Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P39722

Protein Details
Accession P39722    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
422-445ALQVTKPRKMRRRSGKLYRSNINDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-436PRKMRRRSG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.333, cyto 6, cyto_mito 4.333, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011992  EF-hand-dom_pair  
IPR013566  EF_hand_assoc_1  
IPR013567  EF_hand_assoc_2  
IPR002048  EF_hand_dom  
IPR021181  Miro  
IPR020860  MIRO_dom  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR001806  Small_GTPase  
IPR003578  Small_GTPase_Rho  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0005741  C:mitochondrial outer membrane  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0098799  C:outer mitochondrial membrane protein complex  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0015886  P:heme transport  
GO:0000001  P:mitochondrion inheritance  
GO:0007005  P:mitochondrion organization  
GO:1990456  P:mitochondrion-endoplasmic reticulum membrane tethering  
GO:0055091  P:phospholipid homeostasis  
GO:0010821  P:regulation of mitochondrion organization  
GO:0007264  P:small GTPase mediated signal transduction  
KEGG sce:YAL048C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08355  EF_assoc_1  
PF08356  EF_assoc_2  
PF00071  Ras  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50222  EF_HAND_2  
PS51423  MIRO  
CDD cd01892  Miro2  
Amino Acid Sequences MTKETIRVVICGDEGVGKSSLIVSLTKAEFIPTIQDVLPPISIPRDFSSSPTYSPKNTVLIDTSDSDLIALDHELKSADVIWLVYCDHESYDHVSLFWLPHFRSLGLNIPVILCKNKCDSISNVNANAMVVSENSDDDIDTKVEDEEFIPILMEFKEIDTCIKTSAKTQFDLNQAFYLCQRAITHPISPLFDAMVGELKPLAVMALKRIFLLSDLNQDSYLDDNEILGLQKKCFNKSIDVNELNFIKDLLLDISKHDQEYINRKLYVPGKGITKDGFLVLNKIYAERGRHETTWAILRTFHYTDSLCINDKILHPRLVVPDTSSVELSPKGYRFLVDIFLKFDIDNDGGLNNQELHRLFKCTPGLPKLWTSTNFPFSTVVNNKGCITLQGWLAQWSMTTFLNYSTTTAYLVYFGFQEDARLALQVTKPRKMRRRSGKLYRSNINDRKVFNCFVIGKPCCGKSSLLEAFLGRSFSEEYSPTIKPRIAVNSLELKGGKQYYLILQELGEQEYAILENKDKLKECDVICLTYDSSDPESFSYLVSLLDKFTHLQDLPLVFVASKADLDKQQQRCQIQPDELADELFVNHPLHISSRWLSSLNELFIKITEAALDPGKNTPGLPEETAAKDVDYRQTALIFGSTVGFVALCSFTLMKLFKSSKFSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.15
4 0.13
5 0.13
6 0.13
7 0.14
8 0.12
9 0.12
10 0.1
11 0.16
12 0.17
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.17
18 0.2
19 0.15
20 0.17
21 0.16
22 0.18
23 0.18
24 0.19
25 0.19
26 0.15
27 0.15
28 0.17
29 0.17
30 0.19
31 0.21
32 0.25
33 0.25
34 0.28
35 0.34
36 0.32
37 0.35
38 0.4
39 0.4
40 0.37
41 0.42
42 0.42
43 0.4
44 0.38
45 0.37
46 0.32
47 0.31
48 0.31
49 0.28
50 0.27
51 0.22
52 0.2
53 0.17
54 0.15
55 0.12
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.15
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.17
87 0.21
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.25
92 0.3
93 0.27
94 0.27
95 0.23
96 0.22
97 0.23
98 0.23
99 0.25
100 0.18
101 0.18
102 0.23
103 0.26
104 0.27
105 0.29
106 0.32
107 0.36
108 0.44
109 0.46
110 0.42
111 0.39
112 0.38
113 0.34
114 0.28
115 0.2
116 0.12
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.2
152 0.28
153 0.29
154 0.29
155 0.31
156 0.34
157 0.39
158 0.41
159 0.37
160 0.31
161 0.29
162 0.28
163 0.26
164 0.23
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.21
170 0.23
171 0.24
172 0.25
173 0.27
174 0.27
175 0.26
176 0.23
177 0.17
178 0.15
179 0.13
180 0.1
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.1
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.16
199 0.13
200 0.17
201 0.18
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.16
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.17
218 0.2
219 0.22
220 0.27
221 0.29
222 0.3
223 0.35
224 0.41
225 0.44
226 0.45
227 0.43
228 0.41
229 0.39
230 0.34
231 0.27
232 0.2
233 0.11
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.15
245 0.19
246 0.27
247 0.31
248 0.32
249 0.32
250 0.32
251 0.36
252 0.38
253 0.38
254 0.33
255 0.29
256 0.28
257 0.29
258 0.3
259 0.25
260 0.22
261 0.18
262 0.16
263 0.15
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.23
278 0.22
279 0.21
280 0.26
281 0.24
282 0.18
283 0.17
284 0.17
285 0.2
286 0.2
287 0.19
288 0.15
289 0.14
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.21
299 0.21
300 0.22
301 0.21
302 0.23
303 0.25
304 0.24
305 0.22
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.13
329 0.13
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.05
339 0.05
340 0.08
341 0.08
342 0.11
343 0.12
344 0.16
345 0.16
346 0.2
347 0.22
348 0.22
349 0.26
350 0.27
351 0.28
352 0.26
353 0.28
354 0.26
355 0.27
356 0.26
357 0.28
358 0.28
359 0.32
360 0.3
361 0.29
362 0.27
363 0.24
364 0.3
365 0.26
366 0.29
367 0.24
368 0.25
369 0.24
370 0.24
371 0.24
372 0.17
373 0.15
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.09
383 0.09
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.07
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.09
410 0.11
411 0.18
412 0.22
413 0.27
414 0.33
415 0.42
416 0.51
417 0.56
418 0.64
419 0.69
420 0.76
421 0.79
422 0.84
423 0.86
424 0.86
425 0.85
426 0.82
427 0.78
428 0.77
429 0.74
430 0.69
431 0.64
432 0.56
433 0.53
434 0.5
435 0.44
436 0.34
437 0.32
438 0.28
439 0.25
440 0.32
441 0.3
442 0.29
443 0.31
444 0.32
445 0.27
446 0.27
447 0.26
448 0.19
449 0.27
450 0.26
451 0.24
452 0.24
453 0.23
454 0.23
455 0.23
456 0.21
457 0.12
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.12
462 0.12
463 0.14
464 0.18
465 0.19
466 0.19
467 0.21
468 0.21
469 0.21
470 0.24
471 0.27
472 0.26
473 0.26
474 0.28
475 0.34
476 0.34
477 0.34
478 0.3
479 0.25
480 0.25
481 0.25
482 0.2
483 0.13
484 0.13
485 0.14
486 0.18
487 0.19
488 0.15
489 0.14
490 0.18
491 0.18
492 0.18
493 0.15
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.12
502 0.16
503 0.2
504 0.22
505 0.24
506 0.27
507 0.33
508 0.33
509 0.37
510 0.35
511 0.33
512 0.32
513 0.31
514 0.27
515 0.21
516 0.21
517 0.15
518 0.17
519 0.16
520 0.16
521 0.15
522 0.17
523 0.16
524 0.16
525 0.14
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.11
530 0.09
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.12
535 0.16
536 0.15
537 0.15
538 0.18
539 0.18
540 0.18
541 0.18
542 0.17
543 0.12
544 0.12
545 0.13
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.12
550 0.15
551 0.23
552 0.31
553 0.37
554 0.44
555 0.51
556 0.53
557 0.55
558 0.58
559 0.58
560 0.53
561 0.5
562 0.46
563 0.43
564 0.39
565 0.34
566 0.27
567 0.22
568 0.18
569 0.14
570 0.14
571 0.11
572 0.11
573 0.11
574 0.11
575 0.14
576 0.14
577 0.18
578 0.17
579 0.19
580 0.21
581 0.22
582 0.22
583 0.26
584 0.29
585 0.28
586 0.27
587 0.25
588 0.24
589 0.23
590 0.25
591 0.19
592 0.14
593 0.12
594 0.12
595 0.13
596 0.16
597 0.16
598 0.14
599 0.17
600 0.18
601 0.17
602 0.16
603 0.17
604 0.18
605 0.22
606 0.22
607 0.21
608 0.24
609 0.26
610 0.28
611 0.25
612 0.22
613 0.21
614 0.22
615 0.27
616 0.26
617 0.25
618 0.24
619 0.25
620 0.25
621 0.23
622 0.2
623 0.14
624 0.11
625 0.11
626 0.09
627 0.08
628 0.08
629 0.07
630 0.06
631 0.08
632 0.08
633 0.07
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.15
638 0.16
639 0.16
640 0.24
641 0.28
642 0.31