Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04410

Protein Details
Accession Q04410    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-340SAFTAPPVPTKKKSKNKKGTQPLAMDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-331KKKSKNKK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.333, cyto 7.5, cyto_mito 6.666, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007583  GRASP55_65  
IPR024958  GRASP_PDZ  
IPR036034  PDZ_sf  
Gene Ontology GO:0005801  C:cis-Golgi network  
GO:0033106  C:cis-Golgi network membrane  
GO:0106103  C:COPII vesicles tethering complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0044877  F:protein-containing complex binding  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0007030  P:Golgi organization  
GO:0009306  P:protein secretion  
KEGG sce:YDR517W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04495  GRASP55_65  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51865  PDZ_GRASP  
Amino Acid Sequences MFRIAKNLVRTFEQSVQDTLALSQDSSNLDAFFQSIPPNLLSAQLESPVDAVSEGVKHTNVNETLSGLRIVWVDEMQFQLQSFFDYIVGFNDDPVPVVSNQHGFSYPDYRRITSIFNEHCGRTLKVNIWSAKGGTFRDEYISIISKESDDLDDVSLNHDERRPSSGEAHQFQALGFKVQWTPLIASTFTYHILNVNIPDGPAQSAGLIPDEDYIIGCQDGLLATGGETLLQDIVRSRANYDLVLYVYNKVSDCVRPITVHIGPDGRLGCNVGYGFLHRIPTVKHCPQQAQQQGQDDNPVPVPVPVESETAFVPSAFTAPPVPTKKKSKNKKGTQPLAMDDYFNEGRDKSSTAAKSAESDILAPPPQKQSSSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.39
3 0.38
4 0.34
5 0.3
6 0.24
7 0.2
8 0.15
9 0.13
10 0.12
11 0.13
12 0.14
13 0.15
14 0.15
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.15
26 0.14
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.16
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.16
35 0.12
36 0.11
37 0.09
38 0.08
39 0.06
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.18
47 0.18
48 0.19
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.2
53 0.2
54 0.13
55 0.13
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.13
76 0.12
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.09
84 0.11
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.16
90 0.15
91 0.17
92 0.24
93 0.24
94 0.29
95 0.31
96 0.31
97 0.31
98 0.32
99 0.32
100 0.27
101 0.35
102 0.28
103 0.31
104 0.33
105 0.32
106 0.34
107 0.34
108 0.32
109 0.26
110 0.27
111 0.25
112 0.29
113 0.35
114 0.33
115 0.32
116 0.31
117 0.29
118 0.28
119 0.27
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.16
125 0.16
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.2
152 0.24
153 0.28
154 0.29
155 0.3
156 0.27
157 0.25
158 0.23
159 0.23
160 0.18
161 0.13
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.07
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.13
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.16
243 0.18
244 0.23
245 0.23
246 0.22
247 0.21
248 0.19
249 0.18
250 0.21
251 0.21
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.13
262 0.14
263 0.15
264 0.13
265 0.15
266 0.16
267 0.24
268 0.31
269 0.35
270 0.38
271 0.41
272 0.46
273 0.5
274 0.58
275 0.59
276 0.58
277 0.56
278 0.58
279 0.56
280 0.5
281 0.5
282 0.41
283 0.34
284 0.27
285 0.23
286 0.17
287 0.15
288 0.16
289 0.11
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.08
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.2
307 0.27
308 0.34
309 0.4
310 0.51
311 0.61
312 0.69
313 0.79
314 0.82
315 0.85
316 0.9
317 0.93
318 0.94
319 0.92
320 0.9
321 0.84
322 0.77
323 0.73
324 0.62
325 0.52
326 0.41
327 0.39
328 0.31
329 0.27
330 0.24
331 0.18
332 0.19
333 0.2
334 0.22
335 0.17
336 0.25
337 0.25
338 0.27
339 0.29
340 0.28
341 0.29
342 0.3
343 0.31
344 0.23
345 0.22
346 0.21
347 0.23
348 0.25
349 0.23
350 0.24
351 0.29
352 0.31