Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25627

Protein Details
Accession P25627    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-275AKSFILRKKELMKRRGRKVAKDSKFTGRKRRHRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-275KQLRQRLKGGKDKESAKSFILRKKELMKRRGRKVAKDSKFTGRKRRHRF
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039769  Bud23-like  
IPR022238  Bud23_C  
IPR013216  Methyltransf_11  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043527  C:tRNA methyltransferase complex  
GO:0016435  F:rRNA (guanine) methyltransferase activity  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
GO:0070476  P:rRNA (guanine-N7)-methylation  
KEGG sce:YCR047C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08241  Methyltransf_11  
PF12589  WBS_methylT  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MSRPEELAPPEIFYNDSEAHKYTGSTRVQHIQAKMTLRALELLNLQPCSFILDIGCGSGLSGEILTQEGDHVWCGLDISPSMLATGLSRELEGDLMLQDMGTGIPFRAGSFDAAISISAIQWLCNADTSYNDPKQRLMRFFNTLYAALKKGGKFVAQFYPKNDDQVDDILQSAKVAGFSGGLVVDDPESKKNKKYYLVLSSGAPPQGEEQVNLDGVTMDEENVNLKKQLRQRLKGGKDKESAKSFILRKKELMKRRGRKVAKDSKFTGRKRRHRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.21
4 0.22
5 0.23
6 0.24
7 0.23
8 0.23
9 0.22
10 0.27
11 0.29
12 0.29
13 0.32
14 0.38
15 0.43
16 0.48
17 0.47
18 0.44
19 0.44
20 0.45
21 0.43
22 0.38
23 0.34
24 0.29
25 0.29
26 0.24
27 0.21
28 0.2
29 0.21
30 0.22
31 0.22
32 0.21
33 0.18
34 0.18
35 0.2
36 0.17
37 0.13
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.05
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.03
89 0.04
90 0.03
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.06
114 0.08
115 0.13
116 0.18
117 0.22
118 0.24
119 0.23
120 0.26
121 0.32
122 0.35
123 0.34
124 0.33
125 0.32
126 0.35
127 0.35
128 0.35
129 0.3
130 0.27
131 0.24
132 0.2
133 0.17
134 0.15
135 0.17
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.16
142 0.23
143 0.27
144 0.28
145 0.28
146 0.34
147 0.33
148 0.34
149 0.31
150 0.24
151 0.19
152 0.2
153 0.19
154 0.12
155 0.13
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.12
175 0.17
176 0.19
177 0.25
178 0.3
179 0.35
180 0.39
181 0.44
182 0.47
183 0.49
184 0.51
185 0.47
186 0.43
187 0.41
188 0.38
189 0.33
190 0.25
191 0.18
192 0.15
193 0.19
194 0.19
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.21
214 0.28
215 0.39
216 0.46
217 0.51
218 0.59
219 0.67
220 0.74
221 0.78
222 0.77
223 0.75
224 0.72
225 0.72
226 0.7
227 0.65
228 0.59
229 0.52
230 0.53
231 0.51
232 0.51
233 0.54
234 0.49
235 0.49
236 0.56
237 0.63
238 0.65
239 0.69
240 0.73
241 0.75
242 0.82
243 0.87
244 0.85
245 0.85
246 0.87
247 0.88
248 0.85
249 0.84
250 0.79
251 0.79
252 0.81
253 0.79
254 0.79
255 0.79