FuNGI

P40960

Protein Details

Accession

P40960

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-27	LKQLEEKRRQLKELRERRKQASLF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, mito 6, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005868 C:cytoplasmic dynein complex GO:0005881 C:cytoplasmic microtubule GO:0045504 F:dynein heavy chain binding GO:0045503 F:dynein light chain binding GO:0040001 P:establishment of mitotic spindle localization GO:0000132 P:establishment of mitotic spindle orientation GO:0030473 P:nuclear migration along microtubule GO:0010970 P:transport along microtubule
KEGG	sce:YDR488C -
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MERLKQLEEKRRQLKELRERRKQASLFPGSETMGHHPTEVHAKATMVSVSVQTDMEEGSKIQEPQSAYLRRKEVITYDKGIQTDQIEEEQLQENENHTTTDAVAIETTAADENNKDKAENDQPRLELAKPFLVEEAAATLSNASFARLETEVSASGQQAPSNMQQDKDNLMQWNMVSENLQSETDCDCIAQEYDPGKGVLVVVYLRLPPADLQYASSEAAWSVVNVVKCDNASGRNGLLIDMVEFRGTRIMTATILRRYHPESNVISILLATLTGKIILYELRLKQKKPETPVVYVVQRNMVARHYFQHPVVAVIETSSVQDQERVLVAADNGNIMELSCLDLTVLRKPQQLRPVPLSQLLSLENDTCTYTERLQRLAKFDEVGIACMAYTSEDPQYVWIGGEDGGIYKVFWDQPGPLYLSLDNNGFQPAENHSTRVTGLEFHWDDARRLMLLLSCSTDWTVRLWDARAGKAIIGAPLLLGGPVLRARWLEKNNGGENSRTLRCQVWCADGRLVVVNWAFDAKTSLYTATVIS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.79
3	0.8
4	0.8
5	0.81
6	0.83
7	0.83
8	0.85
9	0.76
10	0.73
11	0.73
12	0.71
13	0.62
14	0.57
15	0.54
16	0.44
17	0.43
18	0.37
19	0.32
20	0.27
21	0.26
22	0.22
23	0.2
24	0.22
25	0.29
26	0.27
27	0.23
28	0.21
29	0.21
30	0.22
31	0.23
32	0.21
33	0.13
34	0.13
35	0.12
36	0.12
37	0.13
38	0.12
39	0.11
40	0.11
41	0.1
42	0.1
43	0.1
44	0.09
45	0.11
46	0.15
47	0.15
48	0.16
49	0.19
50	0.2
51	0.23
52	0.32
53	0.37
54	0.37
55	0.43
56	0.46
57	0.43
58	0.43
59	0.42
60	0.4
61	0.4
62	0.41
63	0.39
64	0.4
65	0.42
66	0.41
67	0.39
68	0.34
69	0.27
70	0.25
71	0.22
72	0.18
73	0.16
74	0.16
75	0.18
76	0.2
77	0.19
78	0.17
79	0.17
80	0.17
81	0.18
82	0.18
83	0.16
84	0.12
85	0.12
86	0.11
87	0.13
88	0.12
89	0.1
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.08
94	0.08
95	0.06
96	0.06
97	0.06
98	0.08
99	0.1
100	0.14
101	0.15
102	0.14
103	0.14
104	0.21
105	0.31
106	0.38
107	0.42
108	0.41
109	0.41
110	0.43
111	0.45
112	0.4
113	0.33
114	0.27
115	0.26
116	0.22
117	0.22
118	0.2
119	0.17
120	0.15
121	0.12
122	0.11
123	0.08
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.06
128	0.08
129	0.08
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.1
134	0.1
135	0.11
136	0.09
137	0.11
138	0.11
139	0.11
140	0.12
141	0.1
142	0.12
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.13
147	0.16
148	0.21
149	0.22
150	0.2
151	0.22
152	0.24
153	0.27
154	0.26
155	0.26
156	0.21
157	0.21
158	0.21
159	0.19
160	0.19
161	0.15
162	0.13
163	0.1
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.08
169	0.1
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.09
174	0.07
175	0.08
176	0.09
177	0.07
178	0.1
179	0.1
180	0.11
181	0.12
182	0.12
183	0.11
184	0.1
185	0.1
186	0.06
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.08
197	0.1
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.1
205	0.08
206	0.09
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.1
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.11
221	0.11
222	0.11
223	0.11
224	0.11
225	0.09
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.1
240	0.14
241	0.17
242	0.18
243	0.18
244	0.2
245	0.24
246	0.27
247	0.26
248	0.28
249	0.24
250	0.25
251	0.25
252	0.23
253	0.18
254	0.13
255	0.12
256	0.07
257	0.06
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.1
268	0.13
269	0.22
270	0.25
271	0.26
272	0.33
273	0.4
274	0.43
275	0.45
276	0.51
277	0.46
278	0.46
279	0.51
280	0.47
281	0.43
282	0.4
283	0.34
284	0.27
285	0.24
286	0.21
287	0.18
288	0.17
289	0.14
290	0.14
291	0.16
292	0.18
293	0.19
294	0.18
295	0.2
296	0.17
297	0.17
298	0.17
299	0.15
300	0.11
301	0.09
302	0.09
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.03
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.07
330	0.08
331	0.13
332	0.18
333	0.19
334	0.24
335	0.27
336	0.32
337	0.4
338	0.45
339	0.46
340	0.47
341	0.49
342	0.47
343	0.48
344	0.44
345	0.34
346	0.29
347	0.25
348	0.2
349	0.17
350	0.15
351	0.12
352	0.11
353	0.11
354	0.1
355	0.12
356	0.12
357	0.15
358	0.2
359	0.22
360	0.26
361	0.31
362	0.33
363	0.36
364	0.37
365	0.35
366	0.3
367	0.28
368	0.29
369	0.24
370	0.22
371	0.17
372	0.14
373	0.12
374	0.11
375	0.11
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.12
384	0.11
385	0.11
386	0.09
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.07
391	0.06
392	0.07
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.1
400	0.1
401	0.13
402	0.16
403	0.18
404	0.16
405	0.17
406	0.18
407	0.18
408	0.19
409	0.18
410	0.15
411	0.13
412	0.14
413	0.13
414	0.12
415	0.11
416	0.15
417	0.2
418	0.21
419	0.22
420	0.21
421	0.22
422	0.22
423	0.23
424	0.18
425	0.14
426	0.14
427	0.21
428	0.22
429	0.22
430	0.27
431	0.27
432	0.27
433	0.26
434	0.27
435	0.18
436	0.17
437	0.17
438	0.14
439	0.14
440	0.15
441	0.16
442	0.15
443	0.16
444	0.17
445	0.17
446	0.15
447	0.14
448	0.16
449	0.16
450	0.18
451	0.19
452	0.24
453	0.26
454	0.28
455	0.3
456	0.27
457	0.25
458	0.25
459	0.24
460	0.2
461	0.16
462	0.14
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.07
467	0.05
468	0.04
469	0.06
470	0.08
471	0.08
472	0.09
473	0.11
474	0.15
475	0.24
476	0.28
477	0.34
478	0.39
479	0.46
480	0.51
481	0.55
482	0.53
483	0.47
484	0.48
485	0.47
486	0.43
487	0.37
488	0.34
489	0.33
490	0.33
491	0.37
492	0.35
493	0.37
494	0.39
495	0.42
496	0.43
497	0.39
498	0.38
499	0.36
500	0.33
501	0.28
502	0.24
503	0.2
504	0.17
505	0.17
506	0.15
507	0.12
508	0.15
509	0.13
510	0.14
511	0.16
512	0.16
513	0.15

P40960

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer