FuNGI

Q08647

Protein Details

Accession

Q08647

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-104	LTDKGFKMPKKPQRSKEEVNAEKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001656 PsdUridine_synth_TruD IPR020119 PsdUridine_synth_TruD_CS IPR011760 PsdUridine_synth_TruD_insert IPR042214 TruD_catalytic
Gene Ontology	GO:0031429 C:box H/ACA snoRNP complex GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0106029 F:tRNA pseudouridine synthase activity GO:0000455 P:enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis GO:0006397 P:mRNA processing GO:1990481 P:mRNA pseudouridine synthesis GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008380 P:RNA splicing GO:0031120 P:snRNA pseudouridine synthesis GO:0006400 P:tRNA modification GO:0031119 P:tRNA pseudouridine synthesis
KEGG	sce:YOR243C -
Pfam	View protein in Pfam PF01142 TruD
PROSITE	View protein in PROSITE PS50984 TRUD PS01268 UPF0024
CDD	cd02576 PseudoU_synth_ScPUS7

Amino Acid Sequences

MSDSSEATVKRPLDAHVGPSENAAKKLKIEQRTQADGIHEADVGITLFLSPELPGFRGQIKQRYTDFLVNEIDQEGKVIHLTDKGFKMPKKPQRSKEEVNAEKESEAARRQEFNVDPELRNQLVEIFGEEDVLKIESVYRTANKMETAKNFEDKSVRTKIHQLLREAFKNELESVTTDTNTFKIARSNRNSRTNKQEKINQTRDANGVENWGYGPSKDFIHFTLHKENKDTMEAVNVITKLLRVPSRVIRYAGTKDRRAVTCQRVSISKIGLDRLNALNRTLKGMIIGNYNFSDASLNLGDLKGNEFVVVIRDVTTGNSEVSLEEIVSNGCKSLSENGFINYFGMQRFGTFSISTHTIGRELLLSNWKKAAELILSDQDNVLPKSKEARKIWAETKDAALALKQMPRQCLAENALLYSLSNQRKEEDGTYSENAYYTAIMKIPRNLRTMYVHAYQSYVWNSIASKRIELHGLKLVVGDLVIDTSEKSPLISGIDDEDFDEDVREAQFIRAKAVTQEDIDSVKYTMEDVVLPSPGFDVLYPSNEELKQLYVDILKADNMDPFNMRRKVRDFSLAGSYRTVIQKPKSLEYRIIHYDDPSQQLVNTDLDILNNTRAKESGQKYMKAKLDRYMPDKGGEKTAVVLKFQLGTSAYATMALRELMKLETSRRGDMCDVKENI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.34
3	0.34
4	0.36
5	0.34
6	0.36
7	0.41
8	0.36
9	0.39
10	0.38
11	0.32
12	0.32
13	0.42
14	0.46
15	0.47
16	0.51
17	0.55
18	0.6
19	0.66
20	0.64
21	0.57
22	0.52
23	0.47
24	0.42
25	0.34
26	0.25
27	0.18
28	0.16
29	0.14
30	0.11
31	0.08
32	0.06
33	0.05
34	0.05
35	0.05
36	0.06
37	0.05
38	0.07
39	0.09
40	0.1
41	0.12
42	0.14
43	0.18
44	0.24
45	0.3
46	0.37
47	0.38
48	0.44
49	0.45
50	0.49
51	0.51
52	0.5
53	0.45
54	0.4
55	0.41
56	0.34
57	0.33
58	0.27
59	0.23
60	0.17
61	0.16
62	0.12
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.13
68	0.15
69	0.21
70	0.23
71	0.29
72	0.35
73	0.37
74	0.45
75	0.51
76	0.59
77	0.64
78	0.72
79	0.76
80	0.79
81	0.86
82	0.84
83	0.84
84	0.85
85	0.81
86	0.77
87	0.71
88	0.62
89	0.53
90	0.46
91	0.38
92	0.31
93	0.28
94	0.26
95	0.25
96	0.27
97	0.28
98	0.34
99	0.35
100	0.34
101	0.39
102	0.38
103	0.36
104	0.37
105	0.41
106	0.33
107	0.31
108	0.28
109	0.2
110	0.17
111	0.16
112	0.14
113	0.1
114	0.1
115	0.11
116	0.1
117	0.09
118	0.09
119	0.1
120	0.08
121	0.06
122	0.09
123	0.08
124	0.1
125	0.13
126	0.14
127	0.16
128	0.18
129	0.2
130	0.22
131	0.26
132	0.3
133	0.32
134	0.38
135	0.39
136	0.43
137	0.42
138	0.4
139	0.41
140	0.37
141	0.38
142	0.38
143	0.37
144	0.33
145	0.41
146	0.46
147	0.49
148	0.52
149	0.5
150	0.51
151	0.56
152	0.58
153	0.52
154	0.46
155	0.39
156	0.36
157	0.32
158	0.25
159	0.19
160	0.15
161	0.17
162	0.17
163	0.16
164	0.14
165	0.14
166	0.14
167	0.15
168	0.14
169	0.11
170	0.18
171	0.24
172	0.33
173	0.41
174	0.5
175	0.56
176	0.67
177	0.72
178	0.7
179	0.75
180	0.74
181	0.73
182	0.7
183	0.7
184	0.7
185	0.74
186	0.75
187	0.7
188	0.63
189	0.59
190	0.55
191	0.49
192	0.4
193	0.3
194	0.26
195	0.19
196	0.17
197	0.14
198	0.13
199	0.11
200	0.09
201	0.11
202	0.1
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.2
208	0.22
209	0.25
210	0.34
211	0.37
212	0.38
213	0.4
214	0.41
215	0.35
216	0.35
217	0.31
218	0.21
219	0.2
220	0.19
221	0.16
222	0.16
223	0.14
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.08
228	0.11
229	0.12
230	0.11
231	0.15
232	0.22
233	0.28
234	0.3
235	0.31
236	0.29
237	0.32
238	0.36
239	0.42
240	0.41
241	0.38
242	0.39
243	0.43
244	0.44
245	0.44
246	0.46
247	0.45
248	0.45
249	0.44
250	0.42
251	0.38
252	0.39
253	0.36
254	0.3
255	0.24
256	0.2
257	0.2
258	0.19
259	0.17
260	0.18
261	0.19
262	0.21
263	0.19
264	0.19
265	0.21
266	0.2
267	0.23
268	0.21
269	0.17
270	0.15
271	0.16
272	0.16
273	0.16
274	0.16
275	0.14
276	0.14
277	0.14
278	0.13
279	0.11
280	0.11
281	0.07
282	0.09
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.09
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.1
321	0.11
322	0.12
323	0.13
324	0.14
325	0.14
326	0.14
327	0.14
328	0.09
329	0.09
330	0.07
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.1
337	0.09
338	0.09
339	0.1
340	0.12
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.16
351	0.16
352	0.17
353	0.18
354	0.18
355	0.17
356	0.17
357	0.17
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.13
362	0.13
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.14
367	0.13
368	0.14
369	0.11
370	0.11
371	0.19
372	0.24
373	0.32
374	0.32
375	0.39
376	0.4
377	0.45
378	0.51
379	0.49
380	0.47
381	0.39
382	0.38
383	0.31
384	0.27
385	0.22
386	0.16
387	0.12
388	0.12
389	0.14
390	0.16
391	0.18
392	0.19
393	0.21
394	0.22
395	0.2
396	0.22
397	0.21
398	0.22
399	0.19
400	0.18
401	0.17
402	0.15
403	0.15
404	0.13
405	0.17
406	0.18
407	0.2
408	0.2
409	0.21
410	0.23
411	0.25
412	0.24
413	0.21
414	0.2
415	0.22
416	0.23
417	0.22
418	0.21
419	0.19
420	0.17
421	0.14
422	0.11
423	0.08
424	0.08
425	0.09
426	0.11
427	0.12
428	0.18
429	0.24
430	0.28
431	0.29
432	0.29
433	0.31
434	0.33
435	0.35
436	0.34
437	0.32
438	0.28
439	0.26
440	0.26
441	0.23
442	0.23
443	0.21
444	0.18
445	0.14
446	0.14
447	0.14
448	0.17
449	0.22
450	0.2
451	0.19
452	0.19
453	0.2
454	0.25
455	0.25
456	0.24
457	0.24
458	0.23
459	0.22
460	0.21
461	0.2
462	0.14
463	0.13
464	0.1
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.07
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.1
480	0.11
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.07
492	0.09
493	0.14
494	0.13
495	0.16
496	0.16
497	0.16
498	0.18
499	0.22
500	0.21
501	0.18
502	0.19
503	0.17
504	0.18
505	0.18
506	0.17
507	0.13
508	0.12
509	0.11
510	0.1
511	0.09
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.1
516	0.11
517	0.1
518	0.1
519	0.1
520	0.09
521	0.09
522	0.07
523	0.1
524	0.1
525	0.13
526	0.15
527	0.16
528	0.2
529	0.2
530	0.21
531	0.18
532	0.18
533	0.16
534	0.15
535	0.15
536	0.12
537	0.12
538	0.13
539	0.12
540	0.12
541	0.12
542	0.12
543	0.14
544	0.14
545	0.15
546	0.16
547	0.19
548	0.28
549	0.33
550	0.34
551	0.37
552	0.41
553	0.45
554	0.46
555	0.51
556	0.43
557	0.4
558	0.49
559	0.46
560	0.42
561	0.38
562	0.35
563	0.31
564	0.33
565	0.33
566	0.29
567	0.3
568	0.36
569	0.39
570	0.47
571	0.49
572	0.49
573	0.54
574	0.51
575	0.54
576	0.53
577	0.52
578	0.45
579	0.4
580	0.42
581	0.38
582	0.39
583	0.33
584	0.28
585	0.25
586	0.26
587	0.26
588	0.21
589	0.17
590	0.15
591	0.13
592	0.13
593	0.15
594	0.15
595	0.19
596	0.21
597	0.22
598	0.21
599	0.21
600	0.23
601	0.3
602	0.33
603	0.37
604	0.4
605	0.47
606	0.49
607	0.57
608	0.62
609	0.6
610	0.59
611	0.55
612	0.57
613	0.58
614	0.59
615	0.59
616	0.54
617	0.52
618	0.54
619	0.5
620	0.47
621	0.4
622	0.36
623	0.31
624	0.36
625	0.32
626	0.27
627	0.26
628	0.22
629	0.23
630	0.22
631	0.22
632	0.17
633	0.17
634	0.18
635	0.18
636	0.16
637	0.17
638	0.17
639	0.14
640	0.14
641	0.13
642	0.12
643	0.11
644	0.13
645	0.12
646	0.15
647	0.17
648	0.2
649	0.28
650	0.31
651	0.37
652	0.36
653	0.39
654	0.42
655	0.47
656	0.49

Q08647

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer