FuNGI

P38128

Protein Details

Accession

P38128

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
86-115	GDYVKKPRVVLNERKRRRRRATVLQPASHS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-105	NERKRRRRR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033896 MADS_MEF2-like IPR002100 TF_MADSbox IPR036879 TF_MADSbox_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0008301 F:DNA binding, bending GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0000978 F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding GO:0043565 F:sequence-specific DNA binding GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	sce:YBR182C -
Pfam	View protein in Pfam PF00319 SRF-TF
PROSITE	View protein in PROSITE PS00350 MADS_BOX_1 PS50066 MADS_BOX_2
CDD	cd00265 MADS_MEF2_like

Amino Acid Sequences

MGRRKIEIEPIKDDRNRTVTFIKRKAGLFKKAHELSVLCQVDIAVIILGSNNTFYEYSSVDMSNLLNVHQNNTDLPHNIIEPSDYGDYVKKPRVVLNERKRRRRRATVLQPASHSGSCTVSSQDSSSVQNNGNLSAPLASNDAGNAGVSTPLVHCHGAISRSGSNHSDCARNSADYQMLQGGLNSGGSFHANDYKESVDQQHVANEAIHRNFMNKRIRPDTHLLLSESNHSNYHNFYPSPYENLPKPSLPASLVGNIPSFQSQFVQVIPANSNPMGKGFNGTGDSESFEAKQKIHPTVAISNTLEGPAPVQAMVHHLHQLNSNRGKLSGKPYLKLNIPKATNDACQRSPAMYSGTASPKTDVQATPNQMLASNMSSPLSRSKFLGFKNNDMDDLYHNGRCGSTYVNNKTFFLKPPIGRPPKFPKSPSSSIVVFPSSVASSTLKSTSSTNSPD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.58
3	0.53
4	0.5
5	0.53
6	0.53
7	0.6
8	0.64
9	0.62
10	0.6
11	0.62
12	0.67
13	0.67
14	0.67
15	0.63
16	0.61
17	0.66
18	0.63
19	0.61
20	0.54
21	0.47
22	0.39
23	0.43
24	0.38
25	0.28
26	0.25
27	0.24
28	0.2
29	0.19
30	0.16
31	0.06
32	0.05
33	0.05
34	0.05
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.08
40	0.08
41	0.09
42	0.11
43	0.11
44	0.13
45	0.14
46	0.15
47	0.13
48	0.14
49	0.13
50	0.14
51	0.13
52	0.12
53	0.15
54	0.15
55	0.18
56	0.18
57	0.19
58	0.17
59	0.2
60	0.23
61	0.19
62	0.21
63	0.19
64	0.18
65	0.18
66	0.17
67	0.15
68	0.13
69	0.15
70	0.14
71	0.12
72	0.13
73	0.16
74	0.19
75	0.24
76	0.29
77	0.28
78	0.29
79	0.33
80	0.42
81	0.48
82	0.56
83	0.61
84	0.66
85	0.73
86	0.83
87	0.88
88	0.89
89	0.9
90	0.9
91	0.88
92	0.88
93	0.9
94	0.9
95	0.89
96	0.81
97	0.74
98	0.66
99	0.6
100	0.49
101	0.39
102	0.28
103	0.22
104	0.19
105	0.18
106	0.16
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.15
111	0.15
112	0.17
113	0.18
114	0.2
115	0.19
116	0.21
117	0.21
118	0.2
119	0.19
120	0.16
121	0.14
122	0.12
123	0.11
124	0.09
125	0.1
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.07
131	0.06
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.09
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.15
147	0.15
148	0.16
149	0.18
150	0.19
151	0.18
152	0.21
153	0.22
154	0.22
155	0.2
156	0.25
157	0.24
158	0.23
159	0.22
160	0.21
161	0.21
162	0.17
163	0.17
164	0.13
165	0.12
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.05
177	0.12
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.15
182	0.15
183	0.15
184	0.17
185	0.13
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.13
190	0.13
191	0.13
192	0.13
193	0.15
194	0.13
195	0.14
196	0.12
197	0.14
198	0.16
199	0.23
200	0.3
201	0.3
202	0.36
203	0.42
204	0.43
205	0.45
206	0.48
207	0.44
208	0.37
209	0.36
210	0.31
211	0.25
212	0.24
213	0.23
214	0.2
215	0.18
216	0.15
217	0.14
218	0.14
219	0.15
220	0.17
221	0.15
222	0.14
223	0.13
224	0.18
225	0.18
226	0.23
227	0.22
228	0.23
229	0.22
230	0.26
231	0.28
232	0.22
233	0.23
234	0.19
235	0.19
236	0.17
237	0.17
238	0.14
239	0.14
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.12
244	0.11
245	0.11
246	0.1
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.12
256	0.12
257	0.13
258	0.13
259	0.13
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.1
264	0.11
265	0.09
266	0.1
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.11
271	0.12
272	0.11
273	0.12
274	0.11
275	0.13
276	0.14
277	0.14
278	0.18
279	0.21
280	0.23
281	0.23
282	0.24
283	0.23
284	0.27
285	0.29
286	0.28
287	0.24
288	0.22
289	0.21
290	0.2
291	0.17
292	0.11
293	0.1
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.08
300	0.1
301	0.11
302	0.14
303	0.14
304	0.15
305	0.21
306	0.25
307	0.31
308	0.35
309	0.36
310	0.32
311	0.33
312	0.35
313	0.33
314	0.36
315	0.37
316	0.35
317	0.35
318	0.38
319	0.41
320	0.46
321	0.49
322	0.48
323	0.46
324	0.45
325	0.44
326	0.46
327	0.44
328	0.43
329	0.42
330	0.41
331	0.35
332	0.35
333	0.35
334	0.31
335	0.29
336	0.25
337	0.22
338	0.17
339	0.18
340	0.2
341	0.25
342	0.26
343	0.25
344	0.25
345	0.24
346	0.24
347	0.27
348	0.22
349	0.22
350	0.28
351	0.32
352	0.32
353	0.32
354	0.3
355	0.27
356	0.26
357	0.23
358	0.18
359	0.15
360	0.14
361	0.13
362	0.13
363	0.14
364	0.22
365	0.23
366	0.22
367	0.23
368	0.27
369	0.32
370	0.36
371	0.45
372	0.41
373	0.45
374	0.52
375	0.51
376	0.47
377	0.42
378	0.4
379	0.32
380	0.34
381	0.31
382	0.25
383	0.24
384	0.23
385	0.22
386	0.21
387	0.19
388	0.19
389	0.22
390	0.31
391	0.4
392	0.46
393	0.48
394	0.48
395	0.51
396	0.49
397	0.47
398	0.45
399	0.45
400	0.41
401	0.48
402	0.58
403	0.64
404	0.62
405	0.66
406	0.68
407	0.7
408	0.75
409	0.7
410	0.68
411	0.67
412	0.72
413	0.66
414	0.61
415	0.53
416	0.48
417	0.48
418	0.4
419	0.31
420	0.25
421	0.24
422	0.19
423	0.17
424	0.17
425	0.15
426	0.14
427	0.17
428	0.19
429	0.17
430	0.18
431	0.2
432	0.23

P38128

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer