Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53850

Protein Details
Accession P53850    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
315-340LSNKSCSSKTPNKHPKQQLNEKEYYYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG sce:YNL254C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MVGPGLGINRVRRKGVYSTKKGSGDNLLLMKRQGKHDIHDRESDDLSGHDAFSPSKKRGKIDSITEDEIEVKKLSTVATFDKLSRSFPNSEVQAAKNAALRGKEKEEEKVVSIPLIQNLKNEDIESIKCRNNNLLDGKKLLLEAELSAVEDNQIFSSSFPEDKKLSLQSCLSSKEQIIKKLQVREEYMSKFKLPPMLFSDELLTEVEPFMPIVMDILEGKISSVYYFEAKNAFKNSQKAYLSVDEFRKLNLNKFTAGFYGLKRQLRVGEEIAKRYKRALTHNQPATLKWWGITDFCNYVLAPETLTSFCIYQLNLSNKSCSSKTPNKHPKQQLNEKEYYYDPELRMLAYDLLEDTVEYGIIVADSDPIEQWEAAIEEDRLRELKLDVHNYSSRRWRLDTHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.56
3 0.59
4 0.6
5 0.64
6 0.69
7 0.72
8 0.68
9 0.62
10 0.58
11 0.5
12 0.46
13 0.45
14 0.39
15 0.36
16 0.38
17 0.41
18 0.37
19 0.39
20 0.42
21 0.39
22 0.43
23 0.52
24 0.58
25 0.57
26 0.6
27 0.57
28 0.52
29 0.5
30 0.44
31 0.34
32 0.25
33 0.24
34 0.18
35 0.16
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.2
40 0.26
41 0.28
42 0.34
43 0.38
44 0.41
45 0.48
46 0.55
47 0.55
48 0.58
49 0.61
50 0.6
51 0.59
52 0.55
53 0.48
54 0.42
55 0.36
56 0.29
57 0.21
58 0.15
59 0.12
60 0.13
61 0.13
62 0.11
63 0.14
64 0.15
65 0.19
66 0.2
67 0.21
68 0.25
69 0.26
70 0.28
71 0.29
72 0.3
73 0.29
74 0.3
75 0.35
76 0.31
77 0.34
78 0.34
79 0.31
80 0.3
81 0.29
82 0.28
83 0.25
84 0.25
85 0.24
86 0.24
87 0.25
88 0.25
89 0.29
90 0.32
91 0.3
92 0.33
93 0.35
94 0.34
95 0.34
96 0.31
97 0.27
98 0.23
99 0.23
100 0.19
101 0.19
102 0.21
103 0.19
104 0.19
105 0.21
106 0.23
107 0.22
108 0.21
109 0.18
110 0.16
111 0.18
112 0.2
113 0.22
114 0.23
115 0.24
116 0.25
117 0.29
118 0.29
119 0.33
120 0.37
121 0.37
122 0.36
123 0.36
124 0.35
125 0.31
126 0.28
127 0.22
128 0.14
129 0.1
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.09
145 0.12
146 0.12
147 0.15
148 0.15
149 0.16
150 0.18
151 0.21
152 0.21
153 0.21
154 0.22
155 0.21
156 0.23
157 0.26
158 0.24
159 0.2
160 0.2
161 0.25
162 0.27
163 0.3
164 0.31
165 0.35
166 0.38
167 0.43
168 0.45
169 0.41
170 0.41
171 0.39
172 0.4
173 0.36
174 0.35
175 0.3
176 0.28
177 0.25
178 0.23
179 0.27
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.27
184 0.26
185 0.25
186 0.25
187 0.18
188 0.19
189 0.16
190 0.11
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.12
216 0.13
217 0.16
218 0.19
219 0.21
220 0.23
221 0.29
222 0.3
223 0.33
224 0.33
225 0.31
226 0.31
227 0.32
228 0.31
229 0.3
230 0.3
231 0.25
232 0.24
233 0.24
234 0.27
235 0.25
236 0.28
237 0.29
238 0.29
239 0.28
240 0.29
241 0.29
242 0.23
243 0.25
244 0.21
245 0.16
246 0.23
247 0.27
248 0.29
249 0.28
250 0.29
251 0.3
252 0.31
253 0.33
254 0.27
255 0.3
256 0.31
257 0.36
258 0.42
259 0.4
260 0.38
261 0.37
262 0.38
263 0.33
264 0.39
265 0.45
266 0.47
267 0.56
268 0.6
269 0.63
270 0.6
271 0.56
272 0.51
273 0.44
274 0.34
275 0.24
276 0.21
277 0.17
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.16
282 0.16
283 0.17
284 0.15
285 0.14
286 0.16
287 0.14
288 0.11
289 0.1
290 0.12
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.11
298 0.12
299 0.19
300 0.25
301 0.29
302 0.3
303 0.32
304 0.32
305 0.36
306 0.34
307 0.32
308 0.35
309 0.39
310 0.46
311 0.55
312 0.65
313 0.7
314 0.79
315 0.85
316 0.85
317 0.86
318 0.89
319 0.88
320 0.85
321 0.81
322 0.72
323 0.65
324 0.56
325 0.51
326 0.46
327 0.41
328 0.33
329 0.31
330 0.31
331 0.27
332 0.27
333 0.23
334 0.19
335 0.13
336 0.13
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.04
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.14
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.16
369 0.15
370 0.21
371 0.27
372 0.33
373 0.33
374 0.39
375 0.44
376 0.45
377 0.5
378 0.53
379 0.52
380 0.5
381 0.51