Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q08444

Protein Details
Accession Q08444    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-175EEDSESVPKKKNKRRGGKKQKAKREAREAREAEBasic
367-391SPLSKNSQKRYGKKGHVHSKPQENVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-170PKKKNKRRGGKKQKAKREARE
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039907  NOB1  
IPR017117  Nob1_euk  
IPR036283  NOB1_Zf-like_sf  
IPR014881  NOB1_Zn-bd  
IPR002716  PIN_dom  
IPR033411  Ribonuclease_PIN  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004521  F:RNA endonuclease activity  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0043248  P:proteasome assembly  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG sce:YOR056C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08772  NOB1_Zn_bind  
PF17146  PIN_6  
CDD cd09876  PIN_Nob1-like  
Amino Acid Sequences MTENQTAHVRALILDATPLITQSYTHYQNYAQSFYTTPTVFQEIKDAQARKNLEIWQSLGTLKLVHPSENSIAKVSTFAKLTGDYSVLSANDLHILALTYELEIKLNNGDWRLRKKPGDALDASKADVGTDGKQKLTEDNKKEEDSESVPKKKNKRRGGKKQKAKREAREAREAENANLELESKAEEHVEEAGSKEQICNDENIKESSDLNEVFEDADDDGDWITPENLTEAIIKDSGEDTTGSLGVEASEEDRHVALNRPENQVALATGDFAVQNVALQMNLNLMNFMSGLKIKRIRNYMLRCHACFKIFPLPKDGKPKHFCASCGGQGTLLRCAVSVDSRTGNVTPHLKSNFQWNNRGNRYSVASPLSKNSQKRYGKKGHVHSKPQENVILREDQKEYEKVIKQEEWTRRHNEKILNNWIGGGSADNYISPFAITGLKQHNVRIGKGRYVNSSKRRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.09
9 0.13
10 0.21
11 0.24
12 0.26
13 0.27
14 0.28
15 0.35
16 0.38
17 0.36
18 0.29
19 0.26
20 0.26
21 0.27
22 0.31
23 0.25
24 0.22
25 0.22
26 0.27
27 0.26
28 0.25
29 0.3
30 0.25
31 0.3
32 0.37
33 0.37
34 0.33
35 0.4
36 0.43
37 0.38
38 0.41
39 0.41
40 0.37
41 0.37
42 0.37
43 0.32
44 0.3
45 0.28
46 0.24
47 0.19
48 0.17
49 0.14
50 0.19
51 0.18
52 0.18
53 0.19
54 0.22
55 0.26
56 0.29
57 0.3
58 0.25
59 0.24
60 0.22
61 0.25
62 0.22
63 0.21
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.18
69 0.16
70 0.16
71 0.13
72 0.12
73 0.14
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.05
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.11
94 0.13
95 0.14
96 0.19
97 0.25
98 0.34
99 0.39
100 0.44
101 0.45
102 0.46
103 0.52
104 0.53
105 0.54
106 0.49
107 0.48
108 0.47
109 0.45
110 0.42
111 0.35
112 0.28
113 0.2
114 0.19
115 0.16
116 0.13
117 0.18
118 0.19
119 0.18
120 0.2
121 0.2
122 0.26
123 0.34
124 0.4
125 0.39
126 0.45
127 0.49
128 0.49
129 0.5
130 0.44
131 0.38
132 0.33
133 0.36
134 0.37
135 0.41
136 0.46
137 0.51
138 0.61
139 0.66
140 0.73
141 0.74
142 0.77
143 0.81
144 0.86
145 0.91
146 0.92
147 0.93
148 0.93
149 0.93
150 0.93
151 0.91
152 0.87
153 0.87
154 0.86
155 0.81
156 0.81
157 0.72
158 0.64
159 0.61
160 0.54
161 0.43
162 0.36
163 0.31
164 0.21
165 0.19
166 0.16
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.14
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.11
244 0.13
245 0.2
246 0.25
247 0.28
248 0.28
249 0.28
250 0.27
251 0.23
252 0.2
253 0.14
254 0.09
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.07
278 0.08
279 0.14
280 0.21
281 0.23
282 0.28
283 0.33
284 0.37
285 0.44
286 0.5
287 0.54
288 0.57
289 0.6
290 0.56
291 0.56
292 0.53
293 0.46
294 0.39
295 0.34
296 0.34
297 0.34
298 0.33
299 0.37
300 0.39
301 0.43
302 0.54
303 0.54
304 0.54
305 0.54
306 0.58
307 0.58
308 0.55
309 0.51
310 0.46
311 0.47
312 0.42
313 0.4
314 0.35
315 0.29
316 0.29
317 0.29
318 0.26
319 0.21
320 0.16
321 0.13
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.15
329 0.17
330 0.17
331 0.17
332 0.18
333 0.22
334 0.2
335 0.26
336 0.28
337 0.28
338 0.28
339 0.38
340 0.42
341 0.42
342 0.51
343 0.5
344 0.58
345 0.62
346 0.64
347 0.55
348 0.49
349 0.49
350 0.42
351 0.4
352 0.34
353 0.31
354 0.3
355 0.33
356 0.38
357 0.39
358 0.42
359 0.44
360 0.5
361 0.57
362 0.63
363 0.69
364 0.71
365 0.74
366 0.78
367 0.83
368 0.83
369 0.83
370 0.85
371 0.84
372 0.84
373 0.78
374 0.72
375 0.68
376 0.61
377 0.55
378 0.49
379 0.49
380 0.4
381 0.4
382 0.38
383 0.34
384 0.35
385 0.34
386 0.33
387 0.34
388 0.38
389 0.37
390 0.41
391 0.42
392 0.42
393 0.49
394 0.55
395 0.53
396 0.55
397 0.6
398 0.6
399 0.63
400 0.65
401 0.64
402 0.63
403 0.66
404 0.69
405 0.64
406 0.58
407 0.52
408 0.45
409 0.37
410 0.29
411 0.21
412 0.12
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.07
421 0.07
422 0.11
423 0.11
424 0.17
425 0.23
426 0.29
427 0.3
428 0.32
429 0.39
430 0.39
431 0.43
432 0.46
433 0.44
434 0.47
435 0.53
436 0.54
437 0.56
438 0.62
439 0.68