FuNGI

P41895

Protein Details

Accession

P41895

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-38	TNASPFIKRDRMRRNFLRMRMGQ	Hydrophilic
578-606	DSDTLSKSKRSSPKKQQKKATNAHVHKEP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
319-330	RAKRGNLRRKTR
586-596	KRSSPKKQQKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0072542 F:protein phosphatase activator activity GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription GO:0051123 P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter GO:0001174 P:transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter
KEGG	sce:YGR186W -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSRRNPPGSRNGGGPTNASPFIKRDRMRRNFLRMRMGQNGSNSSSPGVPNGDNSRGSLVKKDDPEYAEEREKMLLQIGVEADAGRSNVKVKDEDPNEYNEFPLRAIPKEDLENMRTHLLKFQSKKKINPVTDFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEISEYKKKAEQERSTPNSGGMNKSGTVSLNNTVKDGSQTPTVDSVTKDNTANGVNSSIPTVTGSSVPPASPTTVSAVESNGLSNGSTSAANGLDGNASTANLANGRPLVTKLEDAGPAEDPTKVGMVKYDGKEVTNEPEFEEGTMDPLADVAPDGGGRAKRGNLRRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDFDGYNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIDEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTRRKLKAVADQQAMDEDDRDDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDEEAPSENEEDELFGEKKIDEDGERIKKALQKTELAALYSSDENEINPYLSESDIENKENESPVKKEEDSDTLSKSKRSSPKKQQKKATNAHVHKEPTLRVKSIKNCVIILKGDKKILKSFPEGEWNPQTTKAVDSSNNASNTVPSPIKQEEGLNSTVAEREETPAPTITEKDIIEAIGDGKVNIKEFGKFIRRKYPGAENKKLMFAIVKKLCRKVGNDHMELKKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.38
3	0.35
4	0.35
5	0.32
6	0.3
7	0.29
8	0.36
9	0.43
10	0.44
11	0.49
12	0.58
13	0.66
14	0.74
15	0.79
16	0.81
17	0.81
18	0.83
19	0.83
20	0.78
21	0.76
22	0.75
23	0.7
24	0.63
25	0.59
26	0.57
27	0.5
28	0.45
29	0.38
30	0.31
31	0.29
32	0.26
33	0.23
34	0.22
35	0.19
36	0.24
37	0.29
38	0.32
39	0.3
40	0.31
41	0.33
42	0.32
43	0.33
44	0.34
45	0.34
46	0.36
47	0.4
48	0.42
49	0.42
50	0.41
51	0.45
52	0.43
53	0.43
54	0.43
55	0.39
56	0.37
57	0.34
58	0.32
59	0.27
60	0.26
61	0.21
62	0.14
63	0.16
64	0.15
65	0.14
66	0.13
67	0.13
68	0.11
69	0.1
70	0.11
71	0.09
72	0.09
73	0.12
74	0.15
75	0.18
76	0.2
77	0.2
78	0.3
79	0.33
80	0.39
81	0.37
82	0.4
83	0.42
84	0.39
85	0.39
86	0.32
87	0.29
88	0.23
89	0.26
90	0.23
91	0.2
92	0.23
93	0.24
94	0.24
95	0.27
96	0.32
97	0.32
98	0.32
99	0.32
100	0.31
101	0.34
102	0.32
103	0.29
104	0.29
105	0.3
106	0.36
107	0.4
108	0.48
109	0.54
110	0.6
111	0.66
112	0.71
113	0.75
114	0.73
115	0.74
116	0.7
117	0.66
118	0.66
119	0.63
120	0.54
121	0.51
122	0.45
123	0.44
124	0.49
125	0.46
126	0.45
127	0.49
128	0.55
129	0.56
130	0.67
131	0.7
132	0.69
133	0.67
134	0.67
135	0.63
136	0.58
137	0.55
138	0.46
139	0.37
140	0.29
141	0.31
142	0.29
143	0.33
144	0.37
145	0.33
146	0.32
147	0.31
148	0.35
149	0.37
150	0.41
151	0.44
152	0.43
153	0.46
154	0.51
155	0.56
156	0.6
157	0.64
158	0.63
159	0.61
160	0.67
161	0.69
162	0.67
163	0.63
164	0.55
165	0.51
166	0.45
167	0.39
168	0.31
169	0.26
170	0.22
171	0.23
172	0.22
173	0.17
174	0.16
175	0.16
176	0.19
177	0.21
178	0.21
179	0.21
180	0.2
181	0.2
182	0.2
183	0.2
184	0.17
185	0.18
186	0.18
187	0.19
188	0.21
189	0.22
190	0.21
191	0.2
192	0.21
193	0.19
194	0.2
195	0.19
196	0.17
197	0.18
198	0.18
199	0.18
200	0.15
201	0.14
202	0.12
203	0.11
204	0.12
205	0.1
206	0.09
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.11
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.13
221	0.14
222	0.15
223	0.14
224	0.13
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.08
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.11
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.14
261	0.14
262	0.14
263	0.15
264	0.13
265	0.13
266	0.13
267	0.12
268	0.1
269	0.09
270	0.1
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.1
275	0.16
276	0.17
277	0.21
278	0.21
279	0.21
280	0.23
281	0.23
282	0.24
283	0.2
284	0.2
285	0.16
286	0.17
287	0.16
288	0.15
289	0.15
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.04
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.06
304	0.06
305	0.07
306	0.09
307	0.12
308	0.18
309	0.27
310	0.37
311	0.44
312	0.53
313	0.62
314	0.71
315	0.77
316	0.76
317	0.76
318	0.72
319	0.69
320	0.66
321	0.65
322	0.63
323	0.57
324	0.56
325	0.52
326	0.48
327	0.41
328	0.36
329	0.3
330	0.23
331	0.23
332	0.24
333	0.23
334	0.23
335	0.24
336	0.23
337	0.2
338	0.19
339	0.17
340	0.11
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.06
376	0.08
377	0.08
378	0.11
379	0.12
380	0.16
381	0.19
382	0.27
383	0.36
384	0.38
385	0.39
386	0.39
387	0.39
388	0.37
389	0.35
390	0.29
391	0.21
392	0.17
393	0.19
394	0.18
395	0.16
396	0.15
397	0.16
398	0.15
399	0.15
400	0.17
401	0.14
402	0.17
403	0.26
404	0.33
405	0.33
406	0.35
407	0.37
408	0.4
409	0.41
410	0.39
411	0.33
412	0.25
413	0.28
414	0.27
415	0.27
416	0.21
417	0.21
418	0.21
419	0.2
420	0.19
421	0.15
422	0.14
423	0.15
424	0.17
425	0.24
426	0.32
427	0.41
428	0.51
429	0.54
430	0.59
431	0.62
432	0.64
433	0.67
434	0.66
435	0.64
436	0.56
437	0.52
438	0.45
439	0.4
440	0.36
441	0.25
442	0.17
443	0.11
444	0.09
445	0.09
446	0.11
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.05
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.06
472	0.11
473	0.11
474	0.12
475	0.13
476	0.15
477	0.17
478	0.19
479	0.25
480	0.29
481	0.32
482	0.35
483	0.37
484	0.38
485	0.45
486	0.47
487	0.43
488	0.37
489	0.35
490	0.33
491	0.32
492	0.29
493	0.19
494	0.15
495	0.13
496	0.11
497	0.11
498	0.1
499	0.09
500	0.1
501	0.12
502	0.13
503	0.12
504	0.11
505	0.11
506	0.11
507	0.1
508	0.13
509	0.11
510	0.1
511	0.11
512	0.1
513	0.11
514	0.11
515	0.12
516	0.09
517	0.12
518	0.21
519	0.27
520	0.28
521	0.28
522	0.3
523	0.33
524	0.36
525	0.4
526	0.35
527	0.31
528	0.32
529	0.38
530	0.37
531	0.33
532	0.29
533	0.22
534	0.21
535	0.18
536	0.16
537	0.11
538	0.1
539	0.09
540	0.11
541	0.12
542	0.1
543	0.09
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.1
548	0.09
549	0.15
550	0.17
551	0.18
552	0.18
553	0.18
554	0.2
555	0.22
556	0.24
557	0.22
558	0.21
559	0.23
560	0.29
561	0.28
562	0.28
563	0.29
564	0.31
565	0.32
566	0.33
567	0.34
568	0.34
569	0.35
570	0.36
571	0.35
572	0.38
573	0.42
574	0.49
575	0.56
576	0.62
577	0.72
578	0.8
579	0.87
580	0.89
581	0.9
582	0.91
583	0.89
584	0.89
585	0.89
586	0.84
587	0.81
588	0.77
589	0.7
590	0.63
591	0.58
592	0.52
593	0.5
594	0.49
595	0.45
596	0.43
597	0.48
598	0.52
599	0.57
600	0.58
601	0.52
602	0.49
603	0.48
604	0.46
605	0.42
606	0.42
607	0.41
608	0.39
609	0.42
610	0.43
611	0.44
612	0.47
613	0.48
614	0.45
615	0.44
616	0.44
617	0.42
618	0.49
619	0.48
620	0.48
621	0.5
622	0.48
623	0.43
624	0.42
625	0.4
626	0.31
627	0.32
628	0.27
629	0.25
630	0.24
631	0.27
632	0.3
633	0.35
634	0.35
635	0.33
636	0.3
637	0.28
638	0.27
639	0.28
640	0.25
641	0.19
642	0.24
643	0.25
644	0.26
645	0.26
646	0.28
647	0.26
648	0.29
649	0.3
650	0.24
651	0.23
652	0.22
653	0.22
654	0.19
655	0.17
656	0.13
657	0.15
658	0.18
659	0.2
660	0.21
661	0.21
662	0.23
663	0.23
664	0.23
665	0.22
666	0.24
667	0.22
668	0.22
669	0.2
670	0.18
671	0.17
672	0.16
673	0.14
674	0.12
675	0.12
676	0.1
677	0.13
678	0.15
679	0.16
680	0.18
681	0.18
682	0.18
683	0.2
684	0.29
685	0.36
686	0.39
687	0.44
688	0.52
689	0.56
690	0.57
691	0.61
692	0.63
693	0.64
694	0.68
695	0.72
696	0.69
697	0.67
698	0.68
699	0.62
700	0.52
701	0.48
702	0.41
703	0.42
704	0.43
705	0.49
706	0.5
707	0.57
708	0.62
709	0.61
710	0.62
711	0.61
712	0.64
713	0.65
714	0.64
715	0.67

P41895

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer