Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q08923

Protein Details
Accession Q08923    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-160EARSIYKPVQEKRRQSRRKARSAAASKHydrophilic
201-222AKDGNTRSSRRRRRNSMDDASTHydrophilic
372-398KASSRGSKRVSKPARKGNRTRRSNTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-158KRRQSRRKARSAAA
372-393KASSRGSKRVSKPARKGNRTRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0033698  C:Rpd3L complex  
GO:0070210  C:Rpd3L-Expanded complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0061188  P:negative regulation of rDNA heterochromatin formation  
GO:0061186  P:negative regulation of silent mating-type cassette heterochromatin formation  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
GO:0030174  P:regulation of DNA-templated DNA replication initiation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YPL181W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15550  PHD_MLL5  
Amino Acid Sequences MESTAIVPKGPVVGSEDMEKAEVIASGSTDIISTTSTATTTAAIGSVQEESVKQEDVPMEGGEGEVEEEEGETRCICGELDTPDDSGFFIQCEQCSSWQHGYCVSITQDNAPDKYWCEQCRPELHQLFTTDTGEARSIYKPVQEKRRQSRRKARSAAASKSHAANEAEKSPRNTSNTDDNVDDIGDEEDEVEDEASAVALAKDGNTRSSRRRRRNSMDDASTDQYSLDPGDSDKKLLDRKRATFMAREEKQYQRMLEKALKESRRTSHQEDPESYENDADIYQGDTDNHNGTTRLQTDVMLTEGKPDSVTNDDMKESLRPSKEQSMEKTNDVEKEASQEKESSTGSAQDTEKTDEPILPLTSISSSEDDSRKASSRGSKRVSKPARKGNRTRRSNTSSDTNQNRRSADIGTDKPVKPRLPPQRTSLNEMRRRVSAILEFISRTQWELSEDQSDREEFVRFVENQHFVEKVDTIYNGYNESLSMMDDLTRELLLWEKKYSNNTNAIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.22
3 0.22
4 0.2
5 0.2
6 0.19
7 0.14
8 0.12
9 0.11
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.11
38 0.13
39 0.14
40 0.13
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.19
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.13
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.05
53 0.05
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.11
66 0.14
67 0.17
68 0.19
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.17
73 0.15
74 0.12
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.15
80 0.16
81 0.19
82 0.22
83 0.28
84 0.32
85 0.33
86 0.34
87 0.32
88 0.32
89 0.29
90 0.29
91 0.25
92 0.2
93 0.18
94 0.2
95 0.24
96 0.26
97 0.26
98 0.24
99 0.24
100 0.24
101 0.29
102 0.33
103 0.29
104 0.33
105 0.36
106 0.41
107 0.48
108 0.51
109 0.56
110 0.54
111 0.54
112 0.51
113 0.49
114 0.46
115 0.39
116 0.35
117 0.25
118 0.2
119 0.18
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.18
127 0.24
128 0.3
129 0.41
130 0.47
131 0.57
132 0.66
133 0.76
134 0.81
135 0.85
136 0.88
137 0.88
138 0.9
139 0.87
140 0.81
141 0.8
142 0.79
143 0.75
144 0.7
145 0.64
146 0.55
147 0.5
148 0.45
149 0.38
150 0.32
151 0.27
152 0.24
153 0.26
154 0.28
155 0.28
156 0.31
157 0.32
158 0.35
159 0.35
160 0.34
161 0.32
162 0.38
163 0.38
164 0.37
165 0.33
166 0.29
167 0.26
168 0.24
169 0.2
170 0.11
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.06
190 0.07
191 0.11
192 0.13
193 0.17
194 0.26
195 0.37
196 0.47
197 0.56
198 0.66
199 0.72
200 0.78
201 0.84
202 0.85
203 0.82
204 0.75
205 0.67
206 0.61
207 0.54
208 0.44
209 0.35
210 0.25
211 0.17
212 0.13
213 0.11
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.14
222 0.21
223 0.24
224 0.33
225 0.34
226 0.37
227 0.42
228 0.45
229 0.43
230 0.41
231 0.43
232 0.44
233 0.4
234 0.41
235 0.4
236 0.39
237 0.42
238 0.4
239 0.36
240 0.28
241 0.27
242 0.26
243 0.26
244 0.25
245 0.27
246 0.31
247 0.33
248 0.34
249 0.36
250 0.36
251 0.39
252 0.42
253 0.43
254 0.44
255 0.47
256 0.49
257 0.47
258 0.49
259 0.46
260 0.42
261 0.36
262 0.27
263 0.21
264 0.17
265 0.15
266 0.1
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.11
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.14
297 0.13
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.15
303 0.14
304 0.18
305 0.19
306 0.19
307 0.23
308 0.31
309 0.36
310 0.39
311 0.41
312 0.44
313 0.45
314 0.45
315 0.44
316 0.38
317 0.34
318 0.32
319 0.28
320 0.2
321 0.22
322 0.24
323 0.21
324 0.2
325 0.2
326 0.18
327 0.2
328 0.2
329 0.16
330 0.14
331 0.16
332 0.16
333 0.19
334 0.19
335 0.18
336 0.2
337 0.23
338 0.23
339 0.22
340 0.22
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.18
345 0.14
346 0.13
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.12
351 0.1
352 0.11
353 0.15
354 0.16
355 0.17
356 0.18
357 0.2
358 0.21
359 0.21
360 0.24
361 0.29
362 0.37
363 0.45
364 0.5
365 0.56
366 0.6
367 0.7
368 0.76
369 0.77
370 0.77
371 0.78
372 0.83
373 0.83
374 0.88
375 0.89
376 0.89
377 0.87
378 0.84
379 0.83
380 0.79
381 0.75
382 0.68
383 0.66
384 0.62
385 0.63
386 0.66
387 0.65
388 0.65
389 0.65
390 0.61
391 0.54
392 0.49
393 0.41
394 0.37
395 0.36
396 0.33
397 0.35
398 0.42
399 0.41
400 0.45
401 0.5
402 0.46
403 0.43
404 0.5
405 0.55
406 0.56
407 0.59
408 0.6
409 0.64
410 0.65
411 0.68
412 0.68
413 0.67
414 0.66
415 0.66
416 0.63
417 0.55
418 0.55
419 0.47
420 0.42
421 0.35
422 0.31
423 0.28
424 0.27
425 0.26
426 0.24
427 0.25
428 0.21
429 0.19
430 0.16
431 0.15
432 0.17
433 0.17
434 0.19
435 0.25
436 0.25
437 0.25
438 0.27
439 0.27
440 0.24
441 0.24
442 0.23
443 0.15
444 0.17
445 0.21
446 0.19
447 0.23
448 0.28
449 0.31
450 0.31
451 0.33
452 0.31
453 0.26
454 0.27
455 0.24
456 0.19
457 0.18
458 0.17
459 0.18
460 0.21
461 0.21
462 0.2
463 0.2
464 0.18
465 0.15
466 0.16
467 0.13
468 0.1
469 0.1
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.16
479 0.2
480 0.23
481 0.27
482 0.29
483 0.34
484 0.43
485 0.5
486 0.5