FuNGI

Q07845

Protein Details

Accession

Q07845

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
605-628	ATFERRKKLEHVWKVRKNVMRRGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
618-622	KVRKN

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0090730 C:Las1 complex GO:0030874 C:nucleolar chromatin GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0000448 P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0016310 P:phosphorylation GO:0006396 P:RNA processing GO:0006364 P:rRNA processing GO:0006363 P:termination of RNA polymerase I transcription
KEGG	sce:YLL035W -
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MVIDSKQDLPQYTKDSGSESDSDSSNNFIVESPSIPSSKSATVVLNSEEYEDDEGDDLNGLDAELIDNITYEGDEDETMFVGLKEKQKLHLSGVFRLQVVKGGIVYNNVHYNASREILTFWHPLSQSIPTIDFSHFAGWQDTFFMPRNNRFKIRDEEFKSFPCVLRVFNSNHTGLLEAGHLYRDVNYLWKPKEPYFPLNERTTYHLLHESDRIQSLSVPGYWSTPLEKLYLSHKNAAYDTRIMVIGGKNSGKSTFLRLLLEKFTQDIRDSTTSQEELVYLDLDPGQPEYSLPDSISLNKILSSPISLGQHLCQGSNFQTLLQFYAGSSSPQDEPTSYLNCADKLIDHLEEQAFFGTSLLNLPGWIKGFGMQILNHIIRKYKPTHLLFLETANSKRHLDELTIPQSFSTSLRDAYAPEVVRVPAHSLNHTLSSRFHASQLRTFKILALFHKITQFDYDFAPLLKSAPLQISYGKGKSGIKGIQFPMEFQDLNPQDIKSALEGTVIGIYTYSGEDSLEVKSLNTFPILQSCTSSSKNFITLGLIHSIDTSQQIMNIYVPPCHTQILDKQPEDAQWIIVRNKTETPFCDFLPSPRTITWDDNIQIPFATFERRKKLEHVWKVRKNVMRRGQFMKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.35
3	0.34
4	0.34
5	0.3
6	0.27
7	0.27
8	0.25
9	0.26
10	0.23
11	0.23
12	0.19
13	0.17
14	0.14
15	0.12
16	0.14
17	0.14
18	0.15
19	0.15
20	0.17
21	0.18
22	0.18
23	0.19
24	0.21
25	0.21
26	0.22
27	0.21
28	0.21
29	0.23
30	0.25
31	0.25
32	0.23
33	0.21
34	0.21
35	0.18
36	0.17
37	0.17
38	0.15
39	0.13
40	0.12
41	0.12
42	0.1
43	0.1
44	0.09
45	0.07
46	0.06
47	0.05
48	0.05
49	0.05
50	0.05
51	0.05
52	0.05
53	0.05
54	0.05
55	0.05
56	0.05
57	0.05
58	0.05
59	0.06
60	0.06
61	0.06
62	0.07
63	0.07
64	0.08
65	0.08
66	0.08
67	0.07
68	0.09
69	0.14
70	0.19
71	0.25
72	0.26
73	0.33
74	0.39
75	0.41
76	0.44
77	0.46
78	0.43
79	0.42
80	0.47
81	0.43
82	0.37
83	0.36
84	0.3
85	0.28
86	0.25
87	0.2
88	0.15
89	0.15
90	0.16
91	0.18
92	0.19
93	0.17
94	0.2
95	0.21
96	0.2
97	0.19
98	0.21
99	0.2
100	0.2
101	0.18
102	0.14
103	0.15
104	0.16
105	0.2
106	0.19
107	0.17
108	0.21
109	0.2
110	0.21
111	0.22
112	0.23
113	0.2
114	0.2
115	0.21
116	0.18
117	0.2
118	0.2
119	0.18
120	0.16
121	0.17
122	0.16
123	0.15
124	0.15
125	0.13
126	0.13
127	0.15
128	0.14
129	0.15
130	0.16
131	0.22
132	0.25
133	0.34
134	0.41
135	0.44
136	0.51
137	0.52
138	0.56
139	0.59
140	0.59
141	0.61
142	0.59
143	0.59
144	0.56
145	0.54
146	0.53
147	0.46
148	0.41
149	0.35
150	0.29
151	0.25
152	0.25
153	0.28
154	0.26
155	0.3
156	0.33
157	0.29
158	0.28
159	0.27
160	0.24
161	0.2
162	0.17
163	0.12
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.11
173	0.15
174	0.22
175	0.24
176	0.28
177	0.32
178	0.34
179	0.43
180	0.44
181	0.46
182	0.46
183	0.5
184	0.51
185	0.51
186	0.49
187	0.42
188	0.42
189	0.4
190	0.33
191	0.29
192	0.29
193	0.26
194	0.26
195	0.29
196	0.24
197	0.23
198	0.23
199	0.21
200	0.16
201	0.15
202	0.15
203	0.13
204	0.12
205	0.11
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.12
216	0.18
217	0.26
218	0.26
219	0.3
220	0.31
221	0.31
222	0.32
223	0.33
224	0.29
225	0.22
226	0.2
227	0.15
228	0.14
229	0.12
230	0.13
231	0.12
232	0.11
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.13
238	0.13
239	0.12
240	0.16
241	0.18
242	0.19
243	0.2
244	0.21
245	0.23
246	0.24
247	0.24
248	0.19
249	0.16
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.13
254	0.14
255	0.17
256	0.17
257	0.18
258	0.19
259	0.18
260	0.17
261	0.17
262	0.12
263	0.1
264	0.09
265	0.08
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.07
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.11
282	0.13
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.11
296	0.15
297	0.14
298	0.13
299	0.1
300	0.11
301	0.12
302	0.14
303	0.13
304	0.09
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.1
309	0.09
310	0.06
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.11
321	0.13
322	0.15
323	0.14
324	0.15
325	0.15
326	0.15
327	0.15
328	0.12
329	0.1
330	0.1
331	0.12
332	0.1
333	0.1
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.05
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.1
358	0.11
359	0.14
360	0.16
361	0.15
362	0.15
363	0.16
364	0.16
365	0.21
366	0.23
367	0.25
368	0.33
369	0.34
370	0.39
371	0.39
372	0.42
373	0.37
374	0.35
375	0.32
376	0.25
377	0.25
378	0.21
379	0.22
380	0.19
381	0.18
382	0.19
383	0.16
384	0.16
385	0.2
386	0.25
387	0.29
388	0.28
389	0.28
390	0.26
391	0.25
392	0.24
393	0.19
394	0.16
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.13
399	0.14
400	0.15
401	0.19
402	0.15
403	0.14
404	0.15
405	0.14
406	0.14
407	0.14
408	0.16
409	0.15
410	0.16
411	0.16
412	0.17
413	0.19
414	0.23
415	0.23
416	0.21
417	0.18
418	0.22
419	0.25
420	0.23
421	0.26
422	0.26
423	0.29
424	0.35
425	0.4
426	0.38
427	0.35
428	0.34
429	0.33
430	0.31
431	0.32
432	0.27
433	0.28
434	0.28
435	0.28
436	0.31
437	0.3
438	0.26
439	0.27
440	0.26
441	0.18
442	0.18
443	0.18
444	0.15
445	0.14
446	0.14
447	0.11
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.1
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.14
456	0.17
457	0.21
458	0.21
459	0.2
460	0.21
461	0.21
462	0.22
463	0.27
464	0.26
465	0.25
466	0.3
467	0.31
468	0.34
469	0.33
470	0.31
471	0.29
472	0.28
473	0.25
474	0.19
475	0.28
476	0.23
477	0.25
478	0.26
479	0.23
480	0.2
481	0.21
482	0.21
483	0.13
484	0.13
485	0.11
486	0.1
487	0.1
488	0.1
489	0.11
490	0.1
491	0.08
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.07
501	0.08
502	0.09
503	0.09
504	0.09
505	0.11
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.11
511	0.18
512	0.2
513	0.18
514	0.19
515	0.21
516	0.25
517	0.28
518	0.28
519	0.26
520	0.26
521	0.28
522	0.27
523	0.24
524	0.22
525	0.21
526	0.21
527	0.21
528	0.19
529	0.16
530	0.16
531	0.15
532	0.13
533	0.13
534	0.13
535	0.09
536	0.11
537	0.12
538	0.12
539	0.14
540	0.17
541	0.17
542	0.17
543	0.19
544	0.21
545	0.21
546	0.22
547	0.21
548	0.2
549	0.28
550	0.37
551	0.43
552	0.41
553	0.42
554	0.42
555	0.43
556	0.43
557	0.35
558	0.27
559	0.22
560	0.27
561	0.28
562	0.3
563	0.3
564	0.29
565	0.34
566	0.36
567	0.38
568	0.35
569	0.4
570	0.39
571	0.37
572	0.41
573	0.36
574	0.37
575	0.38
576	0.38
577	0.33
578	0.32
579	0.36
580	0.33
581	0.36
582	0.34
583	0.36
584	0.34
585	0.36
586	0.36
587	0.32
588	0.28
589	0.24
590	0.23
591	0.17
592	0.25
593	0.25
594	0.33
595	0.42
596	0.45
597	0.48
598	0.53
599	0.63
600	0.64
601	0.69
602	0.73
603	0.75
604	0.79
605	0.84
606	0.87
607	0.84
608	0.81
609	0.81
610	0.79
611	0.78
612	0.76

Q07845

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer