Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P28320

Protein Details
Accession P28320    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-267FNPTSTKGKIQKKSSVRTNPLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0030620  F:U2 snRNA binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG sce:YKL095W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKAINKYYPPDYNPLEAEKLSRKMAKKLKTMNKSHASIRLMTPFSMRCLECNEYIPKSRKFNGKKELLKEKYLDSIKIYRLTISCPRCANSIAFRTDPGNSDYVMEVGGVRNYVPQKPNDDLNAKTAVESIDETLQRLVREKEMEQNEKMGIKEQADDKMDLLEKRLAKIQQEQEDDEELENLRKKNLEMSQRAEMINRSKHAQQEKAVTTDDLDNLVDQVFDNHRQRTNKPGNNNDEKRTPLFNPTSTKGKIQKKSSVRTNPLGIVIKRGKSLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.52
3 0.46
4 0.45
5 0.4
6 0.34
7 0.36
8 0.35
9 0.35
10 0.37
11 0.41
12 0.4
13 0.47
14 0.55
15 0.58
16 0.61
17 0.67
18 0.72
19 0.76
20 0.8
21 0.8
22 0.79
23 0.74
24 0.69
25 0.66
26 0.59
27 0.52
28 0.48
29 0.45
30 0.38
31 0.35
32 0.35
33 0.28
34 0.29
35 0.31
36 0.28
37 0.22
38 0.26
39 0.29
40 0.27
41 0.31
42 0.33
43 0.32
44 0.39
45 0.45
46 0.45
47 0.47
48 0.51
49 0.57
50 0.6
51 0.65
52 0.67
53 0.7
54 0.71
55 0.73
56 0.78
57 0.72
58 0.68
59 0.61
60 0.53
61 0.51
62 0.46
63 0.39
64 0.32
65 0.32
66 0.32
67 0.34
68 0.32
69 0.26
70 0.25
71 0.28
72 0.33
73 0.31
74 0.33
75 0.31
76 0.32
77 0.31
78 0.32
79 0.3
80 0.28
81 0.3
82 0.29
83 0.27
84 0.27
85 0.27
86 0.26
87 0.25
88 0.21
89 0.16
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.08
102 0.1
103 0.13
104 0.16
105 0.17
106 0.21
107 0.23
108 0.25
109 0.26
110 0.28
111 0.25
112 0.25
113 0.26
114 0.22
115 0.2
116 0.18
117 0.14
118 0.12
119 0.11
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.14
131 0.14
132 0.21
133 0.26
134 0.29
135 0.27
136 0.28
137 0.27
138 0.26
139 0.25
140 0.2
141 0.16
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.17
146 0.17
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.18
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.16
155 0.17
156 0.21
157 0.2
158 0.21
159 0.28
160 0.32
161 0.35
162 0.37
163 0.37
164 0.35
165 0.35
166 0.34
167 0.26
168 0.2
169 0.14
170 0.15
171 0.17
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.21
177 0.27
178 0.32
179 0.33
180 0.38
181 0.42
182 0.43
183 0.43
184 0.38
185 0.35
186 0.33
187 0.33
188 0.3
189 0.28
190 0.29
191 0.35
192 0.4
193 0.42
194 0.39
195 0.43
196 0.44
197 0.43
198 0.42
199 0.35
200 0.3
201 0.27
202 0.24
203 0.16
204 0.14
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.06
210 0.09
211 0.11
212 0.18
213 0.23
214 0.27
215 0.33
216 0.37
217 0.4
218 0.48
219 0.55
220 0.55
221 0.6
222 0.66
223 0.69
224 0.76
225 0.8
226 0.74
227 0.68
228 0.66
229 0.6
230 0.55
231 0.48
232 0.46
233 0.45
234 0.45
235 0.47
236 0.47
237 0.51
238 0.48
239 0.54
240 0.54
241 0.59
242 0.63
243 0.63
244 0.69
245 0.7
246 0.78
247 0.8
248 0.82
249 0.79
250 0.77
251 0.74
252 0.67
253 0.64
254 0.63
255 0.52
256 0.51
257 0.5
258 0.46