Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40154

Protein Details
Accession P40154    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-60KSSRRTARRSVPKGVRTSKRBasic
239-259QLRRAENARKRKNLSEKRLEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-60RRTARRSVPKGVRTSKR
245-256NARKRKNLSEKR
267-276KLLKKRAGKS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029523  INO80B/Ies2  
IPR006880  INO80B_C  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG sce:YNL215W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04795  PAPA-1  
Amino Acid Sequences MDSEASDIEAELSDSVSAGGEEYIDDDDYTEDIDDQIVTAKSSRRTARRSVPKGVRTSKRIRDKELSVEVDEDYDEEEDVLSPSKKRHLHTRSMDKRQVAATASEKSDIGDSKGNDGEIEDGILEEEESLEKELNRGGGKEVEKSEESYYAQNDVGQKGEEEQDGESGGYEDNEPSISKESDELVSVVNGNGNEEDDEVEATKENTTDSTRSTTTRSKMLLDLLEDGGSKKKLTDEEIQLRRAENARKRKNLSEKRLEEEKQDTINKLLKKRAGKSRSHLPNDDEKNDGSSSFVKPRRPYNSEGMTRILRRYEEDLFCTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.06
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.06
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.12
27 0.17
28 0.21
29 0.28
30 0.36
31 0.41
32 0.46
33 0.54
34 0.62
35 0.69
36 0.71
37 0.74
38 0.76
39 0.75
40 0.79
41 0.81
42 0.78
43 0.75
44 0.78
45 0.77
46 0.79
47 0.76
48 0.74
49 0.72
50 0.68
51 0.68
52 0.66
53 0.6
54 0.5
55 0.46
56 0.38
57 0.31
58 0.27
59 0.19
60 0.12
61 0.09
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.12
71 0.2
72 0.25
73 0.28
74 0.38
75 0.42
76 0.51
77 0.6
78 0.69
79 0.72
80 0.77
81 0.79
82 0.7
83 0.65
84 0.56
85 0.48
86 0.38
87 0.32
88 0.25
89 0.23
90 0.22
91 0.21
92 0.19
93 0.17
94 0.18
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.17
100 0.18
101 0.17
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.09
106 0.09
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.15
126 0.16
127 0.18
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.2
132 0.2
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.12
196 0.15
197 0.16
198 0.18
199 0.22
200 0.26
201 0.27
202 0.31
203 0.3
204 0.28
205 0.28
206 0.3
207 0.26
208 0.22
209 0.21
210 0.17
211 0.16
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.13
219 0.15
220 0.2
221 0.26
222 0.32
223 0.41
224 0.46
225 0.48
226 0.46
227 0.45
228 0.43
229 0.41
230 0.41
231 0.4
232 0.46
233 0.53
234 0.61
235 0.65
236 0.72
237 0.78
238 0.8
239 0.81
240 0.8
241 0.76
242 0.74
243 0.77
244 0.69
245 0.63
246 0.58
247 0.52
248 0.47
249 0.46
250 0.4
251 0.37
252 0.42
253 0.42
254 0.43
255 0.45
256 0.46
257 0.5
258 0.57
259 0.63
260 0.65
261 0.68
262 0.69
263 0.73
264 0.77
265 0.76
266 0.72
267 0.67
268 0.69
269 0.68
270 0.64
271 0.56
272 0.46
273 0.42
274 0.38
275 0.33
276 0.25
277 0.21
278 0.24
279 0.31
280 0.35
281 0.39
282 0.44
283 0.53
284 0.6
285 0.62
286 0.63
287 0.63
288 0.67
289 0.66
290 0.64
291 0.6
292 0.58
293 0.56
294 0.54
295 0.48
296 0.4
297 0.37
298 0.4
299 0.42
300 0.4