Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P14736

Protein Details
Accession P14736    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-51NEKEAEKAPLSRRRRVRRKNQPLPDAKKKFKTGLBasic
125-147RRTSRNVCSNEERKRRKYFHMLYHydrophilic
503-523LKTGSRCKKVIKRTVGRPKGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-48EAEKAPLSRRRRVRRKNQPLPDAKKKFK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000111  C:nucleotide-excision repair factor 2 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071942  C:XPC complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:1990165  F:single-strand break-containing DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006265  P:DNA topological change  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0000715  P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG sce:YER162C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
CDD cd21393  sm_acid_XPC-like  
Amino Acid Sequences MNEDLPKEYFELIRKALNEKEAEKAPLSRRRRVRRKNQPLPDAKKKFKTGLNELPRESVVTVNLDSSDDGVVTVPTDDSVEEIQSSEEDYDSEEFEDVTDGNEVAGVEDISVEIKPSSKRNSDARRTSRNVCSNEERKRRKYFHMLYLVCLMVHGFIRNEWINSKRLSRKLSNLVPEKVFELLHPQKDEELPLRSTRKLLDGLKKCMELWQKHWKITKKYDNVGLYMRTWKEIEMSANNKRKFKTLKRSDFLRAVSKGHGDPDISVQGFVAMLRACNVNARLIMSCQPPDFTNMKIDTSLNGNNAYKDMVKYPIFWCEVWDKFSKKWITVDPVNLKTIEQVRLHSKLAPKGVACCERNMLRYVIAYDRKYGCRDVTRRYAQWMNSKVRKRRITKDDFGEKWFRKVITALHHRKRTKIDDYEDQYFFQRDESEGIPDSVQDLKNHPYYVLEQDIKQTQIVKPGCKECGYLKVHGKVGKVLKVYAKRDIADLKSARQWYMNGRILKTGSRCKKVIKRTVGRPKGEAEEEDERLYSFEDTELYIPPLASASGEITKNTFGNIEVFAPTMIPGNCCLVENPVAIKAARFLGVEFAPAVTSFKFERGSTVKPVLSGIVVAKWLREAIETAIDGIEFIQEDDNRKEHLLGALESWNTLLLKLRIRSKLNSTYGKIAEEEPNVTKEQNIADNHDNTETFMGGGFLPGIANHEARPYSEPSEPEDSLDYVSVDKAEESATDDDVGEDYSDFMKELEMSEESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.36
3 0.38
4 0.4
5 0.4
6 0.36
7 0.4
8 0.39
9 0.41
10 0.39
11 0.42
12 0.45
13 0.5
14 0.55
15 0.58
16 0.65
17 0.72
18 0.81
19 0.85
20 0.87
21 0.89
22 0.94
23 0.95
24 0.95
25 0.94
26 0.94
27 0.93
28 0.93
29 0.91
30 0.89
31 0.86
32 0.82
33 0.78
34 0.73
35 0.72
36 0.71
37 0.71
38 0.73
39 0.71
40 0.66
41 0.63
42 0.57
43 0.5
44 0.41
45 0.32
46 0.23
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.14
53 0.14
54 0.12
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.09
102 0.13
103 0.19
104 0.26
105 0.3
106 0.36
107 0.46
108 0.56
109 0.63
110 0.7
111 0.73
112 0.76
113 0.77
114 0.79
115 0.78
116 0.76
117 0.7
118 0.66
119 0.67
120 0.67
121 0.71
122 0.75
123 0.75
124 0.75
125 0.81
126 0.79
127 0.78
128 0.8
129 0.77
130 0.76
131 0.77
132 0.7
133 0.62
134 0.6
135 0.51
136 0.4
137 0.32
138 0.22
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.13
145 0.15
146 0.16
147 0.19
148 0.21
149 0.24
150 0.26
151 0.34
152 0.37
153 0.43
154 0.49
155 0.5
156 0.55
157 0.61
158 0.64
159 0.65
160 0.64
161 0.62
162 0.56
163 0.51
164 0.44
165 0.37
166 0.3
167 0.21
168 0.24
169 0.25
170 0.29
171 0.29
172 0.29
173 0.29
174 0.3
175 0.33
176 0.27
177 0.25
178 0.23
179 0.28
180 0.31
181 0.3
182 0.31
183 0.29
184 0.29
185 0.31
186 0.35
187 0.39
188 0.43
189 0.49
190 0.5
191 0.5
192 0.46
193 0.46
194 0.48
195 0.41
196 0.41
197 0.46
198 0.47
199 0.52
200 0.59
201 0.61
202 0.61
203 0.67
204 0.71
205 0.67
206 0.67
207 0.69
208 0.63
209 0.58
210 0.52
211 0.44
212 0.35
213 0.34
214 0.3
215 0.24
216 0.23
217 0.2
218 0.19
219 0.19
220 0.21
221 0.21
222 0.27
223 0.34
224 0.43
225 0.47
226 0.49
227 0.48
228 0.52
229 0.54
230 0.58
231 0.6
232 0.63
233 0.69
234 0.7
235 0.75
236 0.73
237 0.7
238 0.63
239 0.58
240 0.49
241 0.41
242 0.37
243 0.35
244 0.29
245 0.25
246 0.23
247 0.16
248 0.15
249 0.16
250 0.18
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.16
271 0.15
272 0.16
273 0.15
274 0.16
275 0.15
276 0.19
277 0.19
278 0.17
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.2
283 0.2
284 0.16
285 0.18
286 0.19
287 0.15
288 0.17
289 0.16
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.14
297 0.14
298 0.17
299 0.17
300 0.21
301 0.22
302 0.21
303 0.22
304 0.22
305 0.23
306 0.24
307 0.27
308 0.24
309 0.23
310 0.31
311 0.31
312 0.27
313 0.29
314 0.29
315 0.31
316 0.32
317 0.38
318 0.37
319 0.37
320 0.37
321 0.34
322 0.3
323 0.27
324 0.27
325 0.25
326 0.19
327 0.19
328 0.22
329 0.25
330 0.26
331 0.26
332 0.26
333 0.25
334 0.27
335 0.26
336 0.22
337 0.23
338 0.27
339 0.31
340 0.28
341 0.25
342 0.26
343 0.26
344 0.27
345 0.26
346 0.22
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.18
351 0.21
352 0.2
353 0.22
354 0.24
355 0.25
356 0.27
357 0.27
358 0.24
359 0.27
360 0.3
361 0.32
362 0.38
363 0.4
364 0.39
365 0.42
366 0.44
367 0.4
368 0.44
369 0.46
370 0.44
371 0.48
372 0.54
373 0.57
374 0.62
375 0.67
376 0.65
377 0.68
378 0.7
379 0.71
380 0.7
381 0.71
382 0.71
383 0.64
384 0.62
385 0.61
386 0.51
387 0.45
388 0.42
389 0.33
390 0.25
391 0.25
392 0.24
393 0.25
394 0.35
395 0.41
396 0.47
397 0.55
398 0.56
399 0.58
400 0.61
401 0.59
402 0.56
403 0.53
404 0.5
405 0.5
406 0.54
407 0.56
408 0.5
409 0.44
410 0.37
411 0.31
412 0.26
413 0.18
414 0.14
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.13
426 0.12
427 0.14
428 0.17
429 0.19
430 0.19
431 0.18
432 0.16
433 0.17
434 0.19
435 0.22
436 0.19
437 0.18
438 0.2
439 0.22
440 0.21
441 0.2
442 0.19
443 0.15
444 0.22
445 0.24
446 0.25
447 0.27
448 0.3
449 0.31
450 0.3
451 0.31
452 0.24
453 0.31
454 0.31
455 0.32
456 0.35
457 0.37
458 0.39
459 0.4
460 0.39
461 0.36
462 0.37
463 0.35
464 0.31
465 0.28
466 0.31
467 0.35
468 0.37
469 0.38
470 0.37
471 0.33
472 0.35
473 0.37
474 0.32
475 0.33
476 0.31
477 0.27
478 0.3
479 0.31
480 0.29
481 0.26
482 0.26
483 0.23
484 0.32
485 0.36
486 0.33
487 0.33
488 0.35
489 0.35
490 0.37
491 0.37
492 0.38
493 0.39
494 0.41
495 0.43
496 0.49
497 0.56
498 0.62
499 0.66
500 0.67
501 0.68
502 0.73
503 0.82
504 0.83
505 0.77
506 0.69
507 0.63
508 0.57
509 0.5
510 0.4
511 0.35
512 0.31
513 0.3
514 0.28
515 0.25
516 0.2
517 0.19
518 0.19
519 0.13
520 0.08
521 0.07
522 0.07
523 0.08
524 0.09
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.08
532 0.07
533 0.06
534 0.07
535 0.11
536 0.11
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.14
541 0.14
542 0.12
543 0.09
544 0.1
545 0.11
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.09
551 0.09
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.11
556 0.13
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.13
561 0.15
562 0.16
563 0.16
564 0.15
565 0.16
566 0.15
567 0.15
568 0.14
569 0.12
570 0.13
571 0.12
572 0.1
573 0.13
574 0.13
575 0.13
576 0.12
577 0.11
578 0.09
579 0.09
580 0.11
581 0.07
582 0.1
583 0.1
584 0.12
585 0.15
586 0.14
587 0.21
588 0.24
589 0.28
590 0.31
591 0.36
592 0.34
593 0.32
594 0.32
595 0.26
596 0.22
597 0.19
598 0.14
599 0.1
600 0.12
601 0.12
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.1
606 0.1
607 0.11
608 0.1
609 0.13
610 0.13
611 0.13
612 0.13
613 0.12
614 0.11
615 0.1
616 0.09
617 0.05
618 0.06
619 0.09
620 0.1
621 0.15
622 0.19
623 0.2
624 0.22
625 0.22
626 0.22
627 0.2
628 0.23
629 0.21
630 0.19
631 0.19
632 0.21
633 0.2
634 0.19
635 0.18
636 0.16
637 0.13
638 0.12
639 0.15
640 0.15
641 0.22
642 0.27
643 0.34
644 0.4
645 0.44
646 0.49
647 0.52
648 0.58
649 0.6
650 0.63
651 0.59
652 0.59
653 0.56
654 0.53
655 0.46
656 0.4
657 0.37
658 0.32
659 0.32
660 0.27
661 0.28
662 0.28
663 0.27
664 0.24
665 0.21
666 0.22
667 0.25
668 0.24
669 0.28
670 0.33
671 0.35
672 0.37
673 0.37
674 0.34
675 0.28
676 0.27
677 0.21
678 0.14
679 0.12
680 0.11
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.09
688 0.11
689 0.12
690 0.12
691 0.16
692 0.17
693 0.19
694 0.23
695 0.24
696 0.26
697 0.29
698 0.3
699 0.32
700 0.39
701 0.37
702 0.35
703 0.33
704 0.3
705 0.27
706 0.26
707 0.21
708 0.14
709 0.14
710 0.13
711 0.11
712 0.1
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.12
717 0.13
718 0.14
719 0.14
720 0.14
721 0.14
722 0.14
723 0.15
724 0.11
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.1
729 0.09
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.1
734 0.13