FuNGI

Q06623

Protein Details

Accession

Q06623

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
632-655	TIPRVRTQNGNTKKKSRAKKPGNV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
644-653	KKKSRAKKPG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038609 HDA1_su2/3_sf IPR021006 Hda2/3 IPR026216 HDA3
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0070823 C:HDA1 complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003682 F:chromatin binding GO:0003677 F:DNA binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0007059 P:chromosome segregation GO:0016575 P:histone deacetylation GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	sce:YPR179C -
Pfam	View protein in Pfam PF11496 HDA2-3

Amino Acid Sequences

MDLLRILDTKPIPTIVDATTLGISGNTSGDYWLPTTMSLYQKELTDQIVSLHYSDILRYFETSHYKEDVILESMKTMCLNGSLVATHPYLLIDHYMPKSLITRDVPAHLAENSGKFSVLRDLINLVQEYETETAIVCRPGRTMDLLEALLLGNKVHIKRYDGHSIKSKQKANDFSCTVHLFSSEGINFTKYPIKSKARFDMLICLDTTVDTSQKDIQYLLQYKRERKGLERYAPIVRLVAINSIDHCRLFFGKKFDKNSREYLENVTAAMVILRDRLGTLPPDLRPIYSQKLHYLVEWLENPTVPWPLPDIYPLKQYTSMDVERSLLTEVHFKKSDDQLEDAFSNCSKKRGRHGANKAASSTVAGIEDNITPSFYSTKRLKNDYYTNPLKQDMTQLTGITTADNSSNVNYHLSSGIITHKLIQSMGEVYMDICVQKQELDDYSCLDDLQNDHLKFFSNEDEKIIKEYETVLRTNNENLNRSHELEVENNLKFSQIETLEKDIETLKGSLMAQGETLSKLKDAFVKTDNVQDEIEKEERVSVSRDTEKKYMEQEIKRAVDAIRENEEETHKLNEKQNGLESELKLKFEKSEISTKELNEKIGFLKKELKLENDLNEELVGQLSKTMDNLENLTIPRVRTQNGNTKKKSRAKKPGNV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.18
3	0.21
4	0.19
5	0.19
6	0.18
7	0.17
8	0.15
9	0.12
10	0.11
11	0.08
12	0.08
13	0.07
14	0.07
15	0.08
16	0.09
17	0.1
18	0.11
19	0.11
20	0.11
21	0.11
22	0.13
23	0.18
24	0.23
25	0.24
26	0.26
27	0.27
28	0.28
29	0.3
30	0.29
31	0.25
32	0.21
33	0.19
34	0.17
35	0.18
36	0.18
37	0.16
38	0.15
39	0.15
40	0.14
41	0.14
42	0.15
43	0.14
44	0.14
45	0.15
46	0.17
47	0.2
48	0.28
49	0.3
50	0.31
51	0.32
52	0.31
53	0.32
54	0.32
55	0.29
56	0.24
57	0.24
58	0.2
59	0.19
60	0.19
61	0.18
62	0.16
63	0.13
64	0.1
65	0.1
66	0.11
67	0.09
68	0.1
69	0.1
70	0.1
71	0.13
72	0.13
73	0.12
74	0.11
75	0.11
76	0.1
77	0.11
78	0.12
79	0.1
80	0.16
81	0.16
82	0.19
83	0.18
84	0.19
85	0.22
86	0.21
87	0.26
88	0.23
89	0.27
90	0.27
91	0.29
92	0.3
93	0.27
94	0.27
95	0.21
96	0.22
97	0.19
98	0.19
99	0.19
100	0.18
101	0.17
102	0.15
103	0.16
104	0.19
105	0.19
106	0.17
107	0.16
108	0.18
109	0.2
110	0.23
111	0.22
112	0.17
113	0.14
114	0.14
115	0.16
116	0.14
117	0.12
118	0.09
119	0.09
120	0.1
121	0.11
122	0.15
123	0.13
124	0.12
125	0.13
126	0.15
127	0.17
128	0.18
129	0.18
130	0.17
131	0.18
132	0.18
133	0.16
134	0.15
135	0.13
136	0.12
137	0.1
138	0.08
139	0.07
140	0.11
141	0.12
142	0.16
143	0.18
144	0.2
145	0.25
146	0.31
147	0.4
148	0.39
149	0.43
150	0.48
151	0.53
152	0.59
153	0.62
154	0.62
155	0.56
156	0.62
157	0.67
158	0.62
159	0.63
160	0.57
161	0.5
162	0.49
163	0.46
164	0.38
165	0.29
166	0.25
167	0.17
168	0.15
169	0.17
170	0.13
171	0.13
172	0.13
173	0.14
174	0.14
175	0.15
176	0.21
177	0.17
178	0.23
179	0.3
180	0.38
181	0.42
182	0.48
183	0.54
184	0.53
185	0.54
186	0.5
187	0.5
188	0.44
189	0.4
190	0.34
191	0.26
192	0.2
193	0.18
194	0.18
195	0.1
196	0.09
197	0.08
198	0.1
199	0.14
200	0.15
201	0.15
202	0.14
203	0.16
204	0.22
205	0.28
206	0.3
207	0.34
208	0.38
209	0.43
210	0.48
211	0.51
212	0.45
213	0.44
214	0.51
215	0.52
216	0.54
217	0.53
218	0.52
219	0.5
220	0.49
221	0.44
222	0.34
223	0.25
224	0.19
225	0.15
226	0.14
227	0.1
228	0.1
229	0.11
230	0.13
231	0.13
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.12
236	0.15
237	0.18
238	0.23
239	0.31
240	0.37
241	0.44
242	0.51
243	0.55
244	0.56
245	0.59
246	0.55
247	0.48
248	0.44
249	0.42
250	0.36
251	0.3
252	0.26
253	0.2
254	0.16
255	0.13
256	0.11
257	0.07
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.09
267	0.12
268	0.12
269	0.17
270	0.17
271	0.17
272	0.17
273	0.2
274	0.24
275	0.24
276	0.25
277	0.23
278	0.26
279	0.26
280	0.24
281	0.23
282	0.18
283	0.17
284	0.17
285	0.16
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.11
290	0.12
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.12
297	0.14
298	0.14
299	0.19
300	0.19
301	0.19
302	0.21
303	0.21
304	0.2
305	0.22
306	0.21
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.14
311	0.15
312	0.13
313	0.09
314	0.08
315	0.15
316	0.16
317	0.19
318	0.2
319	0.2
320	0.22
321	0.26
322	0.3
323	0.25
324	0.25
325	0.21
326	0.22
327	0.22
328	0.2
329	0.16
330	0.12
331	0.14
332	0.13
333	0.18
334	0.2
335	0.22
336	0.3
337	0.4
338	0.48
339	0.55
340	0.64
341	0.68
342	0.69
343	0.67
344	0.59
345	0.49
346	0.41
347	0.31
348	0.22
349	0.12
350	0.08
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.1
361	0.09
362	0.15
363	0.19
364	0.26
365	0.3
366	0.35
367	0.37
368	0.41
369	0.49
370	0.49
371	0.52
372	0.51
373	0.49
374	0.46
375	0.45
376	0.4
377	0.32
378	0.32
379	0.25
380	0.22
381	0.21
382	0.19
383	0.17
384	0.17
385	0.17
386	0.11
387	0.09
388	0.07
389	0.06
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.08
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.08
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.13
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.1
411	0.1
412	0.11
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.08
425	0.1
426	0.12
427	0.12
428	0.14
429	0.15
430	0.15
431	0.14
432	0.12
433	0.11
434	0.1
435	0.16
436	0.22
437	0.21
438	0.21
439	0.21
440	0.23
441	0.22
442	0.23
443	0.23
444	0.19
445	0.19
446	0.22
447	0.24
448	0.23
449	0.24
450	0.23
451	0.17
452	0.14
453	0.16
454	0.18
455	0.19
456	0.2
457	0.2
458	0.21
459	0.22
460	0.26
461	0.29
462	0.29
463	0.29
464	0.29
465	0.35
466	0.36
467	0.37
468	0.34
469	0.3
470	0.28
471	0.27
472	0.31
473	0.28
474	0.25
475	0.23
476	0.21
477	0.2
478	0.17
479	0.16
480	0.17
481	0.14
482	0.17
483	0.19
484	0.23
485	0.23
486	0.23
487	0.24
488	0.19
489	0.18
490	0.16
491	0.14
492	0.1
493	0.12
494	0.12
495	0.14
496	0.14
497	0.13
498	0.11
499	0.12
500	0.13
501	0.12
502	0.13
503	0.11
504	0.11
505	0.11
506	0.12
507	0.17
508	0.18
509	0.2
510	0.22
511	0.27
512	0.27
513	0.34
514	0.34
515	0.3
516	0.28
517	0.25
518	0.23
519	0.24
520	0.24
521	0.17
522	0.16
523	0.17
524	0.17
525	0.18
526	0.2
527	0.17
528	0.22
529	0.3
530	0.35
531	0.37
532	0.41
533	0.42
534	0.43
535	0.45
536	0.48
537	0.49
538	0.48
539	0.49
540	0.53
541	0.53
542	0.49
543	0.47
544	0.38
545	0.36
546	0.36
547	0.34
548	0.31
549	0.3
550	0.31
551	0.32
552	0.35
553	0.3
554	0.28
555	0.3
556	0.29
557	0.33
558	0.38
559	0.42
560	0.42
561	0.43
562	0.47
563	0.43
564	0.44
565	0.44
566	0.39
567	0.42
568	0.4
569	0.39
570	0.34
571	0.32
572	0.29
573	0.26
574	0.31
575	0.27
576	0.34
577	0.35
578	0.4
579	0.42
580	0.42
581	0.49
582	0.45
583	0.44
584	0.35
585	0.34
586	0.33
587	0.38
588	0.37
589	0.32
590	0.39
591	0.39
592	0.46
593	0.48
594	0.47
595	0.46
596	0.49
597	0.52
598	0.48
599	0.45
600	0.38
601	0.34
602	0.29
603	0.22
604	0.19
605	0.13
606	0.08
607	0.09
608	0.09
609	0.1
610	0.1
611	0.14
612	0.15
613	0.17
614	0.2
615	0.2
616	0.22
617	0.23
618	0.27
619	0.26
620	0.24
621	0.28
622	0.3
623	0.3
624	0.34
625	0.41
626	0.47
627	0.55
628	0.65
629	0.67
630	0.71
631	0.8
632	0.82
633	0.85
634	0.85
635	0.86

Q06623

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer