Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12220

Protein Details
Accession Q12220    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-311EEIARGLKKREKRLKEKGLTEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-306IARGLKKREKRLKEK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 9, cyto_mito 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG sce:YLR129W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVKSYQRFEQAAAFGVIASNANCVWIPASSGNSNGSGPGQLITSALEDVNIWDIKTGDLVSKLSDGLPPGASDARGAKPAECTYLEAHKDTDLLAVGYADGVIKVWDLMSKTVLLNFNGHKAAITLLQFDGTGTRLISGSKDSNIIVWDLVGEVGLYKLRSHKDSITGFWCQGEDWLISTSKDGMIKLWDLKTHQCIETHIAHTGECWGLAVKDDLLITTGTDSQVKIWKLDIENDKMGGKLTEMGIFEKQSKQRGLKIEFITNSSDKTSFFYIQNADKTIETFRIRKEEEIARGLKKREKRLKEKGLTEEEIAKSIKESYSSFILHPFQTIRSLYKIKSASWTTVSSSKLELVLTTSSNTIEYYSIPYEKRDPTSPAPLKTHTIELQGQRTDVRSIDISDDNKLLATASNGSLKIWNIKTHKCIRTFECGYALTCKFLPGGLLVILGTRNGELQLFDLASSSLLDTIEDAHDAAIWSLDLTSDGKRLVTGSADKTVKFWDFKVENSLVPGTKNKFLPVLKLHHDTTLELTDDILCVRVSPDDRYLAISLLDNTVKVFFLDSMKFYLSLYGHKLPVLSIDISFDSKMIITSSADKNIKIWGLDFGDCHKSLFAHQDSIMNVKFLPQSHNFFSCSKDAVVKYWDGEKFECIQKLYAHQSEVWALAVATDGGFVVSSSHDHSIRIWEETEDQVFLEEEKEKELEEQYEDTLLTSLEEGNGDDAFKADASGEGVEDEASGVHKQTLESLKAGERLMEALDLGIAEIEGLEAYNRDMKLWQRKKLGEAPIKPQGNAVLIAVNKTPEQYIMDTLLRIRMSQLEDALMVMPFSYVLKFLKFIDTVMQNKTLLHSHLPLICKNLFFIIKFNHKELVSQKNEELKLQINRVKTELRSALKSTEDDLGFNVQGLKFVKQQWNLRHNYEFVDEYDQQEKESNSARKRVFGTVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.17
4 0.12
5 0.11
6 0.09
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.09
13 0.12
14 0.13
15 0.18
16 0.18
17 0.21
18 0.22
19 0.23
20 0.22
21 0.2
22 0.19
23 0.15
24 0.14
25 0.13
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.11
45 0.13
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.15
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.14
56 0.16
57 0.17
58 0.16
59 0.17
60 0.19
61 0.19
62 0.23
63 0.24
64 0.22
65 0.26
66 0.28
67 0.3
68 0.27
69 0.27
70 0.26
71 0.34
72 0.35
73 0.31
74 0.3
75 0.27
76 0.26
77 0.23
78 0.21
79 0.14
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.09
95 0.1
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.19
100 0.22
101 0.2
102 0.24
103 0.24
104 0.28
105 0.27
106 0.26
107 0.21
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.17
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.1
119 0.1
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.11
125 0.14
126 0.16
127 0.16
128 0.18
129 0.17
130 0.18
131 0.19
132 0.18
133 0.13
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.14
146 0.17
147 0.2
148 0.24
149 0.27
150 0.33
151 0.36
152 0.39
153 0.38
154 0.37
155 0.35
156 0.32
157 0.29
158 0.21
159 0.19
160 0.17
161 0.13
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.14
171 0.13
172 0.15
173 0.18
174 0.22
175 0.23
176 0.23
177 0.24
178 0.28
179 0.33
180 0.34
181 0.33
182 0.29
183 0.3
184 0.32
185 0.35
186 0.32
187 0.29
188 0.26
189 0.24
190 0.23
191 0.23
192 0.18
193 0.12
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.17
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.22
217 0.22
218 0.3
219 0.33
220 0.33
221 0.33
222 0.34
223 0.33
224 0.28
225 0.27
226 0.2
227 0.14
228 0.11
229 0.1
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.18
236 0.23
237 0.25
238 0.28
239 0.33
240 0.34
241 0.39
242 0.46
243 0.48
244 0.5
245 0.5
246 0.5
247 0.45
248 0.44
249 0.43
250 0.35
251 0.32
252 0.26
253 0.23
254 0.17
255 0.19
256 0.21
257 0.19
258 0.19
259 0.21
260 0.22
261 0.26
262 0.28
263 0.27
264 0.25
265 0.22
266 0.22
267 0.21
268 0.23
269 0.22
270 0.23
271 0.24
272 0.3
273 0.31
274 0.31
275 0.35
276 0.35
277 0.36
278 0.39
279 0.4
280 0.37
281 0.41
282 0.44
283 0.45
284 0.46
285 0.52
286 0.56
287 0.63
288 0.68
289 0.74
290 0.81
291 0.82
292 0.82
293 0.78
294 0.75
295 0.67
296 0.58
297 0.53
298 0.42
299 0.37
300 0.31
301 0.23
302 0.17
303 0.16
304 0.15
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.15
309 0.17
310 0.17
311 0.19
312 0.21
313 0.19
314 0.19
315 0.18
316 0.15
317 0.17
318 0.18
319 0.17
320 0.19
321 0.23
322 0.21
323 0.27
324 0.28
325 0.25
326 0.31
327 0.31
328 0.28
329 0.28
330 0.29
331 0.24
332 0.27
333 0.28
334 0.22
335 0.21
336 0.19
337 0.17
338 0.15
339 0.13
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.1
352 0.11
353 0.14
354 0.14
355 0.16
356 0.2
357 0.23
358 0.25
359 0.25
360 0.28
361 0.29
362 0.4
363 0.42
364 0.42
365 0.42
366 0.41
367 0.41
368 0.37
369 0.37
370 0.27
371 0.27
372 0.27
373 0.27
374 0.29
375 0.26
376 0.25
377 0.23
378 0.23
379 0.2
380 0.16
381 0.14
382 0.1
383 0.11
384 0.13
385 0.16
386 0.15
387 0.16
388 0.16
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.09
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.16
403 0.16
404 0.21
405 0.23
406 0.26
407 0.33
408 0.41
409 0.46
410 0.45
411 0.47
412 0.45
413 0.5
414 0.49
415 0.43
416 0.37
417 0.32
418 0.29
419 0.3
420 0.26
421 0.18
422 0.16
423 0.15
424 0.12
425 0.11
426 0.11
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.04
459 0.04
460 0.05
461 0.04
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.07
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.1
478 0.1
479 0.16
480 0.17
481 0.17
482 0.18
483 0.19
484 0.2
485 0.18
486 0.17
487 0.19
488 0.19
489 0.19
490 0.24
491 0.23
492 0.21
493 0.22
494 0.23
495 0.15
496 0.16
497 0.19
498 0.16
499 0.18
500 0.19
501 0.18
502 0.21
503 0.21
504 0.25
505 0.26
506 0.28
507 0.29
508 0.33
509 0.33
510 0.3
511 0.3
512 0.25
513 0.23
514 0.19
515 0.16
516 0.11
517 0.11
518 0.09
519 0.09
520 0.08
521 0.07
522 0.05
523 0.04
524 0.05
525 0.07
526 0.08
527 0.1
528 0.12
529 0.13
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.14
534 0.13
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.06
545 0.06
546 0.08
547 0.09
548 0.1
549 0.11
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.13
554 0.11
555 0.13
556 0.17
557 0.18
558 0.18
559 0.18
560 0.18
561 0.15
562 0.16
563 0.16
564 0.11
565 0.09
566 0.1
567 0.1
568 0.11
569 0.11
570 0.09
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.11
578 0.13
579 0.19
580 0.2
581 0.2
582 0.2
583 0.22
584 0.22
585 0.17
586 0.16
587 0.13
588 0.14
589 0.15
590 0.15
591 0.16
592 0.19
593 0.19
594 0.19
595 0.15
596 0.13
597 0.14
598 0.21
599 0.19
600 0.18
601 0.18
602 0.2
603 0.21
604 0.24
605 0.23
606 0.16
607 0.14
608 0.14
609 0.16
610 0.14
611 0.19
612 0.19
613 0.24
614 0.27
615 0.29
616 0.3
617 0.28
618 0.3
619 0.27
620 0.25
621 0.21
622 0.22
623 0.21
624 0.2
625 0.22
626 0.2
627 0.19
628 0.23
629 0.24
630 0.22
631 0.22
632 0.22
633 0.23
634 0.26
635 0.27
636 0.22
637 0.23
638 0.21
639 0.26
640 0.3
641 0.28
642 0.26
643 0.24
644 0.24
645 0.23
646 0.22
647 0.18
648 0.11
649 0.09
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.04
654 0.04
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.03
659 0.04
660 0.04
661 0.05
662 0.08
663 0.1
664 0.11
665 0.12
666 0.12
667 0.18
668 0.19
669 0.2
670 0.18
671 0.17
672 0.18
673 0.2
674 0.2
675 0.14
676 0.13
677 0.12
678 0.11
679 0.1
680 0.1
681 0.1
682 0.1
683 0.11
684 0.12
685 0.11
686 0.13
687 0.15
688 0.14
689 0.14
690 0.15
691 0.14
692 0.15
693 0.14
694 0.13
695 0.11
696 0.1
697 0.07
698 0.07
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.05
712 0.05
713 0.06
714 0.07
715 0.06
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.05
721 0.04
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.07
726 0.08
727 0.08
728 0.14
729 0.19
730 0.2
731 0.2
732 0.22
733 0.24
734 0.26
735 0.26
736 0.21
737 0.16
738 0.15
739 0.14
740 0.12
741 0.1
742 0.06
743 0.06
744 0.05
745 0.05
746 0.04
747 0.03
748 0.03
749 0.03
750 0.03
751 0.02
752 0.03
753 0.03
754 0.03
755 0.05
756 0.1
757 0.1
758 0.11
759 0.14
760 0.22
761 0.33
762 0.41
763 0.48
764 0.52
765 0.54
766 0.61
767 0.66
768 0.68
769 0.67
770 0.64
771 0.64
772 0.64
773 0.64
774 0.57
775 0.5
776 0.42
777 0.34
778 0.29
779 0.22
780 0.17
781 0.15
782 0.17
783 0.16
784 0.15
785 0.14
786 0.14
787 0.14
788 0.11
789 0.14
790 0.14
791 0.16
792 0.19
793 0.19
794 0.19
795 0.2
796 0.23
797 0.2
798 0.18
799 0.17
800 0.18
801 0.2
802 0.21
803 0.21
804 0.17
805 0.17
806 0.18
807 0.17
808 0.12
809 0.09
810 0.07
811 0.06
812 0.06
813 0.06
814 0.06
815 0.07
816 0.09
817 0.1
818 0.12
819 0.13
820 0.18
821 0.18
822 0.18
823 0.23
824 0.28
825 0.3
826 0.32
827 0.34
828 0.29
829 0.29
830 0.31
831 0.28
832 0.24
833 0.24
834 0.23
835 0.24
836 0.28
837 0.31
838 0.3
839 0.32
840 0.32
841 0.29
842 0.27
843 0.28
844 0.26
845 0.24
846 0.28
847 0.3
848 0.38
849 0.41
850 0.42
851 0.43
852 0.4
853 0.45
854 0.46
855 0.48
856 0.45
857 0.45
858 0.47
859 0.5
860 0.51
861 0.48
862 0.45
863 0.42
864 0.42
865 0.47
866 0.46
867 0.42
868 0.44
869 0.46
870 0.48
871 0.42
872 0.44
873 0.44
874 0.45
875 0.45
876 0.45
877 0.45
878 0.43
879 0.43
880 0.37
881 0.36
882 0.31
883 0.27
884 0.26
885 0.26
886 0.23
887 0.22
888 0.23
889 0.16
890 0.2
891 0.22
892 0.23
893 0.24
894 0.31
895 0.39
896 0.44
897 0.52
898 0.58
899 0.66
900 0.68
901 0.7
902 0.67
903 0.6
904 0.56
905 0.51
906 0.42
907 0.35
908 0.37
909 0.33
910 0.32
911 0.36
912 0.33
913 0.3
914 0.32
915 0.31
916 0.27
917 0.35
918 0.4
919 0.4
920 0.49
921 0.5
922 0.52
923 0.55