Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12021

Protein Details
Accession Q12021    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-338RMRNRLYSELKRNKNRFKTINHydrophilic
407-429QDLSRIKYKKRVSRRLLWFDKFLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 5.5, cyto_mito 4.5, mito 2.5, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR042238  Rad28/ERCC8/Ckn1/ATCSA-1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031464  C:Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex  
GO:0000109  C:nucleotide-excision repair complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
KEGG sce:YDR030C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MDPFLEFRVGNISLNEFYRRTIQSEFERILEDPLSNMKNYRFSKQSNYSTKEKTPLSIGVNCLDIDDTGQVLLGGGDDGSLSIWGLDESLHRNDEGEQELINKRLNYIKRQPHQSDDEPAQIMGYKNKRTRINDNNTMRLVHSFQTQRNKYRMYRQSSAAVPVQRSHISNKTDSPIGFSETLSETDSEASISHHKYGITTLKWYKADNGMFFTGSNDKTVKIWDTNRFEAVQDINLGYKINQIDNNVVDDSSLLVVASEDYYPRLIDLRTMNSGVTALGMGNQTRMQSEILCCKFNPVREQIIACGDMEGGVKLWDLRMRNRLYSELKRNKNRFKTINNDDNDDQSDVYFSSNQSKAHLRCCSDIVWNSEGSELCSVGMDGKLNVWRPFTEILQPEGLASYSQLGTQDLSRIKYKKRVSRRLLWFDKFLLCITDNGEVEIYNTEEKKLWNKLEYPMVNQVKKNQASHCQFSSMIVQTNIMNSVGLKLFFGTNNNTVSDGGSIFECS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.22
4 0.23
5 0.28
6 0.29
7 0.29
8 0.3
9 0.34
10 0.37
11 0.44
12 0.44
13 0.38
14 0.39
15 0.36
16 0.36
17 0.3
18 0.23
19 0.17
20 0.22
21 0.23
22 0.21
23 0.24
24 0.24
25 0.33
26 0.35
27 0.4
28 0.41
29 0.43
30 0.52
31 0.59
32 0.66
33 0.66
34 0.69
35 0.7
36 0.69
37 0.7
38 0.67
39 0.59
40 0.51
41 0.45
42 0.46
43 0.44
44 0.41
45 0.39
46 0.33
47 0.33
48 0.3
49 0.26
50 0.2
51 0.15
52 0.12
53 0.1
54 0.09
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.04
61 0.04
62 0.03
63 0.03
64 0.03
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.07
75 0.11
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.2
82 0.2
83 0.17
84 0.14
85 0.18
86 0.21
87 0.23
88 0.25
89 0.21
90 0.2
91 0.27
92 0.32
93 0.36
94 0.44
95 0.51
96 0.56
97 0.66
98 0.68
99 0.67
100 0.7
101 0.65
102 0.62
103 0.55
104 0.51
105 0.42
106 0.38
107 0.31
108 0.26
109 0.23
110 0.24
111 0.27
112 0.31
113 0.35
114 0.42
115 0.5
116 0.54
117 0.62
118 0.66
119 0.69
120 0.71
121 0.72
122 0.71
123 0.65
124 0.6
125 0.51
126 0.42
127 0.35
128 0.26
129 0.26
130 0.25
131 0.29
132 0.39
133 0.44
134 0.48
135 0.51
136 0.56
137 0.54
138 0.6
139 0.63
140 0.6
141 0.59
142 0.56
143 0.55
144 0.51
145 0.5
146 0.44
147 0.39
148 0.32
149 0.28
150 0.29
151 0.26
152 0.26
153 0.26
154 0.29
155 0.29
156 0.3
157 0.31
158 0.3
159 0.31
160 0.3
161 0.29
162 0.23
163 0.23
164 0.22
165 0.19
166 0.18
167 0.16
168 0.18
169 0.14
170 0.13
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.18
184 0.22
185 0.18
186 0.23
187 0.25
188 0.29
189 0.3
190 0.3
191 0.29
192 0.3
193 0.31
194 0.26
195 0.27
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.2
200 0.17
201 0.15
202 0.16
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.15
209 0.2
210 0.27
211 0.32
212 0.33
213 0.34
214 0.33
215 0.31
216 0.28
217 0.24
218 0.16
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.06
239 0.05
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.09
254 0.11
255 0.13
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.1
262 0.08
263 0.06
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.11
276 0.18
277 0.19
278 0.2
279 0.2
280 0.24
281 0.26
282 0.28
283 0.31
284 0.27
285 0.29
286 0.29
287 0.3
288 0.26
289 0.26
290 0.23
291 0.18
292 0.14
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.07
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.08
303 0.1
304 0.14
305 0.22
306 0.24
307 0.27
308 0.28
309 0.33
310 0.37
311 0.44
312 0.5
313 0.53
314 0.59
315 0.67
316 0.74
317 0.79
318 0.81
319 0.81
320 0.77
321 0.74
322 0.75
323 0.74
324 0.74
325 0.66
326 0.62
327 0.54
328 0.49
329 0.44
330 0.35
331 0.26
332 0.17
333 0.16
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.15
339 0.17
340 0.18
341 0.2
342 0.27
343 0.29
344 0.35
345 0.4
346 0.36
347 0.36
348 0.37
349 0.36
350 0.35
351 0.36
352 0.33
353 0.29
354 0.27
355 0.25
356 0.25
357 0.23
358 0.19
359 0.16
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.07
368 0.09
369 0.13
370 0.17
371 0.19
372 0.19
373 0.19
374 0.21
375 0.24
376 0.23
377 0.26
378 0.24
379 0.26
380 0.25
381 0.25
382 0.22
383 0.2
384 0.18
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.16
395 0.17
396 0.2
397 0.26
398 0.31
399 0.36
400 0.44
401 0.52
402 0.56
403 0.65
404 0.73
405 0.74
406 0.8
407 0.85
408 0.86
409 0.87
410 0.81
411 0.73
412 0.66
413 0.6
414 0.51
415 0.41
416 0.33
417 0.25
418 0.22
419 0.21
420 0.22
421 0.2
422 0.19
423 0.19
424 0.15
425 0.15
426 0.16
427 0.15
428 0.14
429 0.14
430 0.15
431 0.17
432 0.19
433 0.26
434 0.32
435 0.35
436 0.36
437 0.4
438 0.43
439 0.51
440 0.51
441 0.49
442 0.52
443 0.56
444 0.55
445 0.54
446 0.56
447 0.56
448 0.59
449 0.59
450 0.55
451 0.57
452 0.59
453 0.64
454 0.58
455 0.52
456 0.46
457 0.44
458 0.44
459 0.37
460 0.34
461 0.28
462 0.27
463 0.24
464 0.25
465 0.24
466 0.18
467 0.15
468 0.11
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.13
473 0.12
474 0.14
475 0.16
476 0.19
477 0.21
478 0.24
479 0.26
480 0.26
481 0.26
482 0.25
483 0.24
484 0.22
485 0.17
486 0.13