGFAEDGDEDDVLEYIGSETEHVQSTPAGGTKDSSIDDIDELIQDMEIKEEDENDDTEEFNAKGGLAKDMAQERYYDLYIAYSTSYRVPKMYIVGFNSNGSPLSPEQMFEDISADYRTKTATIEKLPFYKNSVLSVSIHPCKHANVMKILLDKVRVVRQRRRKELQEEQELDGVGDWEDLQDDIDDSLRVDQYLIVFLKFITSVTPSIQHDYTMEGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.41
4 0.4
5 0.4
6 0.4
7 0.39
8 0.35
9 0.3
10 0.3
11 0.25
12 0.27
13 0.28
14 0.27
15 0.24
16 0.21
17 0.2
18 0.16
19 0.15
20 0.12
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.09
30 0.1
31 0.11
32 0.2
33 0.24
34 0.26
35 0.29
36 0.3
37 0.34
38 0.36
39 0.38
40 0.34
41 0.37
42 0.33
43 0.31
44 0.31
45 0.28
46 0.32
47 0.32
48 0.31
49 0.35
50 0.41
51 0.47
52 0.47
53 0.52
54 0.5
55 0.54
56 0.58
57 0.56
58 0.53
59 0.53
60 0.6
61 0.57
62 0.58
63 0.56
64 0.53
65 0.52
66 0.58
67 0.57
68 0.49
69 0.47
70 0.44
71 0.38
72 0.33
73 0.26
74 0.17
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.05
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.1
149 0.13
150 0.14
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.11
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.1
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.17
173 0.19
174 0.21
175 0.22
176 0.21
177 0.2
178 0.18
179 0.15
180 0.12
181 0.11
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.11
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.1
200 0.13
201 0.17
202 0.22
203 0.26
204 0.29
205 0.34
206 0.35
207 0.35
208 0.35
209 0.35
210 0.31
211 0.29
212 0.27
213 0.24
214 0.24
215 0.27
216 0.3
217 0.31
218 0.3
219 0.29
220 0.28
221 0.28
222 0.33
223 0.34
224 0.3
225 0.29
226 0.32
227 0.34
228 0.36
229 0.36
230 0.3
231 0.27
232 0.25
233 0.24
234 0.29
235 0.33
236 0.38
237 0.47
238 0.56
239 0.65
240 0.73
241 0.78
242 0.79
243 0.81
244 0.84
245 0.84
246 0.83
247 0.77
248 0.69
249 0.63
250 0.54
251 0.44
252 0.34
253 0.24
254 0.14
255 0.1
256 0.08
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.16
274 0.16
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.09
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.2
286 0.21
287 0.27
288 0.27
289 0.26
290 0.23