FuNGI

P39904

Protein Details

Accession

P39904

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
553-572	ETVMTKCSKKTKSPERFLAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007258 Vps52
Gene Ontology	GO:0005856 C:cytoskeleton GO:0005829 C:cytosol GO:0010008 C:endosome membrane GO:0000938 C:GARP complex GO:0005794 C:Golgi apparatus GO:0019905 F:syntaxin binding GO:0030029 P:actin filament-based process GO:0032456 P:endocytic recycling GO:0006896 P:Golgi to vacuole transport GO:0090156 P:intracellular sphingolipid homeostasis GO:0016239 P:positive regulation of macroautophagy GO:0006623 P:protein targeting to vacuole GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
KEGG	sce:YDR484W -
Pfam	View protein in Pfam PF04129 Vps52

Amino Acid Sequences

MDVLKEVLSLDQDKFDQLKETSRDKTNETDDPFENYLKDCKFKAPSNKDQSPFAKLKSLQETHSNNEAAINIIIPQLIDYLTEFTNRLSNYTQDLDFIKKKSNELQSLLEYNSTKLAHISPMVNDLMIPPELIDDIIKGKINESWQDNITFIADKEEIYNKYRSNNLDQDNKDAENSAMLAPKDFDKLCQLLDILKNVILERSKRLIISKIKTLRSHNPVPSQRIQNKLLKVQKIFPFIRDNNLSLALELRQAYCYTMKWYYREYFSRYIRSLTILQFQQIDSQFALGNGLSTTSVSGFNNSPSLFFSNYLTTSASNAFYNKLPVTDEKIDKYFQIKKRLNILTQEDNTVMVSQIAENNTTKNYIEIGFKNLNLAILDNCTVEYHFLKDFFAMNGDNFEEINGLLEQIFQPTFDEATTYTQQLIQYNYDIFGVLISIRVANQLQFESERRGIPSMFDSFLNGQLIQLWPRFQQLVDFQCESLRKAAITTNVAKYAGNSSTSNSSPLTSPHELTVQFGKFLSSFLTLAITHKQSIDERSEPLYNSIIRLRNDFETVMTKCSKKTKSPERFLATNYMYLYNNLQQLHLHLNINDSDAQNYNFDSAENVGTKVANDDDNDSSVPLIIRETENHFKTLVEAFTRN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.22
3	0.24
4	0.23
5	0.31
6	0.34
7	0.4
8	0.43
9	0.49
10	0.52
11	0.5
12	0.55
13	0.53
14	0.55
15	0.53
16	0.52
17	0.46
18	0.49
19	0.48
20	0.42
21	0.37
22	0.31
23	0.34
24	0.32
25	0.34
26	0.29
27	0.34
28	0.4
29	0.47
30	0.56
31	0.58
32	0.65
33	0.72
34	0.79
35	0.74
36	0.76
37	0.71
38	0.68
39	0.63
40	0.55
41	0.53
42	0.47
43	0.52
44	0.53
45	0.53
46	0.47
47	0.52
48	0.54
49	0.51
50	0.55
51	0.48
52	0.38
53	0.36
54	0.33
55	0.26
56	0.21
57	0.16
58	0.1
59	0.1
60	0.1
61	0.08
62	0.08
63	0.07
64	0.06
65	0.07
66	0.07
67	0.09
68	0.1
69	0.11
70	0.12
71	0.12
72	0.17
73	0.16
74	0.18
75	0.18
76	0.19
77	0.23
78	0.26
79	0.25
80	0.22
81	0.24
82	0.28
83	0.31
84	0.31
85	0.35
86	0.34
87	0.37
88	0.43
89	0.5
90	0.49
91	0.48
92	0.5
93	0.46
94	0.47
95	0.44
96	0.4
97	0.31
98	0.26
99	0.27
100	0.23
101	0.18
102	0.17
103	0.18
104	0.16
105	0.18
106	0.19
107	0.16
108	0.19
109	0.19
110	0.17
111	0.16
112	0.14
113	0.13
114	0.12
115	0.11
116	0.07
117	0.07
118	0.08
119	0.08
120	0.07
121	0.06
122	0.08
123	0.1
124	0.11
125	0.11
126	0.12
127	0.14
128	0.17
129	0.21
130	0.23
131	0.25
132	0.24
133	0.25
134	0.25
135	0.23
136	0.21
137	0.17
138	0.13
139	0.14
140	0.13
141	0.12
142	0.14
143	0.19
144	0.2
145	0.23
146	0.27
147	0.25
148	0.28
149	0.32
150	0.34
151	0.36
152	0.42
153	0.44
154	0.48
155	0.48
156	0.51
157	0.5
158	0.46
159	0.39
160	0.32
161	0.26
162	0.17
163	0.17
164	0.12
165	0.13
166	0.12
167	0.12
168	0.12
169	0.14
170	0.17
171	0.15
172	0.15
173	0.16
174	0.17
175	0.17
176	0.17
177	0.16
178	0.17
179	0.19
180	0.19
181	0.16
182	0.16
183	0.16
184	0.15
185	0.18
186	0.16
187	0.16
188	0.19
189	0.21
190	0.21
191	0.22
192	0.24
193	0.29
194	0.34
195	0.37
196	0.41
197	0.45
198	0.49
199	0.53
200	0.56
201	0.57
202	0.56
203	0.6
204	0.56
205	0.59
206	0.59
207	0.61
208	0.62
209	0.62
210	0.6
211	0.59
212	0.59
213	0.55
214	0.53
215	0.55
216	0.55
217	0.51
218	0.48
219	0.49
220	0.49
221	0.51
222	0.48
223	0.43
224	0.44
225	0.4
226	0.44
227	0.39
228	0.35
229	0.29
230	0.3
231	0.27
232	0.18
233	0.18
234	0.12
235	0.12
236	0.11
237	0.1
238	0.09
239	0.09
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.13
244	0.18
245	0.19
246	0.2
247	0.25
248	0.26
249	0.3
250	0.33
251	0.35
252	0.37
253	0.39
254	0.42
255	0.39
256	0.38
257	0.34
258	0.33
259	0.31
260	0.25
261	0.27
262	0.21
263	0.21
264	0.2
265	0.19
266	0.21
267	0.18
268	0.18
269	0.12
270	0.13
271	0.12
272	0.11
273	0.11
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.13
292	0.11
293	0.12
294	0.13
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.12
308	0.11
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.16
313	0.2
314	0.21
315	0.21
316	0.22
317	0.22
318	0.22
319	0.26
320	0.28
321	0.29
322	0.39
323	0.4
324	0.42
325	0.51
326	0.53
327	0.5
328	0.47
329	0.47
330	0.43
331	0.4
332	0.38
333	0.29
334	0.25
335	0.24
336	0.18
337	0.13
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.1
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.13
353	0.13
354	0.18
355	0.18
356	0.18
357	0.18
358	0.17
359	0.16
360	0.13
361	0.12
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.09
372	0.09
373	0.1
374	0.1
375	0.11
376	0.12
377	0.1
378	0.11
379	0.1
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.07
387	0.06
388	0.07
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.07
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.16
409	0.17
410	0.18
411	0.15
412	0.15
413	0.15
414	0.15
415	0.13
416	0.12
417	0.09
418	0.07
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.04
423	0.05
424	0.04
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.09
429	0.09
430	0.1
431	0.12
432	0.14
433	0.18
434	0.2
435	0.2
436	0.21
437	0.22
438	0.21
439	0.2
440	0.22
441	0.19
442	0.18
443	0.16
444	0.17
445	0.17
446	0.19
447	0.19
448	0.15
449	0.12
450	0.13
451	0.14
452	0.14
453	0.15
454	0.14
455	0.13
456	0.15
457	0.16
458	0.14
459	0.17
460	0.21
461	0.24
462	0.28
463	0.28
464	0.26
465	0.29
466	0.3
467	0.28
468	0.24
469	0.2
470	0.15
471	0.15
472	0.18
473	0.19
474	0.23
475	0.26
476	0.26
477	0.27
478	0.28
479	0.27
480	0.25
481	0.25
482	0.21
483	0.2
484	0.17
485	0.18
486	0.22
487	0.22
488	0.23
489	0.19
490	0.19
491	0.16
492	0.18
493	0.24
494	0.23
495	0.23
496	0.22
497	0.26
498	0.25
499	0.26
500	0.31
501	0.24
502	0.22
503	0.21
504	0.2
505	0.17
506	0.17
507	0.17
508	0.12
509	0.11
510	0.11
511	0.13
512	0.12
513	0.14
514	0.19
515	0.19
516	0.17
517	0.18
518	0.21
519	0.21
520	0.25
521	0.29
522	0.27
523	0.27
524	0.3
525	0.32
526	0.31
527	0.3
528	0.3
529	0.24
530	0.24
531	0.28
532	0.3
533	0.29
534	0.32
535	0.33
536	0.31
537	0.33
538	0.31
539	0.26
540	0.27
541	0.27
542	0.29
543	0.3
544	0.29
545	0.31
546	0.4
547	0.43
548	0.45
549	0.55
550	0.61
551	0.68
552	0.76
553	0.81
554	0.79
555	0.77
556	0.71
557	0.69
558	0.6
559	0.53
560	0.45
561	0.38
562	0.32
563	0.3
564	0.31
565	0.26
566	0.28
567	0.25
568	0.24
569	0.21
570	0.24
571	0.28
572	0.27
573	0.25
574	0.21
575	0.24
576	0.24
577	0.26
578	0.26
579	0.21
580	0.2
581	0.21
582	0.22
583	0.2
584	0.2
585	0.19
586	0.15
587	0.15
588	0.14
589	0.13
590	0.16
591	0.16
592	0.16
593	0.16
594	0.16
595	0.16
596	0.17
597	0.17
598	0.15
599	0.15
600	0.19
601	0.2
602	0.22
603	0.22
604	0.2
605	0.18
606	0.17
607	0.16
608	0.12
609	0.11
610	0.12
611	0.13
612	0.17
613	0.24
614	0.32
615	0.34
616	0.35
617	0.34
618	0.31
619	0.32
620	0.33
621	0.3

P39904

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer