Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38241

Protein Details
Accession P38241    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-364FPTKSTDNAKNDKKKTSKKVHKDRSKKSKPRANKLTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
338-361NDKKKTSKKVHKDRSKKSKPRANK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR034356  Slt11_RRM  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0036002  F:pre-mRNA binding  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG sce:YBR065C  -  
CDD cd12265  RRM_SLT11  
Amino Acid Sequences MNDEINEPPPNICEQCLGDEANIRMTKIPQGSECKICTLPFTLYHFKTSKRSNNIIKTLICVRCATQRNICQCCMLDSRWHIPIQLRDHLISLVNEENVMTEEAKNDMMKRFLSLKNVKLGGAQITSDPSEADNIVDKLKNILLRATSDGPSTPLIKNTTALYKNEKGANEVKNLEKYASVDISHILKKLPLNESFLKNPSTKSFFLYNIDASIPEWKITDTVSQLLGIKKWKDGNSLSLIVNHKAKCGGLRFQSSELGERFVSKISETLVTPKGLKRGVLLIDRFRIFIIPWSSGFSAASFGTNTAENIKLSLSLNKLIQLELGLSFPTKSTDNAKNDKKKTSKKVHKDRSKKSKPRANKLTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.27
4 0.26
5 0.22
6 0.25
7 0.25
8 0.29
9 0.28
10 0.25
11 0.25
12 0.25
13 0.3
14 0.29
15 0.31
16 0.29
17 0.36
18 0.41
19 0.45
20 0.45
21 0.43
22 0.41
23 0.39
24 0.35
25 0.3
26 0.28
27 0.27
28 0.33
29 0.37
30 0.37
31 0.43
32 0.43
33 0.44
34 0.49
35 0.53
36 0.56
37 0.56
38 0.63
39 0.66
40 0.73
41 0.75
42 0.73
43 0.64
44 0.58
45 0.58
46 0.52
47 0.44
48 0.36
49 0.31
50 0.35
51 0.4
52 0.41
53 0.41
54 0.46
55 0.54
56 0.57
57 0.56
58 0.5
59 0.45
60 0.44
61 0.4
62 0.34
63 0.31
64 0.32
65 0.35
66 0.36
67 0.35
68 0.32
69 0.33
70 0.38
71 0.37
72 0.38
73 0.36
74 0.33
75 0.34
76 0.33
77 0.3
78 0.23
79 0.2
80 0.16
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.16
98 0.21
99 0.22
100 0.31
101 0.34
102 0.35
103 0.39
104 0.4
105 0.38
106 0.33
107 0.32
108 0.24
109 0.2
110 0.17
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.17
133 0.18
134 0.17
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.17
140 0.14
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.22
147 0.21
148 0.23
149 0.26
150 0.26
151 0.29
152 0.31
153 0.3
154 0.27
155 0.3
156 0.31
157 0.28
158 0.28
159 0.26
160 0.25
161 0.25
162 0.22
163 0.17
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.11
168 0.09
169 0.1
170 0.12
171 0.13
172 0.12
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.16
177 0.18
178 0.17
179 0.22
180 0.25
181 0.28
182 0.29
183 0.3
184 0.29
185 0.26
186 0.26
187 0.24
188 0.25
189 0.23
190 0.24
191 0.24
192 0.23
193 0.25
194 0.26
195 0.22
196 0.18
197 0.18
198 0.15
199 0.12
200 0.14
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.17
216 0.17
217 0.19
218 0.24
219 0.24
220 0.27
221 0.28
222 0.3
223 0.31
224 0.33
225 0.3
226 0.3
227 0.3
228 0.28
229 0.32
230 0.28
231 0.24
232 0.22
233 0.22
234 0.21
235 0.22
236 0.26
237 0.25
238 0.3
239 0.32
240 0.33
241 0.36
242 0.33
243 0.34
244 0.29
245 0.26
246 0.21
247 0.2
248 0.19
249 0.16
250 0.16
251 0.11
252 0.12
253 0.11
254 0.13
255 0.12
256 0.16
257 0.18
258 0.19
259 0.21
260 0.22
261 0.26
262 0.25
263 0.25
264 0.21
265 0.24
266 0.27
267 0.31
268 0.32
269 0.31
270 0.36
271 0.36
272 0.35
273 0.3
274 0.26
275 0.2
276 0.23
277 0.22
278 0.19
279 0.19
280 0.23
281 0.23
282 0.23
283 0.23
284 0.16
285 0.15
286 0.13
287 0.13
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.18
301 0.18
302 0.2
303 0.21
304 0.24
305 0.24
306 0.22
307 0.21
308 0.17
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.11
318 0.13
319 0.2
320 0.28
321 0.36
322 0.46
323 0.56
324 0.64
325 0.69
326 0.77
327 0.8
328 0.81
329 0.84
330 0.85
331 0.86
332 0.87
333 0.93
334 0.94
335 0.95
336 0.95
337 0.95
338 0.95
339 0.96
340 0.95
341 0.94
342 0.94
343 0.94
344 0.94