Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12089

Protein Details
Accession Q12089    Localization Confidence Low Confidence Score 7.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
553-576TNLPSNISQKKREYRNRVKAIATKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 7.5, cyto_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0070124  P:mitochondrial translational initiation  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG sce:YPL005W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MNTLRCLTQALSKSGREAPKLYQKVIFPGLFREGIPIANVKKVDEKIIDSPTSTSVNGEAKKIVRHGVKYEREQVKEYLSSLPTLTLSRKQIRDDYDEERAKRMYMFSKQTNSSNKFQKLLTAKSQEFTRELLTLLIDCTSNEKNSGPERFTRKFLKFSNDEIPPLPDFSKNPQLFENYIGILSHTKFNFRSSSKLNGIVRKMLRHLLHPTNKTTLPLRSAQVYNDSIYFFSEHFDFASCREIFAQMKAEGTKPNTITFNLLLRNVVKNSHIRKTKHPDDEVLFYLRSMRNHGVFADVITWTTCYNFLRDEVSRQLYIVQMGEHLGNFNVNFVYTVLRNGDYRAEDCLKVLAANSLPISRKTFYLCIERLLNEEQLETASKLLDYGFQHLKSNFKLDSEAMNHFMRVFANKGRSDLAFLCYNTCRKIYKIKPDSQTFEMLFKALVRNGNTKNFGAVLQYIKDLKVSEGFGLRTSYWRTKADSIFKFGSPNTLSEKSIEKARKLLGNLIASEGEFSWKIWKESDSSQKKILRFLGCIPTTLRCTNTAQDHQKPTNLPSNISQKKREYRNRVKAIATKAALEKRMAYIKDNDVAFKKELVKRRIVGEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.49
3 0.46
4 0.43
5 0.45
6 0.51
7 0.55
8 0.54
9 0.51
10 0.47
11 0.49
12 0.53
13 0.47
14 0.37
15 0.36
16 0.38
17 0.34
18 0.32
19 0.29
20 0.23
21 0.21
22 0.22
23 0.23
24 0.2
25 0.24
26 0.25
27 0.23
28 0.29
29 0.3
30 0.34
31 0.31
32 0.34
33 0.35
34 0.4
35 0.4
36 0.34
37 0.34
38 0.31
39 0.31
40 0.26
41 0.21
42 0.19
43 0.25
44 0.26
45 0.26
46 0.28
47 0.28
48 0.31
49 0.33
50 0.36
51 0.35
52 0.37
53 0.43
54 0.49
55 0.55
56 0.57
57 0.65
58 0.66
59 0.63
60 0.62
61 0.57
62 0.52
63 0.46
64 0.41
65 0.37
66 0.3
67 0.28
68 0.25
69 0.23
70 0.19
71 0.2
72 0.22
73 0.22
74 0.29
75 0.36
76 0.39
77 0.42
78 0.47
79 0.5
80 0.53
81 0.51
82 0.49
83 0.51
84 0.54
85 0.51
86 0.49
87 0.45
88 0.39
89 0.35
90 0.34
91 0.3
92 0.32
93 0.38
94 0.41
95 0.47
96 0.49
97 0.55
98 0.61
99 0.6
100 0.59
101 0.61
102 0.58
103 0.54
104 0.51
105 0.51
106 0.48
107 0.49
108 0.49
109 0.48
110 0.45
111 0.46
112 0.48
113 0.43
114 0.38
115 0.34
116 0.27
117 0.2
118 0.19
119 0.17
120 0.15
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.08
125 0.07
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.15
131 0.19
132 0.24
133 0.29
134 0.28
135 0.33
136 0.4
137 0.42
138 0.47
139 0.51
140 0.49
141 0.51
142 0.53
143 0.54
144 0.5
145 0.52
146 0.54
147 0.48
148 0.46
149 0.39
150 0.38
151 0.3
152 0.29
153 0.25
154 0.2
155 0.19
156 0.24
157 0.33
158 0.3
159 0.31
160 0.31
161 0.33
162 0.32
163 0.33
164 0.29
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.16
172 0.14
173 0.17
174 0.18
175 0.2
176 0.26
177 0.25
178 0.3
179 0.29
180 0.36
181 0.36
182 0.43
183 0.44
184 0.44
185 0.44
186 0.46
187 0.44
188 0.39
189 0.38
190 0.37
191 0.33
192 0.32
193 0.37
194 0.39
195 0.45
196 0.45
197 0.46
198 0.44
199 0.44
200 0.42
201 0.38
202 0.31
203 0.27
204 0.27
205 0.25
206 0.25
207 0.25
208 0.24
209 0.26
210 0.24
211 0.21
212 0.19
213 0.18
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.15
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.17
232 0.2
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.17
237 0.17
238 0.19
239 0.22
240 0.19
241 0.2
242 0.2
243 0.2
244 0.21
245 0.19
246 0.2
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.15
251 0.17
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.2
256 0.24
257 0.31
258 0.37
259 0.37
260 0.46
261 0.54
262 0.61
263 0.61
264 0.59
265 0.55
266 0.5
267 0.51
268 0.44
269 0.36
270 0.27
271 0.19
272 0.22
273 0.2
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.18
280 0.16
281 0.14
282 0.14
283 0.11
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.17
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.15
304 0.15
305 0.12
306 0.08
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.15
335 0.13
336 0.12
337 0.11
338 0.09
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.16
346 0.15
347 0.16
348 0.18
349 0.2
350 0.2
351 0.26
352 0.25
353 0.25
354 0.26
355 0.25
356 0.26
357 0.25
358 0.24
359 0.16
360 0.16
361 0.13
362 0.12
363 0.13
364 0.1
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.1
371 0.1
372 0.14
373 0.18
374 0.19
375 0.22
376 0.23
377 0.27
378 0.24
379 0.27
380 0.23
381 0.19
382 0.2
383 0.18
384 0.22
385 0.22
386 0.22
387 0.22
388 0.22
389 0.21
390 0.19
391 0.19
392 0.15
393 0.13
394 0.14
395 0.15
396 0.21
397 0.21
398 0.23
399 0.24
400 0.23
401 0.25
402 0.24
403 0.23
404 0.2
405 0.2
406 0.22
407 0.23
408 0.25
409 0.23
410 0.24
411 0.23
412 0.22
413 0.32
414 0.37
415 0.45
416 0.52
417 0.58
418 0.64
419 0.69
420 0.71
421 0.64
422 0.62
423 0.51
424 0.44
425 0.36
426 0.28
427 0.22
428 0.17
429 0.17
430 0.14
431 0.17
432 0.18
433 0.25
434 0.29
435 0.35
436 0.37
437 0.35
438 0.33
439 0.3
440 0.27
441 0.22
442 0.21
443 0.17
444 0.14
445 0.17
446 0.16
447 0.16
448 0.17
449 0.15
450 0.14
451 0.15
452 0.15
453 0.14
454 0.17
455 0.17
456 0.17
457 0.19
458 0.18
459 0.19
460 0.24
461 0.28
462 0.3
463 0.32
464 0.35
465 0.39
466 0.46
467 0.52
468 0.49
469 0.49
470 0.47
471 0.46
472 0.44
473 0.37
474 0.38
475 0.29
476 0.28
477 0.29
478 0.29
479 0.29
480 0.28
481 0.32
482 0.27
483 0.34
484 0.36
485 0.31
486 0.33
487 0.37
488 0.39
489 0.37
490 0.42
491 0.4
492 0.38
493 0.36
494 0.34
495 0.3
496 0.25
497 0.24
498 0.18
499 0.14
500 0.11
501 0.11
502 0.16
503 0.19
504 0.2
505 0.21
506 0.23
507 0.24
508 0.32
509 0.43
510 0.44
511 0.45
512 0.52
513 0.56
514 0.56
515 0.58
516 0.58
517 0.51
518 0.46
519 0.48
520 0.5
521 0.45
522 0.45
523 0.41
524 0.38
525 0.39
526 0.38
527 0.34
528 0.27
529 0.3
530 0.35
531 0.41
532 0.46
533 0.49
534 0.55
535 0.62
536 0.62
537 0.64
538 0.61
539 0.58
540 0.58
541 0.51
542 0.45
543 0.44
544 0.52
545 0.55
546 0.58
547 0.6
548 0.6
549 0.68
550 0.76
551 0.8
552 0.8
553 0.82
554 0.87
555 0.89
556 0.85
557 0.83
558 0.79
559 0.76
560 0.74
561 0.63
562 0.56
563 0.54
564 0.54
565 0.5
566 0.44
567 0.39
568 0.35
569 0.42
570 0.39
571 0.36
572 0.37
573 0.39
574 0.44
575 0.42
576 0.42
577 0.38
578 0.41
579 0.39
580 0.37
581 0.41
582 0.42
583 0.51
584 0.52
585 0.56
586 0.55